More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2143 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  66.73 
 
 
505 aa  652    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2143  GTPase ObgE  100 
 
 
529 aa  1066    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.37985e-16 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2389  GTPase ObgE  93.18 
 
 
529 aa  901    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045234  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  65.16 
 
 
517 aa  645    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10130  GTPase ObgE  70.62 
 
 
515 aa  629  1e-179  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.398815  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  65.77 
 
 
519 aa  620  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2258  GTP-binding protein Obg/CgtA  67.52 
 
 
503 aa  617  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.979161  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  65.88 
 
 
513 aa  609  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1650  GTPase ObgE  63.99 
 
 
509 aa  586  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420929  hitchhiker  0.000176178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  62.42 
 
 
500 aa  581  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  65.24 
 
 
463 aa  565  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18250  GTPase ObgE  62.5 
 
 
509 aa  564  1.0000000000000001e-159  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106834  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11560  GTPase ObgE  60.67 
 
 
500 aa  547  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.32436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  61.91 
 
 
450 aa  521  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  59.13 
 
 
516 aa  512  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3378  GTP-binding protein Obg/CgtA  61.44 
 
 
454 aa  511  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2061  GTP-binding protein Obg/CgtA  59.47 
 
 
488 aa  511  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  58.78 
 
 
493 aa  501  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  61.32 
 
 
454 aa  500  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1475  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.2 
 
 
486 aa  497  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5258  GTPase ObgE  62.22 
 
 
541 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.31 
 
 
491 aa  491  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3858  GTPase ObgE  58.81 
 
 
481 aa  490  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1189  GTPase ObgE  60.34 
 
 
488 aa  488  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3479  GTPase ObgE  57.72 
 
 
481 aa  486  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.395045  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1618  GTPase ObgE  53.8 
 
 
563 aa  486  1e-136  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.664599  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2458  GTP-binding protein Obg/CgtA  60.34 
 
 
450 aa  487  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1505  GTPase ObgE  59.14 
 
 
504 aa  484  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00667966  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5478  GTP-binding protein Obg/CgtA  59.53 
 
 
480 aa  474  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587105  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  60.6 
 
 
476 aa  473  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3553  GTPase ObgE  56.21 
 
 
485 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1222  GTPase ObgE  59.73 
 
 
529 aa  468  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3548  GTPase ObgE  56.21 
 
 
485 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3621  GTPase ObgE  56.21 
 
 
485 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3944  GTPase ObgE  55.42 
 
 
480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12467  GTPase ObgE  54.41 
 
 
479 aa  448  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.642368  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1222  Obg family GTPase CgtA  51.94 
 
 
560 aa  451  1e-125  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2637  GTPase ObgE  55.21 
 
 
482 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.869058  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.98 
 
 
426 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.96 
 
 
482 aa  301  2e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.96 
 
 
464 aa  301  2e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.9 
 
 
463 aa  298  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.38 
 
 
425 aa  294  3e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.83 
 
 
458 aa  289  1e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.98 
 
 
464 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.91 
 
 
437 aa  280  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  40.37 
 
 
434 aa  280  6e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  42.63 
 
 
432 aa  279  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.54 
 
 
435 aa  277  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  49.7 
 
 
338 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  42.24 
 
 
428 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  41.4 
 
 
435 aa  273  6e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  39.59 
 
 
427 aa  272  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  41.4 
 
 
435 aa  271  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  40.58 
 
 
422 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.38 
 
 
417 aa  268  2e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  40.27 
 
 
428 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  48.8 
 
 
338 aa  265  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  40.27 
 
 
428 aa  265  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  40.27 
 
 
428 aa  264  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  40.27 
 
 
428 aa  264  3e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  40.27 
 
 
428 aa  263  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  40.27 
 
 
428 aa  263  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  41.61 
 
 
424 aa  263  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  40.27 
 
 
428 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  40.05 
 
 
428 aa  263  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  40.05 
 
 
428 aa  263  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  45.14 
 
 
346 aa  263  6.999999999999999e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  48.5 
 
 
338 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.76 
 
 
426 aa  263  8.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  45.39 
 
 
425 aa  262  1e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.93 
 
 
425 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  40.14 
 
 
428 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  40.14 
 
 
427 aa  261  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  47.16 
 
 
353 aa  259  9e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  47.31 
 
 
338 aa  259  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  41.39 
 
 
419 aa  257  5e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  39.82 
 
 
430 aa  256  8e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  39.82 
 
 
430 aa  256  8e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  48.06 
 
 
354 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  47.31 
 
 
338 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  48.06 
 
 
354 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  48.06 
 
 
354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  38.43 
 
 
423 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.57 
 
 
415 aa  253  7e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.22 
 
 
426 aa  251  2e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.06 
 
 
427 aa  251  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  45.35 
 
 
338 aa  251  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  39.59 
 
 
430 aa  249  7e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  38.83 
 
 
439 aa  248  1e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  40.32 
 
 
424 aa  246  9e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.36 
 
 
434 aa  246  9e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  42.05 
 
 
387 aa  246  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  46.71 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  44.14 
 
 
338 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.94 
 
 
438 aa  244  3.9999999999999997e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.27 
 
 
452 aa  243  7e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.55 
 
 
439 aa  240  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  40.32 
 
 
424 aa  240  4e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.5 
 
 
369 aa  238  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>