More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11560 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_11560  GTPase ObgE  100 
 
 		 500 aa  984    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.32436 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  67.26 
 
 		 505 aa  625  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2258  GTP-binding protein Obg/CgtA  68.26 
 
 		 503 aa  620  1e-176  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.979161  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.49 
 
 		 517 aa  605  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  65.93 
 
 		 519 aa  597  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1650  GTPase ObgE  63.49 
 
 		 509 aa  591  1e-168  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420929  hitchhiker  0.000176178 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  65.08 
 
 		 513 aa  586  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  65.83 
 
 		 493 aa  556  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  60.29 
 
 		 500 aa  554  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18250  GTPase ObgE  63.07 
 
 		 509 aa  552  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106834  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  66.23 
 
 		 463 aa  545  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  64.78 
 
 		 450 aa  546  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10130  GTPase ObgE  63.41 
 
 		 515 aa  543  1e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.398815  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2061  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.45 
 
 		 488 aa  531  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2143  GTPase ObgE  60.67 
 
 		 529 aa  528  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.37985e-16 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2389  GTPase ObgE  60.36 
 
 		 529 aa  521  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045234  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  59.29 
 
 		 491 aa  513  1e-144  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1475  GTP-binding protein Obg/CgtA  61.4 
 
 		 486 aa  509  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3378  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.83 
 
 		 454 aa  508  1e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1189  GTPase ObgE  63.05 
 
 		 488 aa  502  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5258  GTPase ObgE  64.64 
 
 		 541 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  64.05 
 
 		 454 aa  501  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2458  GTP-binding protein Obg/CgtA  64.35 
 
 		 450 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3858  GTPase ObgE  63.05 
 
 		 481 aa  488  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3553  GTPase ObgE  61.07 
 
 		 485 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3548  GTPase ObgE  61.07 
 
 		 485 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3621  GTPase ObgE  61.07 
 
 		 485 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5478  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.42 
 
 		 480 aa  483  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1505  GTPase ObgE  64.08 
 
 		 504 aa  484  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00667966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12467  GTPase ObgE  60.04 
 
 		 479 aa  482  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.642368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  61.09 
 
 		 516 aa  478  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1618  GTPase ObgE  52.87 
 
 		 563 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.664599  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2637  GTPase ObgE  60.08 
 
 		 482 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.869058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3479  GTPase ObgE  61.18 
 
 		 481 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.395045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3944  GTPase ObgE  59.63 
 
 		 480 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1222  GTPase ObgE  64.25 
 
 		 529 aa  463  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  61.66 
 
 		 476 aa  457  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1222  Obg family GTPase CgtA  52.8 
 
 		 560 aa  455  1.0000000000000001e-126  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.15 
 
 		 426 aa  320  5e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.23 
 
 		 464 aa  311  2e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.5 
 
 		 437 aa  297  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  53.69 
 
 		 354 aa  295  9e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  53.69 
 
 		 354 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  53.69 
 
 		 354 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.05 
 
 		 482 aa  293  6e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.24 
 
 		 463 aa  292  8e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.14 
 
 		 464 aa  288  2e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  52.54 
 
 		 353 aa  287  4e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  45.83 
 
 		 427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  45.85 
 
 		 428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  41.44 
 
 		 434 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  44.82 
 
 		 422 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  45.95 
 
 		 432 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  45.48 
 
 		 428 aa  282  9e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  45.24 
 
 		 428 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  48.81 
 
 		 338 aa  281  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  45.48 
 
 		 428 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  46.15 
 
 		 428 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  45.01 
 
 		 428 aa  280  6e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  45.01 
 
 		 428 aa  280  6e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  45.01 
 
 		 428 aa  279  7e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  44.78 
 
 		 428 aa  279  8e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  44.78 
 
 		 428 aa  279  8e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.92 
 
 		 425 aa  276  5e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  44.93 
 
 		 428 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  40.49 
 
 		 439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  42.79 
 
 		 430 aa  274  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  42.79 
 
 		 430 aa  274  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  43.39 
 
 		 435 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  43.93 
 
 		 419 aa  273  6e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.35 
 
 		 458 aa  273  7e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  42.82 
 
 		 424 aa  271  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  40.79 
 
 		 427 aa  269  7e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.14 
 
 		 434 aa  269  7e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  42.69 
 
 		 435 aa  269  8e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  47.93 
 
 		 338 aa  269  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  42.24 
 
 		 430 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.59 
 
 		 435 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  41.51 
 
 		 428 aa  266  5.999999999999999e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  40.97 
 
 		 439 aa  266  7e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  47.32 
 
 		 338 aa  266  8e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  48.02 
 
 		 338 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  46.2 
 
 		 346 aa  265  1e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  40 
 
 		 438 aa  262  8e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  46.43 
 
 		 338 aa  262  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  47.42 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.95 
 
 		 415 aa  261  2e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  38.32 
 
 		 423 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  41.36 
 
 		 437 aa  259  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.27 
 
 		 426 aa  259  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  45.12 
 
 		 423 aa  256  6e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.73 
 
 		 417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  45.24 
 
 		 338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.43 
 
 		 439 aa  254  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  42.31 
 
 		 437 aa  254  3e-66  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  46.15 
 
 		 353 aa  253  6e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  41.42 
 
 		 435 aa  253  7e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  46.63 
 
 		 370 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.01 
 
 		 425 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.33 
 
 		 452 aa  249  7e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>