83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0700 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3622  hypothetical protein  53.62 
 
 
654 aa  705    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.300251  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  100 
 
 
652 aa  1339    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3725  hypothetical protein  56.87 
 
 
649 aa  725    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.24696 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0382  hypothetical protein  51.94 
 
 
652 aa  673    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874173  normal  0.0118752 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0347  hypothetical protein  47 
 
 
651 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512067  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0400  hypothetical protein  46.52 
 
 
662 aa  600  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0733804  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  46.2 
 
 
648 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0255  hypothetical protein  46.37 
 
 
648 aa  588  1e-167  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142183  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0294  hypothetical protein  46.53 
 
 
672 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0829  hypothetical protein  39.19 
 
 
660 aa  476  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0612198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0900  hypothetical protein  39.19 
 
 
660 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.347456  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1298  hypothetical protein  39.72 
 
 
659 aa  478  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594857  normal  0.225568 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3605  hypothetical protein  38.61 
 
 
653 aa  464  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169107  normal  0.037636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5428  hypothetical protein  37.4 
 
 
672 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.832093 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0904  hypothetical protein  38.92 
 
 
658 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1655  hypothetical protein  40.49 
 
 
659 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.92413  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2415  hypothetical protein  38.24 
 
 
648 aa  431  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0829723  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4340  hypothetical protein  37.7 
 
 
655 aa  431  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0246276  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4154  GTPase (dynamin-related)-like protein  37.6 
 
 
660 aa  427  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.67903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0490  hypothetical protein  36.31 
 
 
655 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3234  hypothetical protein  37.42 
 
 
675 aa  404  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220852  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05110  hypothetical protein  36.75 
 
 
655 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3493  hypothetical protein  38.02 
 
 
709 aa  398  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000901673 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0533  GTPase (dynamin-related)  36.63 
 
 
654 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2377  hypothetical protein  31.77 
 
 
659 aa  327  5e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0503347 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2756  hypothetical protein  31.77 
 
 
659 aa  327  5e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  26.96 
 
 
588 aa  84.3  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  24.04 
 
 
605 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  25.56 
 
 
614 aa  82  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  24.12 
 
 
614 aa  79  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  24.12 
 
 
614 aa  79  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2196  dynamin family protein  29.15 
 
 
506 aa  79  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000046764 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  22.32 
 
 
693 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  30.32 
 
 
602 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  22.05 
 
 
444 aa  68.6  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  30.7 
 
 
585 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  21.41 
 
 
789 aa  63.2  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  32.49 
 
 
583 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  24.31 
 
 
952 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  22.52 
 
 
1219 aa  58.9  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  34.72 
 
 
585 aa  58.9  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  26.73 
 
 
666 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  22.52 
 
 
1219 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  22.52 
 
 
1219 aa  58.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  22.52 
 
 
1219 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  22.52 
 
 
1219 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  22.52 
 
 
1219 aa  58.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  22.52 
 
 
1219 aa  58.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  22.14 
 
 
1219 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  23.17 
 
 
620 aa  57.8  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3084  hypothetical protein  24.36 
 
 
627 aa  57  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  22.89 
 
 
1219 aa  57  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  22.14 
 
 
1219 aa  57  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  41.18 
 
 
548 aa  56.2  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  22.14 
 
 
1219 aa  55.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  25 
 
 
407 aa  53.5  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  30.52 
 
 
585 aa  53.9  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  34.11 
 
 
632 aa  53.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  23.19 
 
 
719 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10347  isoniazid inductible gene protein iniA  27.23 
 
 
640 aa  52  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0434  hypothetical protein  25.53 
 
 
619 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827508  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  24.62 
 
 
655 aa  51.6  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0457  hypothetical protein  25.53 
 
 
619 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.374169  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0447  hypothetical protein  25.53 
 
 
619 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276019  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  27.56 
 
 
589 aa  50.8  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  36.89 
 
 
564 aa  50.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3138  hypothetical protein  22.65 
 
 
788 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0143921  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  20.9 
 
 
1228 aa  48.9  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  41.59 
 
 
546 aa  48.9  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  29.65 
 
 
608 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  24.78 
 
 
569 aa  48.5  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  22.82 
 
 
686 aa  48.9  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  22.3 
 
 
712 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  22.3 
 
 
712 aa  48.5  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  21.56 
 
 
390 aa  47.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2971  hypothetical protein  27.38 
 
 
788 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.816575  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  20.94 
 
 
1249 aa  46.6  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  24.34 
 
 
569 aa  45.4  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  23.76 
 
 
603 aa  45.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0251  hypothetical protein  31.76 
 
 
819 aa  45.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0811563  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  32.03 
 
 
587 aa  44.3  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  23.67 
 
 
674 aa  44.3  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  24.37 
 
 
569 aa  43.9  0.01  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>