More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0250 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  100 
 
 		 370 aa  738    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  77.24 
 
 		 368 aa  548  1e-155  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  68.11 
 
 		 369 aa  509  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  75.64 
 
 		 371 aa  505  9.999999999999999e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  66.76 
 
 		 370 aa  491  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  48.91 
 
 		 364 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  50 
 
 		 363 aa  364  2e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  46.76 
 
 		 370 aa  330  3e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  43.94 
 
 		 367 aa  325  6e-88  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  46.65 
 
 		 369 aa  319  5e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  44.89 
 
 		 370 aa  316  3e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  44.32 
 
 		 365 aa  313  1.9999999999999998e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  45.41 
 
 		 371 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  45.68 
 
 		 371 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  45.43 
 
 		 370 aa  310  2e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  43.82 
 
 		 369 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  43.82 
 
 		 369 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  43.82 
 
 		 369 aa  298  9e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  41.51 
 
 		 367 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  41.55 
 
 		 369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  37.17 
 
 		 410 aa  257  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51277  predicted protein  38.56 
 
 		 373 aa  249  8e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  39.78 
 
 		 367 aa  248  9e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0093  TGS domain-containing protein  41.41 
 
 		 346 aa  245  8e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0617741  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  40 
 
 		 374 aa  245  9.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  39.13 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  39.21 
 
 		 407 aa  241  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04080  GTP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05560)  39.07 
 
 		 378 aa  238  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.256152 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  38.04 
 
 		 367 aa  234  1.0000000000000001e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  36.1 
 
 		 368 aa  229  5e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0581  TGS domain-containing protein  29.19 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0982  TGS domain-containing protein  28.3 
 
 		 380 aa  123  6e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.741056 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0678  TGS domain-containing protein  27.99 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  27.17 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0662  TGS domain-containing protein  28.49 
 
 		 357 aa  118  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00027327  normal  0.0103543 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1844  TGS domain-containing protein  27.51 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  24.93 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1670  TGS domain-containing protein  28.98 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00970961 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0194  TGS domain protein  27.79 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0697  TGS domain-containing protein  28.35 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0131  GTPase ObgE  43.93 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0091  GTPase ObgE  43.12 
 
 		 350 aa  83.2  0.000000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333267  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0100  GTPase ObgE  42.2 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.52 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  41.96 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  35.04 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  38.89 
 
 		 437 aa  79.7  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  39.6 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  40.74 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.98 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.18 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.59 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  39.62 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  34.31 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  40.74 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  42.05 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  43.12 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  41.75 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  38.89 
 
 		 437 aa  76.6  0.0000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.26 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  41.35 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  28.09 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.33 
 
 		 452 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  39.42 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf270  GTPase ObgE  38.79 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.320591  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.12 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  34.06 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1726  GTPase ObgE  38.83 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4937  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  39.22 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000108566  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  26.09 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  40.78 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.06 
 
 		 438 aa  73.6  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl522  GTPase ObgE  34.07 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.18 
 
 		 429 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0312  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.6 
 
 		 432 aa  73.2  0.000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2180  GTPase ObgE  39.68 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236885  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  39.05 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  38.89 
 
 		 435 aa  72.8  0.000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2389  GTPase ObgE  45.88 
 
 		 529 aa  72.8  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045234  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1536  GTPase ObgE  36.63 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  37.74 
 
 		 434 aa  72.8  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  29.86 
 
 		 324 aa  72.8  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  38.53 
 
 		 439 aa  72  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2143  GTPase ObgE  45.88 
 
 		 529 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.37985e-16 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1650  GTPase ObgE  35.71 
 
 		 509 aa  72.4  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420929  hitchhiker  0.000176178 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10130  GTPase ObgE  30.8 
 
 		 515 aa  72.4  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.398815  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  36.88 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  38.1 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  38.1 
 
 		 428 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.32 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1072  GTPase  36.72 
 
 		 436 aa  72.8  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.561302  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.18 
 
 		 359 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.71 
 
 		 517 aa  71.2  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.86 
 
 		 505 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2917  GTP-binding protein YchF  37.5 
 
 		 368 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.75 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  39.45 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  42.28 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  39.68 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  39.68 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>