45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1653 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1638  GTP-binding protein HSR1-related  95.2 
 
 		 501 aa  941    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 501 aa  984    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481236  normal  0.975567 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  48.13 
 
 		 496 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3806  GTP-binding protein, HSR1-related  41.84 
 
 		 527 aa  319  6e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  40.77 
 
 		 493 aa  290  4e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0272  isoniazid inductible gene protein IniC  41.14 
 
 		 468 aa  277  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  40.37 
 
 		 502 aa  266  8e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  40.37 
 
 		 502 aa  266  8e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  39.34 
 
 		 496 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  40.37 
 
 		 502 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0555  hypothetical protein  38.76 
 
 		 478 aa  234  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0965162  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36810  hypothetical protein  34.56 
 
 		 420 aa  206  8e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.163741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  29.39 
 
 		 533 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  30.31 
 
 		 524 aa  171  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  34.97 
 
 		 497 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  33.11 
 
 		 503 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  33.8 
 
 		 610 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  35.92 
 
 		 536 aa  138  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  27.83 
 
 		 614 aa  60.1  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  29.41 
 
 		 610 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  31.33 
 
 		 693 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  30 
 
 		 674 aa  57.8  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  26.02 
 
 		 615 aa  57.8  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  33.33 
 
 		 679 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  29.32 
 
 		 605 aa  54.3  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  30.43 
 
 		 620 aa  54.3  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  28.12 
 
 		 601 aa  52  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  24.9 
 
 		 1164 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3729  hypothetical protein  31.69 
 
 		 626 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.731679  normal  0.057897 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  29.36 
 
 		 585 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  24.8 
 
 		 614 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  25.59 
 
 		 588 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  24.8 
 
 		 614 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  25.85 
 
 		 599 aa  48.5  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1896  Dynamin family protein  27.61 
 
 		 1228 aa  47.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00444431  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  23.29 
 
 		 666 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0624  hypothetical protein  32.93 
 
 		 602 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318926  normal  0.0782013 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1654  dynamin  27.53 
 
 		 686 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0311974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15631  GTPase SAR1 and related small G protein  51.16 
 
 		 440 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  35.04 
 
 		 407 aa  44.3  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9372  predicted protein  32.82 
 
 		 504 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3074  GTP-binding protein Era  41.18 
 
 		 298 aa  43.9  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1203  small GTP-binding protein  45.76 
 
 		 490 aa  43.9  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.996743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0273  hypothetical protein  33.8 
 
 		 608 aa  43.5  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  32.74 
 
 		 603 aa  43.5  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.964955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>