More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1189 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2061  GTP-binding protein Obg/CgtA  72.12 
 
 		 488 aa  645    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  75.37 
 
 		 493 aa  679    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1189  GTPase ObgE  100 
 
 		 488 aa  965    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3944  GTPase ObgE  72.56 
 
 		 480 aa  624  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1475  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.6 
 
 		 486 aa  615  1e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12467  GTPase ObgE  70.44 
 
 		 479 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.642368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2637  GTPase ObgE  71.76 
 
 		 482 aa  610  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.869058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3553  GTPase ObgE  69.87 
 
 		 485 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3548  GTPase ObgE  69.87 
 
 		 485 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3621  GTPase ObgE  69.87 
 
 		 485 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  67.78 
 
 		 491 aa  598  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1505  GTPase ObgE  70.34 
 
 		 504 aa  592  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00667966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  65.38 
 
 		 505 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  62.74 
 
 		 500 aa  574  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  65.43 
 
 		 463 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3858  GTPase ObgE  67.44 
 
 		 481 aa  559  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  63.56 
 
 		 513 aa  558  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5478  GTP-binding protein Obg/CgtA  68.41 
 
 		 480 aa  557  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3479  GTPase ObgE  66.17 
 
 		 481 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.395045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5258  GTPase ObgE  67.82 
 
 		 541 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2258  GTP-binding protein Obg/CgtA  64.41 
 
 		 503 aa  536  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.979161  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  60.16 
 
 		 519 aa  536  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3378  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.89 
 
 		 454 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  61.46 
 
 		 517 aa  530  1e-149  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  64.19 
 
 		 450 aa  531  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  63.68 
 
 		 454 aa  512  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1222  GTPase ObgE  66.44 
 
 		 529 aa  510  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1650  GTPase ObgE  59.43 
 
 		 509 aa  505  9.999999999999999e-143  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420929  hitchhiker  0.000176178 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11560  GTPase ObgE  63.05 
 
 		 500 aa  500  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.32436 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  62.01 
 
 		 516 aa  498  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2458  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.76 
 
 		 450 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2143  GTPase ObgE  60.34 
 
 		 529 aa  489  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.37985e-16 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18250  GTPase ObgE  56.35 
 
 		 509 aa  486  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106834  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2389  GTPase ObgE  59.7 
 
 		 529 aa  480  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045234  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  63.16 
 
 		 476 aa  476  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10130  GTPase ObgE  59.38 
 
 		 515 aa  474  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.398815  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1618  GTPase ObgE  55.98 
 
 		 563 aa  462  1e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.664599  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1222  Obg family GTPase CgtA  53.71 
 
 		 560 aa  441  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.51 
 
 		 426 aa  333  5e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.19 
 
 		 482 aa  325  8.000000000000001e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.03 
 
 		 464 aa  320  3.9999999999999996e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  46.19 
 
 		 428 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.87 
 
 		 437 aa  306  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  46.12 
 
 		 432 aa  306  6e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.67 
 
 		 463 aa  306  6e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  44.44 
 
 		 435 aa  301  1e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.45 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  52.41 
 
 		 338 aa  300  3e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  44.29 
 
 		 430 aa  300  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  44.29 
 
 		 430 aa  300  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  42.03 
 
 		 427 aa  299  7e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  43.62 
 
 		 422 aa  299  8e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  52.84 
 
 		 353 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  43.72 
 
 		 424 aa  299  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  43.98 
 
 		 435 aa  297  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.87 
 
 		 458 aa  297  2e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.89 
 
 		 435 aa  296  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  52.57 
 
 		 338 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  51.02 
 
 		 354 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  51.02 
 
 		 354 aa  289  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  52.92 
 
 		 338 aa  289  7e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  50.3 
 
 		 338 aa  288  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  47.11 
 
 		 346 aa  288  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  51.02 
 
 		 354 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.79 
 
 		 464 aa  288  2e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  52.31 
 
 		 338 aa  286  5e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  43.65 
 
 		 428 aa  286  7e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  43.65 
 
 		 428 aa  286  7e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.98 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  50.6 
 
 		 338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  43.65 
 
 		 428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  42.96 
 
 		 428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  43.19 
 
 		 428 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  43.19 
 
 		 428 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  42.96 
 
 		 428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.86 
 
 		 434 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  42.96 
 
 		 428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  41.1 
 
 		 423 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  43.42 
 
 		 428 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  44.37 
 
 		 419 aa  281  3e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.9 
 
 		 369 aa  280  5e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  52.2 
 
 		 356 aa  279  8e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  42.89 
 
 		 430 aa  278  1e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  42.73 
 
 		 428 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  43.68 
 
 		 427 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.72 
 
 		 425 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  42.47 
 
 		 428 aa  276  6e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.08 
 
 		 438 aa  275  9e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  41.15 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  48.34 
 
 		 338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.04 
 
 		 417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  48.64 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  52.46 
 
 		 348 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  48.39 
 
 		 347 aa  270  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  42.99 
 
 		 428 aa  269  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  42.99 
 
 		 428 aa  269  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  41.61 
 
 		 424 aa  268  2e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.85 
 
 		 415 aa  267  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  46.51 
 
 		 387 aa  266  7e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  47.06 
 
 		 362 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>