62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_05110 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  99.08 
 
 		 655 aa  1309    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  76.23 
 
 		 660 aa  1009    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  100 
 
 		 655 aa  1318    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  45.68 
 
 		 654 aa  573  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  36.75 
 
 		 652 aa  391  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  38.54 
 
 		 648 aa  368  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  35.79 
 
 		 652 aa  368  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  35.93 
 
 		 654 aa  356  5.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  34.37 
 
 		 662 aa  343  4e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  33.71 
 
 		 651 aa  340  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  34.27 
 
 		 649 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  34.12 
 
 		 648 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  34.29 
 
 		 648 aa  330  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  32.9 
 
 		 672 aa  330  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  37 
 
 		 659 aa  325  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  34.93 
 
 		 659 aa  317  6e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  43.34 
 
 		 660 aa  316  8e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  43.34 
 
 		 660 aa  316  9e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  44.65 
 
 		 658 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  43.46 
 
 		 653 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  34.34 
 
 		 672 aa  306  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  34.13 
 
 		 655 aa  295  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  35.41 
 
 		 675 aa  282  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  35.24 
 
 		 709 aa  274  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  31.42 
 
 		 659 aa  270  8e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  31.42 
 
 		 659 aa  270  8e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  28.24 
 
 		 614 aa  85.9  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  25 
 
 		 605 aa  77  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  29.41 
 
 		 506 aa  75.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  23.62 
 
 		 614 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  23.62 
 
 		 614 aa  72.4  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  24.84 
 
 		 588 aa  71.2  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  36.36 
 
 		 632 aa  58.2  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  23.63 
 
 		 952 aa  57.4  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  21.45 
 
 		 444 aa  57  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  29.95 
 
 		 548 aa  55.5  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  27.7 
 
 		 407 aa  55.5  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  31.94 
 
 		 583 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  23.1 
 
 		 1249 aa  53.5  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  22.22 
 
 		 1219 aa  52  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1219 aa  52  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1219 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1219 aa  52  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  24.03 
 
 		 693 aa  52  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1219 aa  52  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  27.91 
 
 		 666 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  22.22 
 
 		 1219 aa  52  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1219 aa  52  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  22.22 
 
 		 1219 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1219 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4018  hypothetical protein  25.8 
 
 		 814 aa  50.4  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  26.85 
 
 		 692 aa  48.5  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  24.07 
 
 		 620 aa  48.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  28.12 
 
 		 585 aa  47.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  33.86 
 
 		 587 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  22.49 
 
 		 1228 aa  47  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0251  hypothetical protein  32.38 
 
 		 819 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0811563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  34.68 
 
 		 546 aa  45.8  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  21.63 
 
 		 719 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  30.61 
 
 		 585 aa  45.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  32.52 
 
 		 589 aa  44.7  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  33.33 
 
 		 523 aa  43.9  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>