More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNN01880 on replicon NC_006683
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  52.02 
 
 		 656 aa  658    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  50.29 
 
 		 664 aa  645    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  100 
 
 		 666 aa  1383    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  52.35 
 
 		 640 aa  669    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  47.09 
 
 		 677 aa  587  1e-166  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  39.23 
 
 		 317 aa  191  4e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  37.55 
 
 		 322 aa  181  5.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  37.5 
 
 		 306 aa  177  5e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  32.38 
 
 		 329 aa  173  9e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  31.32 
 
 		 333 aa  171  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  33.45 
 
 		 331 aa  170  6e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  31.4 
 
 		 346 aa  166  9e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  34.59 
 
 		 356 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  31.6 
 
 		 334 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  37.72 
 
 		 348 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  36.96 
 
 		 351 aa  165  3e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  33.65 
 
 		 340 aa  165  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  35.74 
 
 		 328 aa  164  4.0000000000000004e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  34.13 
 
 		 345 aa  164  6e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  33.01 
 
 		 344 aa  163  8.000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  37.25 
 
 		 329 aa  163  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  30.27 
 
 		 346 aa  162  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  32.37 
 
 		 330 aa  162  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  32.76 
 
 		 326 aa  162  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  29.69 
 
 		 346 aa  160  6e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  34.48 
 
 		 338 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  31.97 
 
 		 347 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  31.93 
 
 		 354 aa  154  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  32.33 
 
 		 355 aa  153  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  29.58 
 
 		 324 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  30.46 
 
 		 331 aa  147  5e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  29.64 
 
 		 332 aa  139  2e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  26.37 
 
 		 290 aa  108  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  27.38 
 
 		 455 aa  100  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  25.88 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  43.86 
 
 		 370 aa  62.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  43.86 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  43.86 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  43.86 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  43.86 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  42.11 
 
 		 367 aa  60.5  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  42.11 
 
 		 370 aa  60.1  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  31.14 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  28.81 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  28.8 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  28.92 
 
 		 435 aa  57  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0117  tRNA modification GTPase TrmE  30.86 
 
 		 455 aa  56.2  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  29.88 
 
 		 338 aa  56.2  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4164  tRNA modification GTPase TrmE  28.72 
 
 		 460 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21922  predicted protein  29.22 
 
 		 306 aa  55.8  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  24.71 
 
 		 433 aa  56.2  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  28.31 
 
 		 435 aa  56.2  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0356  GTP-binding protein Era  26.23 
 
 		 315 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.792486 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  39.66 
 
 		 371 aa  55.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  39.66 
 
 		 370 aa  55.5  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1659  GTP-binding protein Era  30.71 
 
 		 299 aa  55.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.37 
 
 		 434 aa  55.5  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1625  GTP-binding protein Era  30.71 
 
 		 299 aa  55.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  37.93 
 
 		 371 aa  54.7  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  38.6 
 
 		 371 aa  54.7  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  37.93 
 
 		 368 aa  54.7  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5478  GTP-binding protein Obg/CgtA  25 
 
 		 480 aa  54.7  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  38.6 
 
 		 369 aa  53.9  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  27.71 
 
 		 337 aa  53.9  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1748  GTPase ObgE  29.63 
 
 		 382 aa  53.5  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0657373  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0895  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.69 
 
 		 453 aa  53.5  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000142797  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  24.84 
 
 		 416 aa  53.9  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1618  GTPase ObgE  25.47 
 
 		 563 aa  53.1  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.664599  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  27.78 
 
 		 353 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1134  GTP-binding protein Era  30 
 
 		 299 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.968945  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  28.89 
 
 		 407 aa  53.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4203  tRNA modification GTPase TrmE  28.21 
 
 		 460 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  27.75 
 
 		 464 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1072  GTPase  26.23 
 
 		 436 aa  52.8  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.561302  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  28.36 
 
 		 476 aa  53.1  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  34.55 
 
 		 367 aa  52.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  38.6 
 
 		 364 aa  52.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  24.87 
 
 		 324 aa  52.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1309  GTP-binding protein HflX  30.46 
 
 		 372 aa  52  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0536  putative GTP-binding protein EngA  33.83 
 
 		 473 aa  51.6  0.00004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  27.43 
 
 		 519 aa  51.6  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  27.41 
 
 		 435 aa  51.2  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.78 
 
 		 680 aa  51.6  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  28.05 
 
 		 338 aa  51.6  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1222  Obg family GTPase CgtA  25.58 
 
 		 560 aa  51.2  0.00006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  26.98 
 
 		 460 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  27.17 
 
 		 373 aa  51.2  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0738  GTP-binding protein Era  30.72 
 
 		 301 aa  51.2  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.979215  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  28.26 
 
 		 434 aa  50.8  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2641  GTP-binding protein Era  29.09 
 
 		 320 aa  50.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.212948  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  27.94 
 
 		 348 aa  50.8  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  28.05 
 
 		 338 aa  50.8  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  22.04 
 
 		 352 aa  50.8  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.33 
 
 		 370 aa  50.8  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1006  GTPase ObgE  27.95 
 
 		 389 aa  50.8  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134861  decreased coverage  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  38.89 
 
 		 368 aa  50.8  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  34.48 
 
 		 368 aa  50.4  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  34.48 
 
 		 370 aa  50.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  29.27 
 
 		 405 aa  50.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  27.37 
 
 		 440 aa  50.4  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>