93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1545 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  100 
 
 
569 aa  1126    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  95.08 
 
 
569 aa  1065    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  96.13 
 
 
569 aa  1082    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  57.6 
 
 
605 aa  620  1e-176  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  37.45 
 
 
615 aa  332  2e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  36.33 
 
 
599 aa  302  1e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  34.16 
 
 
601 aa  270  5e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  31.66 
 
 
674 aa  267  4e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  34.21 
 
 
610 aa  250  5e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  28.7 
 
 
1164 aa  104  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  33.16 
 
 
679 aa  84  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  39.67 
 
 
664 aa  79.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  30.96 
 
 
587 aa  76.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  30.05 
 
 
620 aa  73.9  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  28.65 
 
 
444 aa  72  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  26.47 
 
 
588 aa  71.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  32.96 
 
 
407 aa  71.6  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  31.71 
 
 
605 aa  70.1  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5313  hypothetical protein  30.66 
 
 
743 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  28.18 
 
 
614 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  28.18 
 
 
614 aa  69.3  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  28.51 
 
 
548 aa  68.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  28.89 
 
 
589 aa  67.8  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  33.83 
 
 
524 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  30.36 
 
 
741 aa  65.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  28.26 
 
 
614 aa  64.7  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  25.89 
 
 
537 aa  64.7  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  30.89 
 
 
692 aa  63.9  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  29.44 
 
 
655 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  33.33 
 
 
570 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  25.24 
 
 
496 aa  61.2  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  28.99 
 
 
533 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  25.67 
 
 
564 aa  60.5  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  25.59 
 
 
546 aa  60.1  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  25.29 
 
 
585 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  35.24 
 
 
587 aa  57.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  30 
 
 
605 aa  57  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  24.34 
 
 
789 aa  56.6  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  28.23 
 
 
551 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0437  GTP-binding protein  29.38 
 
 
692 aa  56.6  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  26.56 
 
 
693 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3339  transcriptional regulator, XRE family  29.66 
 
 
733 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  28.83 
 
 
603 aa  55.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  23.44 
 
 
585 aa  55.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3725  hypothetical protein  29.34 
 
 
569 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.491681  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  22.29 
 
 
585 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  26.52 
 
 
610 aa  54.3  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  29.55 
 
 
610 aa  53.9  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  31.31 
 
 
666 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  32.73 
 
 
1146 aa  53.9  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  32.73 
 
 
1146 aa  53.9  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3459  hypothetical protein  29.27 
 
 
568 aa  53.5  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0403  dynamin family protein  26.63 
 
 
693 aa  53.9  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  27.92 
 
 
390 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  30.69 
 
 
583 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  33.33 
 
 
1145 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0922  hypothetical protein  28.28 
 
 
766 aa  51.2  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229589 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  26.73 
 
 
741 aa  51.2  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  30.25 
 
 
1219 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  30.25 
 
 
1219 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  30.25 
 
 
1219 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  30.25 
 
 
1219 aa  51.2  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  30.25 
 
 
1219 aa  51.2  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  30.25 
 
 
1219 aa  51.2  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6055  hypothetical protein  25.4 
 
 
696 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  27.1 
 
 
719 aa  50.4  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  31.07 
 
 
976 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  29.73 
 
 
1219 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0435  GTP-binding protein  24.57 
 
 
728 aa  49.3  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  31.5 
 
 
712 aa  49.3  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  31.5 
 
 
712 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1494  dynamin family protein  29.41 
 
 
1219 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.248245  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  31.86 
 
 
1219 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  31.86 
 
 
1219 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0374  hypothetical protein  23.98 
 
 
621 aa  48.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1306  dynamin family protein  30.58 
 
 
1219 aa  48.5  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.604786  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0373  hypothetical protein  34.83 
 
 
737 aa  48.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0460  GTP-binding protein  24.28 
 
 
728 aa  47.4  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.839985  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  24.79 
 
 
523 aa  47.4  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1546  GTP-binding protein  23.99 
 
 
728 aa  47.4  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  29.37 
 
 
602 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  30 
 
 
632 aa  47.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  24.4 
 
 
497 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  27.03 
 
 
1228 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0143  transcriptional regulator, XRE family  43.9 
 
 
825 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.514651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6054  hypothetical protein  36.51 
 
 
747 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0700  hypothetical protein  24.34 
 
 
652 aa  45.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.471001  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1225  hypothetical protein  42.86 
 
 
793 aa  45.4  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.640343  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0282  hypothetical protein  24.79 
 
 
648 aa  45.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  28.23 
 
 
1249 aa  45.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39100  GTPase of unknown function  25 
 
 
617 aa  44.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.0000974304  normal  0.356305 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3242  hypothetical protein  28.31 
 
 
377 aa  44.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.202403 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  26.28 
 
 
608 aa  44.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>