More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0135 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  100 
 
 		 369 aa  741    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  97.29 
 
 		 369 aa  705    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  97.02 
 
 		 369 aa  704    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  92.14 
 
 		 369 aa  670    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  77.45 
 
 		 367 aa  587  1e-167  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  57.26 
 
 		 364 aa  442  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  56.95 
 
 		 363 aa  432  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  52.85 
 
 		 371 aa  402  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  52.57 
 
 		 370 aa  398  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  52.59 
 
 		 371 aa  397  1e-109  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  50.54 
 
 		 370 aa  390  1e-107  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  51.49 
 
 		 369 aa  382  1e-105  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  52.23 
 
 		 370 aa  373  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  49.86 
 
 		 365 aa  368  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  45.41 
 
 		 367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  44.62 
 
 		 410 aa  310  2e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51277  predicted protein  46.11 
 
 		 373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  43.78 
 
 		 367 aa  305  6e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  44.09 
 
 		 370 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  46.22 
 
 		 367 aa  304  2.0000000000000002e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  43.3 
 
 		 369 aa  302  5.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  44.2 
 
 		 368 aa  300  2e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  42.78 
 
 		 374 aa  296  4e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  44.97 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  41.78 
 
 		 368 aa  290  2e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0093  TGS domain-containing protein  44.63 
 
 		 346 aa  289  4e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0617741  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  43.23 
 
 		 407 aa  288  8e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  42.18 
 
 		 370 aa  280  3e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04080  GTP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05560)  44.17 
 
 		 378 aa  277  2e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.256152 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  43.82 
 
 		 371 aa  275  9e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0581  TGS domain-containing protein  30.56 
 
 		 389 aa  149  5e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1844  TGS domain-containing protein  30.4 
 
 		 389 aa  143  4e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0982  TGS domain-containing protein  28.84 
 
 		 380 aa  138  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.741056 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0697  TGS domain-containing protein  27.95 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  28.24 
 
 		 324 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1670  TGS domain-containing protein  28.3 
 
 		 387 aa  129  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00970961 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0678  TGS domain-containing protein  25.82 
 
 		 377 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0194  TGS domain protein  29.23 
 
 		 351 aa  125  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0662  TGS domain-containing protein  28.22 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00027327  normal  0.0103543 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  25.83 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  32.81 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  31.25 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  40.18 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  31.25 
 
 		 330 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  39.2 
 
 		 347 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  37.84 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  35.48 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  42.53 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  30.86 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf270  GTPase ObgE  37.39 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.320591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8476  GTP-binding protein YchF  25.74 
 
 		 362 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.775953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.46 
 
 		 452 aa  73.6  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  35.34 
 
 		 328 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.82 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl522  GTPase ObgE  36.89 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1523  GTPase ObgE  44.86 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  34.78 
 
 		 519 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0100  GTPase ObgE  38.4 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  38.02 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0131  GTPase ObgE  37.6 
 
 		 356 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0699  GTPase ObgE  43.96 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.244108  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0810  GTPase ObgE  35.21 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0769748  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  42.05 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.86 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  36 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0091  GTPase ObgE  38.4 
 
 		 350 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  35.88 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1414  GTPase ObgE  36.22 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2193  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  24.74 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7891  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.12 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.32 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0191  TGS domain-containing protein  30.71 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230896 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.48 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.54 
 
 		 458 aa  69.7  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2061  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.5 
 
 		 488 aa  69.7  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.38 
 
 		 427 aa  69.3  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  36.89 
 
 		 435 aa  69.3  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1222  Obg family GTPase CgtA  35.65 
 
 		 560 aa  69.3  0.0000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.25 
 
 		 505 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1726  GTPase ObgE  42.05 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  42.7 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5521  GTP-binding protein YchF  23.73 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.633913  normal  0.842427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  38.05 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  40.8 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1536  GTPase ObgE  40.91 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10130  GTPase ObgE  42.86 
 
 		 515 aa  67.8  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.398815  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2258  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.39 
 
 		 503 aa  67.4  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.979161  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0020  GTPase ObgE  34.13 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.33 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18250  GTPase ObgE  34.19 
 
 		 509 aa  67.4  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106834  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1650  GTPase ObgE  30.66 
 
 		 509 aa  67  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420929  hitchhiker  0.000176178 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  40.91 
 
 		 437 aa  67  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  40.23 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2931  GTP-binding protein YchF  24.23 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2219  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  32.19 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.23 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3547  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  34.27 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  40.23 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1618  GTPase ObgE  35.51 
 
 		 563 aa  66.2  0.0000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.664599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  39.6 
 
 		 450 aa  66.2  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>