More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2103 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  100 
 
 		 330 aa  677    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  62.26 
 
 		 354 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  62.78 
 
 		 326 aa  394  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  60.82 
 
 		 340 aa  388  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  58.97 
 
 		 324 aa  369  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  43.37 
 
 		 333 aa  278  7e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  46.73 
 
 		 306 aa  268  1e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  44.55 
 
 		 356 aa  260  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  44.9 
 
 		 329 aa  251  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  40.58 
 
 		 347 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  42.86 
 
 		 331 aa  241  9e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  41.75 
 
 		 328 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  41.75 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  41.1 
 
 		 329 aa  230  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  39.39 
 
 		 346 aa  228  8e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  39.06 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  43.53 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  38.19 
 
 		 346 aa  225  8e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  39.68 
 
 		 317 aa  223  4e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  38.38 
 
 		 348 aa  188  9e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  38.36 
 
 		 351 aa  186  4e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  37.85 
 
 		 344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  34.86 
 
 		 345 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  35.4 
 
 		 640 aa  175  9.999999999999999e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  34.18 
 
 		 334 aa  166  5e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  32.37 
 
 		 666 aa  162  9e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  31.49 
 
 		 656 aa  161  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  31.03 
 
 		 664 aa  159  6e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  33.46 
 
 		 355 aa  159  8e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  32.29 
 
 		 677 aa  155  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  32.94 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  31.85 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  29.97 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  25.51 
 
 		 455 aa  89.7  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  34.64 
 
 		 427 aa  67  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.57 
 
 		 416 aa  67  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3835  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.41 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.57 
 
 		 458 aa  62  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.66 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.199071 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  37.08 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  29.17 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  33.61 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.33 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  31.3 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  43.75 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.5 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  28.42 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  28.57 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45203  predicted protein  31.79 
 
 		 457 aa  59.3  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.017445  normal  0.182069 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  33.33 
 
 		 364 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  32.74 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0363  GTPase ObgE  31.29 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0223104  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  32.79 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  32.32 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  36.05 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0104  tRNA modification GTPase TrmE  28.05 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  31.58 
 
 		 441 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  28.8 
 
 		 419 aa  57.4  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5478  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.92 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  32.79 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  31.15 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0191  TGS domain-containing protein  33.33 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230896 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  37.8 
 
 		 519 aa  57.4  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1523  GTPase ObgE  34.04 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1462  GTP-binding protein Era  33.33 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  35.63 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  42.11 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18250  GTPase ObgE  30.91 
 
 		 509 aa  56.2  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106834  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.59 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  42.11 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.59 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0680  tRNA modification GTPase TrmE  31.85 
 
 		 438 aa  55.8  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000180906  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.59 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  42.11 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  37.78 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  31.15 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  42.11 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  31.15 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4199  GTP-binding protein Era  31.15 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000030589  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  31.15 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  31.15 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10130  GTPase ObgE  40.62 
 
 		 515 aa  55.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.398815  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0895  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.7 
 
 		 453 aa  55.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000142797  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.52 
 
 		 517 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4524  GTP-binding protein Era  31.15 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000023252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  31.15 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0358  GTP-binding protein Era  26.03 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.954921  normal  0.603117 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  31.15 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  31.15 
 
 		 301 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  30.33 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  31.78 
 
 		 434 aa  55.5  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  34.83 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  42.11 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  42.11 
 
 		 424 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  46.55 
 
 		 357 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2143  GTPase ObgE  37.5 
 
 		 529 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.37985e-16 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1042  GTP-binding protein Era  31.97 
 
 		 297 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.228639 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  31.2 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  46.55 
 
 		 357 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1141  GTP-binding protein Era  33.59 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>