25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1083 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1083  hypothetical protein  100 
 
 
494 aa  1019    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14787  predicted protein  37.21 
 
 
204 aa  138  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8770  predicted protein  32.41 
 
 
390 aa  124  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30394  predicted protein  35.17 
 
 
559 aa  123  9e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.382636  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1019  hypothetical protein  28.02 
 
 
556 aa  93.6  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.927192  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0896  hypothetical protein  32.79 
 
 
502 aa  93.6  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128039  normal  0.710649 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0774  hypothetical protein  29.61 
 
 
529 aa  81.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0344155  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87071  predicted protein  28.14 
 
 
445 aa  61.6  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0177704  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4146  hypothetical protein  29.53 
 
 
283 aa  60.5  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.575249 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6880  Dynamin family protein  29.55 
 
 
1164 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0914  Dynamin family protein  25.59 
 
 
548 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.440355 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0322  Dynamin family protein  26.57 
 
 
585 aa  53.9  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1273  Dynamin family protein  28.18 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000146438  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1377  dynamin family protein  32.33 
 
 
585 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3531  dynamin family protein  28.36 
 
 
585 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44250  predicted protein  23.9 
 
 
632 aa  47.8  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.755773  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6878  Dynamin family protein  28.06 
 
 
620 aa  47  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2209  GTP-binding protein  30.37 
 
 
615 aa  45.8  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0632  Dynamin family protein  23.68 
 
 
589 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  35.06 
 
 
329 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1733  hypothetical protein  28 
 
 
976 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  32.93 
 
 
331 aa  44.3  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2560  AAA ATPase  26.97 
 
 
687 aa  43.9  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6053  hypothetical protein  26.71 
 
 
570 aa  43.9  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2910  dynamin family protein  27.22 
 
 
605 aa  43.5  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.518789  normal  0.400566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>