63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0282 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  94.74 
 
 		 662 aa  1262    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  75.08 
 
 		 651 aa  1001    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  99.85 
 
 		 648 aa  1328    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  100 
 
 		 648 aa  1330    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  73.63 
 
 		 672 aa  969    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  47.55 
 
 		 649 aa  599  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  46.2 
 
 		 652 aa  585  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  45.4 
 
 		 652 aa  566  1e-160  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  46.08 
 
 		 654 aa  567  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  40.13 
 
 		 660 aa  482  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  40.45 
 
 		 672 aa  480  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  40.13 
 
 		 660 aa  482  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  40.57 
 
 		 659 aa  478  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  39.03 
 
 		 653 aa  473  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  40.19 
 
 		 658 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  42.93 
 
 		 675 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  38.15 
 
 		 655 aa  450  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  38.88 
 
 		 659 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  39.9 
 
 		 709 aa  418  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  36.35 
 
 		 648 aa  394  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  32.74 
 
 		 660 aa  350  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  34.29 
 
 		 655 aa  340  5e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  34.12 
 
 		 655 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  29.86 
 
 		 659 aa  296  9e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  29.86 
 
 		 659 aa  296  9e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  29.7 
 
 		 654 aa  295  2e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  25.68 
 
 		 614 aa  80.5  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  26.09 
 
 		 614 aa  72  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  26.09 
 
 		 614 aa  72  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  24.32 
 
 		 588 aa  70.5  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  26.11 
 
 		 506 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  23.19 
 
 		 620 aa  62.4  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  24.82 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  24.07 
 
 		 666 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  22.83 
 
 		 605 aa  57.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0251  hypothetical protein  25.66 
 
 		 819 aa  57  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0811563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4205  hypothetical protein  24.03 
 
 		 809 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4244  GTPase (dynamin-related)-like protein  24.03 
 
 		 809 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000109098  hitchhiker  0.00000166794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  20.95 
 
 		 693 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  21.67 
 
 		 444 aa  53.9  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  32.39 
 
 		 583 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  37.8 
 
 		 548 aa  50.8  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4018  hypothetical protein  22.74 
 
 		 814 aa  50.8  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  27.63 
 
 		 585 aa  50.4  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  22.22 
 
 		 674 aa  50.4  0.00009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3460  hypothetical protein  30.1 
 
 		 659 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  25.98 
 
 		 603 aa  48.9  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  25.73 
 
 		 569 aa  48.9  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3239  hypothetical protein  31.11 
 
 		 669 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.983308  normal  0.678486 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  31.65 
 
 		 585 aa  48.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  32.37 
 
 		 546 aa  48.1  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  26.99 
 
 		 686 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  32.85 
 
 		 632 aa  47.8  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3727  hypothetical protein  30.28 
 
 		 764 aa  47.4  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  22.34 
 
 		 605 aa  46.6  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  29.67 
 
 		 692 aa  46.6  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  23.91 
 
 		 551 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  22.51 
 
 		 615 aa  45.4  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  22.09 
 
 		 390 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  24.79 
 
 		 569 aa  45.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  31.61 
 
 		 585 aa  43.9  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  25.13 
 
 		 605 aa  43.9  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4145  hypothetical protein  31.31 
 
 		 690 aa  43.9  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.487831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>