More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1975 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  100 
 
 		 331 aa  674    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  51.54 
 
 		 332 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  40 
 
 		 317 aa  185  8e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  38.43 
 
 		 351 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  40.16 
 
 		 345 aa  171  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  38.89 
 
 		 344 aa  169  8e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  35.84 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  35.56 
 
 		 346 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  36.9 
 
 		 346 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  36.9 
 
 		 346 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  37.4 
 
 		 334 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  36.29 
 
 		 306 aa  159  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  37.31 
 
 		 348 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  32.08 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  35.11 
 
 		 664 aa  150  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  32.94 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  32.45 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  30.46 
 
 		 666 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  31.82 
 
 		 322 aa  146  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  35.09 
 
 		 356 aa  143  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  31.83 
 
 		 329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  31.6 
 
 		 677 aa  139  6e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  33.22 
 
 		 326 aa  138  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  32.6 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  35.12 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.87 
 
 		 331 aa  136  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  30.08 
 
 		 640 aa  136  6.0000000000000005e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  35.93 
 
 		 354 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  29.13 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  30.99 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  32.51 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  28.73 
 
 		 656 aa  132  6e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  30.88 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  30.95 
 
 		 455 aa  88.6  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  34.57 
 
 		 359 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  33.95 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  33.95 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4144  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.33 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  31.15 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3279  tRNA modification GTPase TrmE  31.33 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0020  GTPase ObgE  33.51 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  30.81 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  31.55 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  32.22 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  31.09 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  31.82 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  34.55 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  32.3 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  30.9 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  31.95 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  33.12 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  31.49 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  28.96 
 
 		 362 aa  69.3  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  31.33 
 
 		 440 aa  69.3  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  32.26 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  31.49 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.94 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0101  GTPase ObgE  31.32 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  31.1 
 
 		 467 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0553  GTPase ObgE  31.32 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000106913  normal  0.0178049 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0583  GTPase ObgE  31.32 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  30.77 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  30.77 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1485  GTP-binding protein EngA  30.43 
 
 		 462 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1846  GTP1/OBG domain-containing protein  31.28 
 
 		 346 aa  68.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  30.77 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  30.77 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  31.52 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5260  GTPase ObgE  32.97 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.281751 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.68 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  30.77 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  30.77 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  30.77 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.67 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  33.12 
 
 		 753 aa  67.4  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  32.4 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.13 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  30.86 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0483  small GTP-binding protein  32.08 
 
 		 580 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.742862 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  32 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  30.41 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  33.71 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  31.18 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  28.42 
 
 		 350 aa  67  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  30.72 
 
 		 337 aa  67  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4633  GTP-binding protein EngA  34.13 
 
 		 511 aa  67  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2365  tRNA modification GTPase TrmE  32.04 
 
 		 459 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02481  GTPase ObgE  33.92 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.492857  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  32.07 
 
 		 419 aa  67  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2800  GTPase ObgE  30.81 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0270558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4873  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.06 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0700899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4410  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.06 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1498  GTP-binding protein EngA  30.43 
 
 		 462 aa  66.2  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  31.45 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2285  GTPase ObgE  33.16 
 
 		 338 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.397881  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  29.11 
 
 		 460 aa  66.2  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  31.75 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  31.18 
 
 		 439 aa  65.9  0.0000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0511  GTPase ObgE  30 
 
 		 370 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166146  normal  0.91816 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  33.71 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>