More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0918 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  100 
 
 
351 aa  702    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  80.81 
 
 
344 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  75.29 
 
 
345 aa  555  1e-157  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  75.65 
 
 
348 aa  548  1e-155  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  47.71 
 
 
355 aa  318  9e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  40.42 
 
 
317 aa  219  7e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  42.28 
 
 
306 aa  208  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  40 
 
 
334 aa  199  5e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  33.44 
 
 
346 aa  186  4e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  38.36 
 
 
330 aa  186  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  33.12 
 
 
346 aa  185  8e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  32.81 
 
 
346 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  32.32 
 
 
347 aa  181  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  37.76 
 
 
354 aa  177  3e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  34.69 
 
 
677 aa  176  4e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  40.34 
 
 
324 aa  176  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  36.64 
 
 
340 aa  175  9e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  39.08 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  37.07 
 
 
329 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  38.62 
 
 
331 aa  173  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  38.43 
 
 
331 aa  172  5.999999999999999e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  35.06 
 
 
326 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  33.56 
 
 
664 aa  172  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  36.96 
 
 
333 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  30.62 
 
 
640 aa  171  2e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  38.57 
 
 
332 aa  170  4e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  36.21 
 
 
329 aa  168  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  35.46 
 
 
356 aa  166  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  36.96 
 
 
666 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  33.09 
 
 
338 aa  161  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  34.76 
 
 
656 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  36.78 
 
 
328 aa  156  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  30.9 
 
 
290 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  30.92 
 
 
455 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  32.39 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  35.97 
 
 
353 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  33.33 
 
 
356 aa  67  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  32.2 
 
 
434 aa  66.6  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0561  GTPase ObgE  36.81 
 
 
390 aa  66.2  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00587502  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3476  GTPase ObgE  36.81 
 
 
391 aa  65.9  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000303711  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  30.98 
 
 
372 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  32.35 
 
 
344 aa  65.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  30.98 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  30.98 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  30.98 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  31.64 
 
 
345 aa  64.7  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  31.9 
 
 
439 aa  65.1  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  31.67 
 
 
370 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  31.95 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  32.45 
 
 
402 aa  65.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  30.98 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2800  GTPase ObgE  31.32 
 
 
369 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0270558  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  30.98 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3357  GTPase ObgE  36.11 
 
 
392 aa  64.7  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0207536  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  30.98 
 
 
372 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0553  GTPase ObgE  31.84 
 
 
370 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000106913  normal  0.0178049 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0101  GTPase ObgE  31.84 
 
 
370 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0583  GTPase ObgE  31.84 
 
 
370 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0511  GTPase ObgE  31.49 
 
 
370 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166146  normal  0.91816 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0796  GTPase ObgE  35.42 
 
 
390 aa  63.5  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000620978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3915  GTPase ObgE  29.95 
 
 
363 aa  63.5  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0260013 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0486  GTPase ObgE  31.49 
 
 
370 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165624  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  34.13 
 
 
427 aa  62.8  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  31.07 
 
 
397 aa  62.8  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0363  GTPase ObgE  36.64 
 
 
392 aa  62  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0223104  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  31.03 
 
 
365 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1505  GTPase ObgE  34.06 
 
 
504 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00667966  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  34.29 
 
 
353 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3978  GTPase ObgE  35.81 
 
 
390 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000165157  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  31.62 
 
 
359 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  32.18 
 
 
365 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3743  GTPase ObgE  35.81 
 
 
390 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3609  GTPase ObgE  35.81 
 
 
390 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.34 
 
 
390 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  30.99 
 
 
339 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072734  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  34.06 
 
 
345 aa  62  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  33.79 
 
 
354 aa  61.6  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  30.87 
 
 
786 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1846  GTP1/OBG domain-containing protein  33.33 
 
 
346 aa  61.6  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.603761  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1378  GTPase ObgE  33.7 
 
 
368 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0020  GTPase ObgE  34.44 
 
 
365 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  30.99 
 
 
339 aa  61.2  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  35.34 
 
 
390 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  31.43 
 
 
419 aa  61.6  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  38.52 
 
 
387 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1618  GTPase ObgE  29 
 
 
563 aa  62  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.664599  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  32.2 
 
 
379 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  35.34 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2061  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.58 
 
 
488 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  35.34 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0460  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.68 
 
 
374 aa  61.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177259 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  35.34 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0283  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.68 
 
 
374 aa  61.2  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  34.24 
 
 
493 aa  61.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  35.34 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1523  GTPase ObgE  35.88 
 
 
411 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  35.34 
 
 
390 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  34.48 
 
 
345 aa  60.8  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.55 
 
 
425 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  32.35 
 
 
373 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>