More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2526 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  100 
 
 		 328 aa  674    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0191  TGS domain-containing protein  40.85 
 
 		 329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230896 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  42.86 
 
 		 311 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  42.34 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  41.14 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  40.12 
 
 		 330 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  40.84 
 
 		 330 aa  229  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  40.24 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0194  TGS domain protein  31.87 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0982  TGS domain-containing protein  28.94 
 
 		 380 aa  142  7e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.741056 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0581  TGS domain-containing protein  28.61 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0678  TGS domain-containing protein  29.58 
 
 		 377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0662  TGS domain-containing protein  28.3 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00027327  normal  0.0103543 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1670  TGS domain-containing protein  28.97 
 
 		 387 aa  119  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00970961 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  26.43 
 
 		 369 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  29.09 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  27.45 
 
 		 371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  26.32 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0697  TGS domain-containing protein  36.73 
 
 		 387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1844  TGS domain-containing protein  34.1 
 
 		 389 aa  102  8e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  25.75 
 
 		 371 aa  102  9e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  23.9 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  24.86 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0093  TGS domain-containing protein  25.82 
 
 		 346 aa  99.8  6e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0617741  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  25.34 
 
 		 368 aa  97.8  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  26.98 
 
 		 370 aa  98.2  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.11 
 
 		 370 aa  97.4  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  21.92 
 
 		 364 aa  97.1  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  25.14 
 
 		 369 aa  95.9  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  26 
 
 		 368 aa  94  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  24.32 
 
 		 368 aa  90.1  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  22.71 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  23.5 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  22.69 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.07 
 
 		 415 aa  72  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 369 aa  72  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  34.48 
 
 		 369 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  34.48 
 
 		 369 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.38 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  35.26 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  29.34 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51277  predicted protein  36.36 
 
 		 373 aa  67  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.95 
 
 		 371 aa  65.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  33.62 
 
 		 369 aa  65.9  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  27.85 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  28.21 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  32.6 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  27.69 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.61 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  28.74 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  26.86 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  27.75 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  29.09 
 
 		 476 aa  63.2  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  27.84 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0486  GTPase ObgE  31.32 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165624  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  30.61 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0511  GTPase ObgE  30.77 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166146  normal  0.91816 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  36 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  28.45 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  40 
 
 		 335 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  34.83 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  33.08 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  29.59 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  27.56 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  27.98 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  29.09 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  33.13 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  50 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  28.64 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3378  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.85 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0101  GTPase ObgE  30.22 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.86 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0583  GTPase ObgE  30.22 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0553  GTPase ObgE  30.22 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000106913  normal  0.0178049 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  27.53 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  28.25 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  29.53 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2800  GTPase ObgE  29.67 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0270558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  27.31 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  30.22 
 
 		 373 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  29.02 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.77 
 
 		 369 aa  60.1  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.58 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  26.29 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0810  GTPase ObgE  25.64 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0769748  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  30.11 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  27.35 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04080  GTP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05560)  29.07 
 
 		 378 aa  59.3  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.256152 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  27.35 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  27.35 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  27.35 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  27.35 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  27.35 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  27.35 
 
 		 372 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  40.7 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  25.77 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  28.65 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2411  small GTP-binding protein  29.86 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000356758  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1203  GTPase ObgE  32.35 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0486766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  27.96 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>