More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0093 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  100 
 
 		 317 aa  638    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  43.34 
 
 		 333 aa  254  9e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  43.94 
 
 		 346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  42.91 
 
 		 346 aa  249  5e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  43.25 
 
 		 346 aa  248  9e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  40.19 
 
 		 347 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  42.09 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  38.91 
 
 		 331 aa  240  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  42.36 
 
 		 328 aa  238  9e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  43.37 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  39.35 
 
 		 306 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  37.89 
 
 		 329 aa  230  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  40.13 
 
 		 356 aa  230  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  39.16 
 
 		 354 aa  230  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  41.61 
 
 		 355 aa  230  3e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  40.32 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  42.25 
 
 		 348 aa  224  1e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  41.4 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  39.68 
 
 		 330 aa  223  4e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  40.42 
 
 		 351 aa  219  6e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  39.79 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  39.93 
 
 		 344 aa  214  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  35.74 
 
 		 329 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  38.76 
 
 		 324 aa  206  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  39.23 
 
 		 666 aa  191  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  36.05 
 
 		 664 aa  188  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  35.59 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  40 
 
 		 331 aa  185  7e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  34.13 
 
 		 640 aa  180  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  32.3 
 
 		 656 aa  175  8e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  37.41 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  34.48 
 
 		 677 aa  173  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  32.72 
 
 		 290 aa  158  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  25.34 
 
 		 455 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  44.83 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  41.38 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  35.86 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  33.54 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  33.03 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  32.2 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  32.17 
 
 		 370 aa  67  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  30 
 
 		 370 aa  67  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.59 
 
 		 356 aa  67  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0895  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.61 
 
 		 453 aa  66.2  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000142797  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  30.94 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  37 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0657  tRNA modification GTPase TrmE  33.97 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  36.78 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0681  tRNA modification GTPase TrmE  33.97 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570227  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0020  GTPase ObgE  33.33 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  34.59 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  33.54 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  36.56 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  27.68 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  31.28 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  37.5 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  39.74 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  39.74 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  39.74 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  31.61 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1523  GTPase ObgE  30.89 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.98 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.93 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  36.78 
 
 		 371 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  31.88 
 
 		 446 aa  62.4  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  30.83 
 
 		 367 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  37.5 
 
 		 367 aa  62  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5298  tRNA modification GTPase TrmE  32.3 
 
 		 471 aa  62.4  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  29.31 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4241  tRNA modification GTPase TrmE  33.99 
 
 		 469 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207719  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45203  predicted protein  33.33 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.017445  normal  0.182069 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  40.91 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  32.04 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  30 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  31.03 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  36.05 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  31.71 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1485  GTP-binding protein EngA  28.12 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15330  cytidylate kinase  35.66 
 
 		 755 aa  60.8  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.201651  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  30.73 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  36.36 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2929  tRNA modification GTPase TrmE  31.88 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1833  tRNA modification GTPase TrmE  29.49 
 
 		 431 aa  60.5  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0890064  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.72 
 
 		 425 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  44.16 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  30.3 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  30.3 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1498  GTP-binding protein EngA  27.5 
 
 		 462 aa  59.7  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  35.45 
 
 		 347 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.13 
 
 		 434 aa  59.3  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  30.36 
 
 		 424 aa  59.3  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4058  tRNA modification GTPase TrmE  33.55 
 
 		 455 aa  59.3  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.239105  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.82 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0138  GTP-binding protein Era  31.79 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0444  GTPase ObgE  33.01 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  34.15 
 
 		 513 aa  58.5  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  31.79 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  31.01 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>