More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0267 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  100 
 
 		 306 aa  619  1e-176  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  46.73 
 
 		 333 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  43.91 
 
 		 356 aa  270  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  46.73 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  45.34 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  42.9 
 
 		 329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  41.1 
 
 		 331 aa  250  3e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  44 
 
 		 340 aa  249  4e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  45.55 
 
 		 328 aa  248  9e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  43.17 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  42.53 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  39.22 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  39.25 
 
 		 329 aa  237  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  39.35 
 
 		 317 aa  236  4e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  41.73 
 
 		 348 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  39.21 
 
 		 345 aa  210  2e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  42.28 
 
 		 351 aa  208  9e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  40.58 
 
 		 344 aa  206  4e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  34.06 
 
 		 347 aa  206  6e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  33.13 
 
 		 346 aa  205  8e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  33.43 
 
 		 346 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  36.33 
 
 		 346 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  36.3 
 
 		 664 aa  189  5.999999999999999e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  39.3 
 
 		 334 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  38.93 
 
 		 355 aa  182  5.0000000000000004e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  34.77 
 
 		 338 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  40.09 
 
 		 640 aa  182  9.000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  37.5 
 
 		 666 aa  177  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  35.54 
 
 		 656 aa  176  4e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  37.29 
 
 		 677 aa  169  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  39.11 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  36.29 
 
 		 331 aa  159  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  30.53 
 
 		 290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  34.78 
 
 		 455 aa  88.2  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  31.11 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.55 
 
 		 458 aa  72.4  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.31 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  31.64 
 
 		 423 aa  66.6  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1072  GTPase  33.33 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.561302  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.39 
 
 		 434 aa  66.2  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.71 
 
 		 416 aa  66.2  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.65 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  30.56 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.17 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  34.62 
 
 		 516 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.08 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  31.1 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  31.52 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  30.83 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  41.38 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  30.49 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3835  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.06 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.06 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  32.3 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.72 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  31.33 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3009  GTPase ObgE  52.73 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  37.4 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.95 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  31.87 
 
 		 424 aa  62.4  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  29.76 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  29.52 
 
 		 358 aa  62  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  50.91 
 
 		 364 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.28 
 
 		 344 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4282  GTPase ObgE  50.91 
 
 		 366 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.358429  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  29.73 
 
 		 519 aa  62  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.28 
 
 		 344 aa  62  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  50.91 
 
 		 364 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1222  Obg family GTPase CgtA  29.05 
 
 		 560 aa  61.2  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4918  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.95 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.622557 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  30.6 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  26.78 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  34.13 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  32.03 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  26.34 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  28.57 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.08 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1618  GTPase ObgE  28.72 
 
 		 563 aa  60.8  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.664599  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  29.76 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  30.05 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.97 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  28 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  45 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45203  predicted protein  33.75 
 
 		 457 aa  60.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.017445  normal  0.182069 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  30.77 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  30.72 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  25.14 
 
 		 353 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  31.46 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  41.67 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  30.95 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  31.03 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.3 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  41.67 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  41.67 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.54 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  29.09 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0469  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.24 
 
 		 327 aa  59.7  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.33 
 
 		 505 aa  59.3  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.75 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  27.82 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>