54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0093 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0093  TGS domain-containing protein  100 
 
 
346 aa  697    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0617741  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  47.79 
 
 
364 aa  346  3e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  44.93 
 
 
363 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  41.37 
 
 
367 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  44.57 
 
 
369 aa  290  2e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.39 
 
 
370 aa  291  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  45.75 
 
 
365 aa  290  3e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  42.9 
 
 
371 aa  289  4e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  45.11 
 
 
369 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  44.29 
 
 
369 aa  288  9e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  44.02 
 
 
369 aa  288  1e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  42.35 
 
 
369 aa  286  4e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  41.19 
 
 
370 aa  285  5.999999999999999e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  41.58 
 
 
371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  40.4 
 
 
370 aa  262  6e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  38.52 
 
 
368 aa  247  2e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  41.41 
 
 
370 aa  245  6.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  39.83 
 
 
368 aa  240  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  38.86 
 
 
367 aa  241  2e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  37.26 
 
 
368 aa  241  2e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  38.08 
 
 
367 aa  236  4e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51277  predicted protein  37.87 
 
 
373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  37.11 
 
 
369 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  36.36 
 
 
410 aa  232  6e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  35.05 
 
 
374 aa  229  4e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  38.15 
 
 
367 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04080  GTP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05560)  37.54 
 
 
378 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.256152 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  37.78 
 
 
370 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  35.88 
 
 
407 aa  218  7.999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  38.24 
 
 
371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0982  TGS domain-containing protein  31.23 
 
 
380 aa  146  6e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.741056 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0581  TGS domain-containing protein  30.33 
 
 
389 aa  140  3e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1844  TGS domain-containing protein  30.25 
 
 
389 aa  134  3e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0678  TGS domain-containing protein  30.64 
 
 
377 aa  130  3e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0697  TGS domain-containing protein  30.77 
 
 
387 aa  129  6e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0194  TGS domain protein  27.95 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0662  TGS domain-containing protein  30.2 
 
 
357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00027327  normal  0.0103543 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  26.97 
 
 
328 aa  113  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1670  TGS domain-containing protein  27.67 
 
 
387 aa  113  5e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00970961 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  26.55 
 
 
328 aa  109  6e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  26.54 
 
 
330 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  27.81 
 
 
311 aa  106  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  26.74 
 
 
330 aa  102  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  44.66 
 
 
324 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0191  TGS domain-containing protein  27.27 
 
 
329 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230896 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  27.09 
 
 
330 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1450  GTP-binding protein Era  30.61 
 
 
327 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.176106  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0999  GTP-binding protein Era  34.88 
 
 
313 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17106  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1152  GTP-binding protein Era  35.71 
 
 
313 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1959  translation-associated GTPase  33.02 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1073  translation-associated GTPase  32.61 
 
 
394 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0474  GTP-binding protein Era  30.69 
 
 
301 aa  43.1  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0779  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  25 
 
 
422 aa  43.1  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.511656  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0462  translation-associated GTPase  34.02 
 
 
392 aa  42.7  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>