215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6880 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  100 
 
 
1164 aa  2254    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0398  Dynamin family protein  35.47 
 
 
674 aa  134  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2213  Dynamin family protein  36.19 
 
 
587 aa  128  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  38.6 
 
 
620 aa  127  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  39.53 
 
 
585 aa  127  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  30.43 
 
 
615 aa  126  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  39.05 
 
 
585 aa  124  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  34.02 
 
 
589 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2968  dynamin family protein  33.86 
 
 
583 aa  117  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0404  glucosamine fructose-6-phosphate aminotransferase (isomerizing)  31.82 
 
 
610 aa  114  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  33.02 
 
 
548 aa  114  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1439  Dynamin family protein  31.7 
 
 
546 aa  112  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.784928  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  32.2 
 
 
605 aa  112  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2106  dynamin  34.22 
 
 
564 aa  107  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.78205 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1545  GTP-binding protein  28.34 
 
 
569 aa  105  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  30.9 
 
 
632 aa  103  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0438  GTP-binding protein  30.29 
 
 
599 aa  102  6e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2994  dynamin family protein  28 
 
 
614 aa  101  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.214598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3036  dynamin family protein  28 
 
 
614 aa  101  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0241135  normal  0.688737 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  32.92 
 
 
585 aa  99.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2259  Dynamin family protein  28.78 
 
 
444 aa  99.8  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000551632  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0436  GTP-binding protein  28.25 
 
 
569 aa  98.6  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0461  GTP-binding protein  27.6 
 
 
569 aa  96.3  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  30 
 
 
407 aa  93.6  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0337  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  29.67 
 
 
605 aa  94  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0860  GTP-binding protein  28 
 
 
601 aa  92  6e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1350  dynamin  31.07 
 
 
693 aa  90.1  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0228271 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1095  dynamin  26.42 
 
 
588 aa  86.3  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.845511  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1193  hypothetical protein  29.61 
 
 
614 aa  85.1  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108086  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3083  putative GTPase of unknown function  29.82 
 
 
496 aa  82.4  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1653  GTP-binding protein, HSR1-related  27.75 
 
 
524 aa  80.9  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0754256  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0830  hypothetical protein  27.67 
 
 
712 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00896739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0815  GTPase  27.67 
 
 
712 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2424  Dynamin family protein  26.53 
 
 
666 aa  79.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3727  hypothetical protein  30.21 
 
 
503 aa  78.2  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0286482 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3240  hypothetical protein  33.14 
 
 
537 aa  72.4  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.41085  normal  0.440891 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1639  dynamin family protein  31.21 
 
 
605 aa  71.6  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.143429  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0372  hypothetical protein  31.28 
 
 
587 aa  71.6  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5963  hypothetical protein  37.27 
 
 
610 aa  71.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107791  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1654  dynamin family protein  31.21 
 
 
603 aa  71.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1510  GTP-binding protein HSR1-related  25.27 
 
 
523 aa  70.1  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  26.57 
 
 
976 aa  69.3  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1096  GTP-binding protein, HSR1-related  27.45 
 
 
664 aa  67.4  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3725  hypothetical protein  32.61 
 
 
569 aa  67  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.491681  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2546  hypothetical protein  23.08 
 
 
719 aa  67  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0908682 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3459  hypothetical protein  33.33 
 
 
568 aa  67  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3242  hypothetical protein  30.21 
 
 
377 aa  66.6  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.202403 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0374  hypothetical protein  28.08 
 
 
621 aa  65.5  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10348  isoniazid inductible gene protein iniC  28.88 
 
 
493 aa  65.1  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7006  hypothetical protein  32.18 
 
 
497 aa  65.1  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.707702  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2425  GTP-binding protein HSR1-related  27.33 
 
 
533 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39120  GTPase of unknown function  35.66 
 
 
536 aa  62.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.480255 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0933  dynamin family protein  23.83 
 
 
679 aa  62.8  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.807319  hitchhiker  0.00750508 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0448  isoniazid inductible gene protein IniC  27.8 
 
 
502 aa  62  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608591  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0458  isoniazid inductible gene protein IniC  27.8 
 
 
502 aa  62  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.148496  normal  0.646066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0435  isoniazid inductible gene protein IniC  27.8 
 
 
502 aa  61.6  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.495119  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2392  Dynamin family protein  27.65 
 
 
1249 aa  61.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4146  hypothetical protein  29.67 
 
 
283 aa  60.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.575249 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2547  dynamin  27.06 
 
 
551 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0397  Dynamin family protein  22.65 
 
 
789 aa  60.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0111735  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2545  dynamin  22.78 
 
 
390 aa  60.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0649757  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0787  dynamin family protein  25.46 
 
 
655 aa  60.5  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0394271  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 
718 aa  59.7  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3806  GTP-binding protein, HSR1-related  28.97 
 
 
527 aa  60.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0425817  normal  0.277341 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1013  hypothetical protein  24.1 
 
 
1145 aa  59.7  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.445275  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  28.65 
 
 
762 aa  59.3  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  28.65 
 
 
762 aa  59.3  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  27.17 
 
 
570 aa  58.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1351  heat shock protein DnaJ-like  30.77 
 
 
741 aa  57.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0473185 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0859  GTP-binding protein  24.29 
 
 
692 aa  57.8  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.547864  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0625  isoniazid inductible gene protein IniC  25.3 
 
 
496 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0105414  normal  0.124728 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0336  conserved hypothetical protein, predicted ATP/GTP-binding protein  21.97 
 
 
741 aa  57  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.75 
 
 
887 aa  56.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1501  hypothetical protein  22.22 
 
 
1146 aa  56.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1530  hypothetical protein  22.22 
 
 
1146 aa  56.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.532706  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8770  predicted protein  25.12 
 
 
390 aa  56.2  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1083  hypothetical protein  29.55 
 
 
494 aa  56.2  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  19.72 
 
 
3172 aa  55.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  22.28 
 
 
733 aa  55.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7004  GTP-binding protein HSR1-related  30.64 
 
 
610 aa  55.1  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1479  hypothetical protein  24.43 
 
 
1219 aa  55.1  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1451  GTP1/OBG family GTPase  24.43 
 
 
1219 aa  55.1  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1451  GTP1/OBG family GTPase  24.43 
 
 
1219 aa  55.1  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.472831  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3412  diguanylate cyclase with TPR repeats  31.67 
 
 
816 aa  55.1  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1595  hypothetical protein  24.43 
 
 
1219 aa  55.1  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1741  hypothetical protein  24.43 
 
 
1219 aa  55.1  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000058782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1665  hypothetical protein  24.43 
 
 
1219 aa  55.1  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1701  hypothetical protein  24.43 
 
 
1219 aa  54.7  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 
344 aa  54.7  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1630  hypothetical protein  24.43 
 
 
1219 aa  54.7  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254693  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.31 
 
 
344 aa  54.7  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 
594 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3715  hypothetical protein  24.43 
 
 
1219 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6055  hypothetical protein  28.95 
 
 
696 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.86 
 
 
632 aa  54.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1349  hypothetical protein  29.27 
 
 
566 aa  53.5  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440573 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  18.66 
 
 
3301 aa  53.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1324  hypothetical protein  27.27 
 
 
569 aa  53.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.577358  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0272  isoniazid inductible gene protein IniC  26.75 
 
 
468 aa  53.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5314  hypothetical protein  26.4 
 
 
952 aa  53.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>