More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0641 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  695    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  63.33 
 
 		 354 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  60.82 
 
 		 330 aa  388  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  55.93 
 
 		 326 aa  382  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  55.73 
 
 		 324 aa  346  4e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  45.17 
 
 		 333 aa  269  5e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  44 
 
 		 306 aa  249  4e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  40.65 
 
 		 329 aa  241  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  38.3 
 
 		 328 aa  236  3e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  38.35 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  41.61 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  41.82 
 
 		 356 aa  233  5e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  41.78 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  40.32 
 
 		 317 aa  227  3e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  34.43 
 
 		 346 aa  209  6e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  36.15 
 
 		 347 aa  209  7e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  34.74 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  33.63 
 
 		 346 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  41.79 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  36.42 
 
 		 348 aa  182  1e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  40.07 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  36.5 
 
 		 345 aa  177  2e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  36.64 
 
 		 351 aa  175  8e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  34.72 
 
 		 355 aa  171  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  35.17 
 
 		 640 aa  171  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  32.65 
 
 		 664 aa  170  4e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  34.48 
 
 		 656 aa  166  5e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  33.65 
 
 		 666 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  31.21 
 
 		 677 aa  163  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  34.59 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  29.72 
 
 		 290 aa  139  8.999999999999999e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  30.54 
 
 		 332 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  29.13 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  26.18 
 
 		 455 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  26.56 
 
 		 427 aa  66.6  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0895  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.08 
 
 		 453 aa  66.2  0.0000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000142797  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1378  GTPase ObgE  26.67 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45203  predicted protein  32.37 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.017445  normal  0.182069 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  28.3 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2690  GTPase ObgE  32.28 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.931281  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  25.46 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.87 
 
 		 482 aa  62.4  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  30 
 
 		 458 aa  62  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  35.14 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  29.38 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3835  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.34 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0080  GTP-binding protein Era  34.52 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000115632  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  29.14 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  29.44 
 
 		 424 aa  59.7  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  28.66 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2056  GTPase ObgE  31.28 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.520405  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  27.47 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  30.27 
 
 		 435 aa  59.7  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  28 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  36.28 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  28.48 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  27.51 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1506  GTP-binding protein Era  29.34 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.094805  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  35.4 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  29.73 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.06 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.54 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  28 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  28.05 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  29.93 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0020  GTPase ObgE  28.71 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.07 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  31.43 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0080  GTP-binding protein Era  32.39 
 
 		 301 aa  57  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000412844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  27.17 
 
 		 330 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  26.4 
 
 		 324 aa  57  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  28.24 
 
 		 419 aa  57  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  28 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  25.43 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  35.2 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0358  GTP-binding protein Era  29.92 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.954921  normal  0.603117 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  27.67 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  29.09 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  27.17 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  28.74 
 
 		 358 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0363  GTPase ObgE  29.7 
 
 		 392 aa  55.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0223104  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  28.06 
 
 		 439 aa  55.8  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  30.06 
 
 		 365 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2285  GTPase ObgE  26.92 
 
 		 338 aa  55.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.397881  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0511  GTPase ObgE  33.07 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166146  normal  0.91816 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  27.78 
 
 		 370 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  44.83 
 
 		 408 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  23.17 
 
 		 364 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0854  GTPase ObgE  29.51 
 
 		 387 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000429069  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0104  tRNA modification GTPase TrmE  28.74 
 
 		 462 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  34.58 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  44.83 
 
 		 408 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  26.63 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0191  TGS domain-containing protein  25.27 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230896 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  44.83 
 
 		 408 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.94 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  30.19 
 
 		 454 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  27.65 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0486  GTPase ObgE  33.07 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  34.15 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>