More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3556 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  100 
 
 		 329 aa  673    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  88.79 
 
 		 331 aa  613  9.999999999999999e-175  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  64.53 
 
 		 328 aa  439  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  66.97 
 
 		 322 aa  436  1e-121  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  66.57 
 
 		 329 aa  432  1e-120  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  50.31 
 
 		 333 aa  310  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  48 
 
 		 356 aa  278  9e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  42.9 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  44.9 
 
 		 330 aa  251  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  45.4 
 
 		 326 aa  246  4e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  40.65 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  41.99 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  41.96 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  37.89 
 
 		 317 aa  230  3e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  36.48 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  36.16 
 
 		 346 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  35.83 
 
 		 346 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  36.39 
 
 		 347 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  32.39 
 
 		 640 aa  190  2.9999999999999997e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  34.7 
 
 		 656 aa  186  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  38.43 
 
 		 338 aa  183  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  39.3 
 
 		 348 aa  175  9e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  34.01 
 
 		 664 aa  174  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  32.38 
 
 		 666 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  37.07 
 
 		 351 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  42.37 
 
 		 344 aa  171  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  38.28 
 
 		 345 aa  168  1e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  34.62 
 
 		 355 aa  168  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  30.27 
 
 		 677 aa  167  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  35.71 
 
 		 334 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  32.51 
 
 		 332 aa  159  6e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  35.12 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  31.75 
 
 		 290 aa  133  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  28.86 
 
 		 455 aa  101  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  37.21 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.65 
 
 		 458 aa  67  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  33.77 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  32.54 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  30.77 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  32.12 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  36.05 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.71 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  32.95 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  26.21 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  28.19 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  30.29 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  31.82 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  32.61 
 
 		 476 aa  60.1  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2203  ribosome-associated GTPase EngA  34.62 
 
 		 567 aa  60.1  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  32.16 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  26.63 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  29.21 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  32.31 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  31.79 
 
 		 371 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  32.31 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  32.35 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  25.88 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0020  GTPase ObgE  29.15 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3835  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.33 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  31.46 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  30.34 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3727  ribosome-associated GTPase EngA  30.9 
 
 		 518 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0895  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.65 
 
 		 453 aa  56.6  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000142797  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  26.04 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  32.94 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  27.75 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  28 
 
 		 445 aa  56.2  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  27.43 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  32.91 
 
 		 369 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  32.91 
 
 		 369 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  40.35 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.25 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  32.91 
 
 		 369 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  23.78 
 
 		 369 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1951  ferrous iron transport protein B  30.33 
 
 		 654 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  32.22 
 
 		 407 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  24.46 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.71 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.52 
 
 		 505 aa  54.3  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  34.92 
 
 		 467 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  28.24 
 
 		 500 aa  54.3  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.95 
 
 		 517 aa  53.5  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  36.67 
 
 		 371 aa  53.5  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18250  GTPase ObgE  33.33 
 
 		 509 aa  53.5  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106834  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.51 
 
 		 452 aa  53.5  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0811  GTP-binding proten HflX  21.88 
 
 		 509 aa  53.5  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000455725  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  37.93 
 
 		 519 aa  53.5  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  32.35 
 
 		 367 aa  53.1  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2134  GTP-binding protein EngA  29.83 
 
 		 458 aa  53.1  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0583205  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  34.52 
 
 		 513 aa  53.1  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2258  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.96 
 
 		 503 aa  53.1  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.979161  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02710  Ferrous iron transport protein FeoB  38.71 
 
 		 262 aa  52.8  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  28.07 
 
 		 367 aa  52.8  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  28.41 
 
 		 358 aa  52.4  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1650  GTPase ObgE  32.14 
 
 		 509 aa  52.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420929  hitchhiker  0.000176178 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0355  GTP - binding protein, phage lambda cII repressor  34.88 
 
 		 489 aa  52  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0396  GTP-binding protein, HSR1-related  34.88 
 
 		 489 aa  52  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.27 
 
 		 434 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  41.38 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2180  GTPase ObgE  31.43 
 
 		 350 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236885  normal  0.801258 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>