57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_39120 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  73.68 
 
 		 497 aa  676    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  100 
 
 		 536 aa  1060    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  42.72 
 
 		 503 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  34.12 
 
 		 610 aa  179  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1638  GTP-binding protein HSR1-related  33.83 
 
 		 501 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  34.66 
 
 		 501 aa  157  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481236  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  33.47 
 
 		 496 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  30.24 
 
 		 493 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  30.18 
 
 		 496 aa  127  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3806  GTP-binding protein, HSR1-related  33.2 
 
 		 527 aa  127  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0272  isoniazid inductible gene protein IniC  29.3 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  29.75 
 
 		 502 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  29.75 
 
 		 502 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  29.75 
 
 		 502 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  27.72 
 
 		 524 aa  115  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  26.13 
 
 		 533 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  32 
 
 		 601 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  30.07 
 
 		 674 aa  70.9  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  35.58 
 
 		 976 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  28.28 
 
 		 615 aa  63.5  0.000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36810  hypothetical protein  30.72 
 
 		 420 aa  63.5  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.163741 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  30.61 
 
 		 599 aa  61.6  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0555  hypothetical protein  31 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0965162  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  30.33 
 
 		 610 aa  61.2  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  36.61 
 
 		 1164 aa  59.7  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  39.68 
 
 		 693 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  33.06 
 
 		 679 aa  56.6  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  32.71 
 
 		 570 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  25.86 
 
 		 666 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  24.31 
 
 		 444 aa  54.3  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  33.91 
 
 		 407 aa  50.8  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  31.09 
 
 		 605 aa  50.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  30 
 
 		 537 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  28.45 
 
 		 614 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  28.45 
 
 		 614 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  29.36 
 
 		 620 aa  48.5  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  32.5 
 
 		 664 aa  48.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  32.46 
 
 		 603 aa  47  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  38.81 
 
 		 655 aa  47  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2227  hypothetical protein  46.81 
 
 		 888 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  28.83 
 
 		 626 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  39.29 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3459  hypothetical protein  31.67 
 
 		 568 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1219 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3725  hypothetical protein  30.83 
 
 		 569 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.491681  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  30.08 
 
 		 1219 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1219 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1219 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  28.36 
 
 		 1219 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1219 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  30.08 
 
 		 1219 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  28.36 
 
 		 1219 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  28.57 
 
 		 569 aa  44.3  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1219 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  31.58 
 
 		 605 aa  43.9  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  33.06 
 
 		 1249 aa  43.9  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  30.89 
 
 		 587 aa  43.5  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>