More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1571 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  100 
 
 
331 aa  680    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  88.79 
 
 
329 aa  613  9.999999999999999e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  65.05 
 
 
328 aa  437  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  65.85 
 
 
322 aa  430  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  64.88 
 
 
329 aa  422  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  46.65 
 
 
333 aa  299  4e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  48.93 
 
 
356 aa  288  9e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  41.1 
 
 
306 aa  250  3e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  42.86 
 
 
330 aa  241  9e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  38.91 
 
 
317 aa  240  2.9999999999999997e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  43.53 
 
 
326 aa  238  8e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  38.35 
 
 
340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  40.69 
 
 
324 aa  229  6e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  39.17 
 
 
354 aa  223  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  36.64 
 
 
347 aa  193  4e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  36.3 
 
 
346 aa  193  4e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  36.21 
 
 
346 aa  192  6e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  36.04 
 
 
346 aa  192  6e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  31.77 
 
 
640 aa  184  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  31.27 
 
 
656 aa  181  2e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  37.46 
 
 
338 aa  180  4e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  36.33 
 
 
664 aa  178  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  39.1 
 
 
348 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  38.62 
 
 
351 aa  173  5e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  33.45 
 
 
666 aa  171  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  33.79 
 
 
355 aa  170  4e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  40.82 
 
 
344 aa  167  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  38.01 
 
 
345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  30.34 
 
 
677 aa  163  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  34.52 
 
 
334 aa  162  7e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  32.29 
 
 
332 aa  159  6e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  30.87 
 
 
331 aa  136  4e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  31.65 
 
 
290 aa  134  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  32.6 
 
 
455 aa  96.3  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  31.36 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  37.21 
 
 
369 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  32.56 
 
 
370 aa  65.1  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2203  ribosome-associated GTPase EngA  36.92 
 
 
567 aa  61.6  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  33.71 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.9 
 
 
458 aa  61.2  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  36.05 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  33.33 
 
 
476 aa  61.2  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  33.72 
 
 
368 aa  61.2  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  30.64 
 
 
348 aa  60.1  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  26.39 
 
 
364 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  35.56 
 
 
324 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  36.67 
 
 
371 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  30.34 
 
 
370 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  30.68 
 
 
370 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1951  ferrous iron transport protein B  29.51 
 
 
654 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  28.57 
 
 
345 aa  57.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  32.95 
 
 
368 aa  57  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  31.46 
 
 
368 aa  57  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  30.36 
 
 
427 aa  56.6  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0665  GTP-binding protein, HSR1-related  28.28 
 
 
445 aa  57  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0655164  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3038  tRNA modification GTPase TrmE  32.08 
 
 
448 aa  56.6  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.38062  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0733  GTP-binding protein EngA  28.24 
 
 
500 aa  56.2  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  33.33 
 
 
367 aa  56.2  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  24.29 
 
 
363 aa  55.8  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  31.46 
 
 
371 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  40.35 
 
 
369 aa  55.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  32.22 
 
 
407 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2361  GTP-binding protein EngA  29.76 
 
 
488 aa  55.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.596104  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  29.32 
 
 
435 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  29.32 
 
 
435 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  38.98 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0020  GTPase ObgE  28.57 
 
 
365 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  26.63 
 
 
434 aa  54.7  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  36.43 
 
 
467 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02977  GTP-binding protein EngA  28.99 
 
 
481 aa  54.7  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  38.98 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  38.98 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  39.66 
 
 
371 aa  54.3  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  24.48 
 
 
369 aa  54.3  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.92 
 
 
356 aa  54.3  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  32.35 
 
 
330 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3835  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.09 
 
 
346 aa  53.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.77 
 
 
434 aa  53.1  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3727  ribosome-associated GTPase EngA  30.39 
 
 
518 aa  53.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1438  GTP-binding protein EngA  28.98 
 
 
471 aa  53.1  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.432419  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  31.11 
 
 
367 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1390  GTP-binding protein EngA  30.41 
 
 
443 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1329  GTP-binding protein EngA  30.41 
 
 
443 aa  52.4  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3308  GTP-binding protein EngA  28.14 
 
 
487 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  25.66 
 
 
367 aa  52  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  28.49 
 
 
358 aa  52  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2648  GTP-binding protein EngA  28.74 
 
 
488 aa  52.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  26.59 
 
 
352 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3144  GTP-binding protein EngA  28.74 
 
 
488 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0749903 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1232  GTP-binding protein EngA  28.14 
 
 
488 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1303  GTP-binding protein EngA  28.14 
 
 
488 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  30.54 
 
 
434 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1233  GTP-binding protein EngA  28.14 
 
 
488 aa  52  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1377  GTP-binding protein EngA  28.74 
 
 
488 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.694687  normal  0.70956 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3001  GTP-binding protein EngA  28.74 
 
 
488 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2986  GTP-binding protein EngA  28.74 
 
 
488 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.306969  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0810  GTPase ObgE  28.1 
 
 
328 aa  52  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0769748  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.57 
 
 
517 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01071  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 
498 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  26.79 
 
 
435 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>