More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_20124 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  100 
 
 		 400 aa  811    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  44.19 
 
 		 435 aa  219  7e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  44.19 
 
 		 435 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  42.95 
 
 		 346 aa  217  4e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.72 
 
 		 437 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  43.46 
 
 		 423 aa  211  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  42.86 
 
 		 439 aa  210  4e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  44.19 
 
 		 434 aa  209  9e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  44.9 
 
 		 422 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  42.86 
 
 		 424 aa  203  3e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  40.32 
 
 		 408 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  40.32 
 
 		 408 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  41.08 
 
 		 397 aa  203  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  40.32 
 
 		 408 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  41.5 
 
 		 427 aa  202  8e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3835  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.12 
 
 		 346 aa  202  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.54 
 
 		 426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  41.95 
 
 		 430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  41.95 
 
 		 430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  43.38 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2258  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.56 
 
 		 503 aa  200  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.979161  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.24 
 
 		 426 aa  200  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  41.39 
 
 		 407 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  40.32 
 
 		 408 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  41.39 
 
 		 407 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  43.41 
 
 		 432 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  41.5 
 
 		 500 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.9 
 
 		 482 aa  199  7e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0511  GTPase ObgE  42 
 
 		 329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130161  normal  0.255445 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  42.28 
 
 		 430 aa  198  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.62 
 
 		 429 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  41.72 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  41.72 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  41.72 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  41.72 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4858  GTPase ObgE  41.06 
 
 		 407 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  41.72 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  41.72 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  45.24 
 
 		 419 aa  197  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  41.72 
 
 		 372 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.2 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  46.1 
 
 		 516 aa  197  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.86 
 
 		 438 aa  197  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.54 
 
 		 434 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4144  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.41 
 
 		 368 aa  196  6e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.87 
 
 		 435 aa  196  7e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02481  GTPase ObgE  40.94 
 
 		 327 aa  195  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.492857  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1586  GTPase ObgE  40.26 
 
 		 329 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.928628  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.85 
 
 		 464 aa  195  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  45.85 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  40.8 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  41.72 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02961  GTPase ObgE  40.26 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.45 
 
 		 425 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  41.39 
 
 		 372 aa  194  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  41.55 
 
 		 406 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3680  GTPase ObgE  42.72 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  39.42 
 
 		 397 aa  194  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  40.2 
 
 		 392 aa  194  3e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  41.89 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  42.38 
 
 		 366 aa  193  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  41.39 
 
 		 365 aa  193  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  42.39 
 
 		 337 aa  192  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  40.92 
 
 		 357 aa  192  9e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  40.33 
 
 		 341 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  42.26 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  41.72 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2248  GTPase ObgE  42.9 
 
 		 366 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0879905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  41.27 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  43.19 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  41.4 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  41.4 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  41.4 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  41.67 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.89 
 
 		 505 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  41.72 
 
 		 364 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  40.92 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  41.08 
 
 		 428 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  40.91 
 
 		 379 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  41.08 
 
 		 428 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  38.93 
 
 		 440 aa  190  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  42.49 
 
 		 519 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  43.53 
 
 		 513 aa  190  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  46.49 
 
 		 439 aa  190  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02391  GTPase ObgE  39.13 
 
 		 327 aa  190  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.76 
 
 		 491 aa  189  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  41.39 
 
 		 364 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  40.2 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  42.05 
 
 		 326 aa  189  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  40.96 
 
 		 424 aa  189  7e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  40 
 
 		 341 aa  189  7e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.49 
 
 		 463 aa  189  7e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4390  GTPase ObgE  40.13 
 
 		 329 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4453  GTPase ObgE  40.13 
 
 		 329 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.584179 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02381  GTPase ObgE  39.46 
 
 		 327 aa  189  8e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.636357  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  40.73 
 
 		 370 aa  189  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1006  GTPase ObgE  40.13 
 
 		 389 aa  189  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134861  decreased coverage  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  40.88 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  40.58 
 
 		 361 aa  188  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  41.02 
 
 		 338 aa  189  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>