53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_7006 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  73.68 
 
 		 536 aa  681    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  100 
 
 		 497 aa  974    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  44.83 
 
 		 503 aa  378  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  35.92 
 
 		 496 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  33.91 
 
 		 610 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1638  GTP-binding protein HSR1-related  34.73 
 
 		 501 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  34.97 
 
 		 501 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481236  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  32.76 
 
 		 493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  30.17 
 
 		 533 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3806  GTP-binding protein, HSR1-related  33.99 
 
 		 527 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  31.8 
 
 		 496 aa  123  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  33.24 
 
 		 502 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  33.24 
 
 		 502 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  33.24 
 
 		 502 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0272  isoniazid inductible gene protein IniC  32.76 
 
 		 468 aa  113  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  28.08 
 
 		 524 aa  106  9e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  31.17 
 
 		 601 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36810  hypothetical protein  29.98 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.163741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0555  hypothetical protein  29.94 
 
 		 478 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0965162  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  32.28 
 
 		 1164 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  25 
 
 		 674 aa  69.7  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  28.57 
 
 		 444 aa  65.5  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  26.16 
 
 		 693 aa  63.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  30 
 
 		 610 aa  63.5  0.000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  27.4 
 
 		 615 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  32.69 
 
 		 976 aa  60.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  34.75 
 
 		 599 aa  60.5  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  29.57 
 
 		 620 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  31.39 
 
 		 570 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  25.71 
 
 		 605 aa  55.1  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  28.08 
 
 		 666 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  31.78 
 
 		 679 aa  53.5  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  25.12 
 
 		 569 aa  53.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  33.33 
 
 		 614 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  33.33 
 
 		 614 aa  51.6  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  36.61 
 
 		 407 aa  51.2  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  24.64 
 
 		 569 aa  50.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  29.9 
 
 		 587 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  40.28 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  31.67 
 
 		 605 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  26.27 
 
 		 546 aa  48.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06897  transmembrane GTPase Fzo1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13392)  28.87 
 
 		 935 aa  48.1  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.456649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  33.33 
 
 		 603 aa  47.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3459  hypothetical protein  35.29 
 
 		 568 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3725  hypothetical protein  34.31 
 
 		 569 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.491681  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2227  hypothetical protein  57.5 
 
 		 888 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  25.35 
 
 		 569 aa  47  0.0009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  28.91 
 
 		 614 aa  46.2  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  27.89 
 
 		 664 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  31.45 
 
 		 605 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  31 
 
 		 537 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  28.57 
 
 		 588 aa  44.3  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  43.14 
 
 		 655 aa  43.5  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>