64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0900 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  75.08 
 
 		 653 aa  991    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  64.3 
 
 		 658 aa  820    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  100 
 
 		 660 aa  1331    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  58.93 
 
 		 655 aa  775    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  99.85 
 
 		 660 aa  1328    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  64.81 
 
 		 672 aa  860    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  63.17 
 
 		 659 aa  810    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  65.72 
 
 		 659 aa  843    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  49.2 
 
 		 675 aa  586  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  46.89 
 
 		 709 aa  555  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  41.73 
 
 		 651 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  41.55 
 
 		 672 aa  489  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  42.35 
 
 		 649 aa  492  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  39.28 
 
 		 662 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  40.13 
 
 		 648 aa  482  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  40.71 
 
 		 654 aa  476  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  40.13 
 
 		 648 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  39.19 
 
 		 652 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  40.36 
 
 		 652 aa  461  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  35.52 
 
 		 648 aa  360  4e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  43.34 
 
 		 655 aa  317  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  43.34 
 
 		 655 aa  316  9e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  34.26 
 
 		 660 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  31.08 
 
 		 654 aa  308  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  30.19 
 
 		 659 aa  289  9e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  30.19 
 
 		 659 aa  289  9e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  25.68 
 
 		 614 aa  82  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  22.47 
 
 		 614 aa  74.7  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  22.47 
 
 		 614 aa  74.7  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  24.85 
 
 		 605 aa  68.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  21.78 
 
 		 588 aa  67.8  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  23.44 
 
 		 506 aa  63.9  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  22.14 
 
 		 719 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  23.32 
 
 		 655 aa  55.1  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  31.5 
 
 		 666 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  26.67 
 
 		 686 aa  54.3  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  22.09 
 
 		 444 aa  53.9  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  26.52 
 
 		 585 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  27.43 
 
 		 620 aa  52.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  35.17 
 
 		 583 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  22.73 
 
 		 952 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  33.33 
 
 		 548 aa  50.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  28.42 
 
 		 602 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  27.74 
 
 		 693 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  21.93 
 
 		 390 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0969  Dynamin family protein  26.6 
 
 		 648 aa  49.3  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  31.06 
 
 		 546 aa  48.5  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  26.91 
 
 		 603 aa  48.1  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  31.58 
 
 		 632 aa  47.8  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4018  hypothetical protein  25.81 
 
 		 814 aa  47.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  28.31 
 
 		 640 aa  47  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  30.34 
 
 		 585 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  28.57 
 
 		 589 aa  46.2  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  28.74 
 
 		 407 aa  46.6  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  24.65 
 
 		 692 aa  45.4  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36820  hypothetical protein  24.64 
 
 		 624 aa  45.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0556  GTP-binding protein HSR1-related  33.79 
 
 		 602 aa  45.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0329351  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  27.06 
 
 		 608 aa  45.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3460  hypothetical protein  27.49 
 
 		 659 aa  44.3  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  32.43 
 
 		 587 aa  44.3  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  27.11 
 
 		 585 aa  44.3  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  37.5 
 
 		 619 aa  43.9  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  37.5 
 
 		 619 aa  43.9  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  37.5 
 
 		 619 aa  43.9  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>