More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3835 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3835  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 
346 aa  701    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  49.11 
 
 
370 aa  298  8e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  47.92 
 
 
422 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.35 
 
 
426 aa  296  5e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  48.47 
 
 
346 aa  291  2e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.7 
 
 
369 aa  289  4e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  49.1 
 
 
338 aa  288  7e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  44.94 
 
 
423 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  48.55 
 
 
362 aa  287  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.76 
 
 
425 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  48 
 
 
355 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  47.77 
 
 
379 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  46.72 
 
 
361 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  47.29 
 
 
338 aa  280  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.51 
 
 
356 aa  279  5e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  46.11 
 
 
338 aa  279  5e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  48.96 
 
 
419 aa  279  6e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  45.11 
 
 
427 aa  278  9e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  47.18 
 
 
357 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  46.72 
 
 
364 aa  276  3e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.6 
 
 
417 aa  276  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  48.92 
 
 
428 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  48.01 
 
 
387 aa  275  7e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  47.46 
 
 
357 aa  274  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  47.13 
 
 
327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.3 
 
 
371 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.35 
 
 
426 aa  272  7e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  49.23 
 
 
432 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  43.98 
 
 
338 aa  271  9e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  48.46 
 
 
353 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  45.99 
 
 
430 aa  270  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  47.7 
 
 
358 aa  271  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  45.99 
 
 
430 aa  270  2e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  49.01 
 
 
353 aa  269  5e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3915  GTPase ObgE  45.93 
 
 
363 aa  269  5.9999999999999995e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0260013 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  45.71 
 
 
428 aa  268  8.999999999999999e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  46.8 
 
 
345 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  46.27 
 
 
428 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  46.27 
 
 
428 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  45.99 
 
 
435 aa  267  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  46.27 
 
 
428 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  46.27 
 
 
428 aa  267  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  46.27 
 
 
428 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  45.97 
 
 
428 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  45.97 
 
 
428 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0469  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.68 
 
 
327 aa  266  4e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  46.49 
 
 
358 aa  266  4e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  45.02 
 
 
337 aa  266  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  45.7 
 
 
435 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  46.75 
 
 
365 aa  265  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  47.06 
 
 
365 aa  265  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  43.5 
 
 
439 aa  265  8.999999999999999e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  46.27 
 
 
428 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.58 
 
 
434 aa  265  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  45.95 
 
 
349 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  47.69 
 
 
338 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  42.86 
 
 
430 aa  264  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  45.67 
 
 
428 aa  263  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  47.69 
 
 
338 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1601  GTPase ObgE  44.44 
 
 
402 aa  263  3e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000135042  hitchhiker  0.000110073 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  44.28 
 
 
338 aa  263  4e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.2 
 
 
348 aa  263  4e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.53 
 
 
463 aa  263  4e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  45.95 
 
 
353 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  45.78 
 
 
326 aa  262  6e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  46.07 
 
 
354 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  45.07 
 
 
427 aa  262  6e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  45.11 
 
 
354 aa  262  8e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.91 
 
 
425 aa  261  8.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  45.95 
 
 
372 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  43.1 
 
 
500 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  43.87 
 
 
370 aa  261  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  46.48 
 
 
370 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  45.07 
 
 
428 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  45.79 
 
 
354 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  46.48 
 
 
372 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.9 
 
 
438 aa  260  2e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  46.48 
 
 
372 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  46.48 
 
 
372 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  47.48 
 
 
338 aa  261  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  46.48 
 
 
372 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  46.48 
 
 
372 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  46.48 
 
 
372 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  46.48 
 
 
372 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  45.66 
 
 
353 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0871  GTPase ObgE  45.1 
 
 
387 aa  260  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0184633  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.15 
 
 
482 aa  260  3e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  45.51 
 
 
354 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  44.84 
 
 
364 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  45.13 
 
 
366 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  45.4 
 
 
373 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  46.09 
 
 
353 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  45.1 
 
 
373 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1006  GTPase ObgE  43.3 
 
 
389 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134861  decreased coverage  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.3 
 
 
464 aa  259  6e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  44.84 
 
 
364 aa  259  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  45.87 
 
 
370 aa  258  9e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  41.16 
 
 
341 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  41.81 
 
 
341 aa  258  1e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  45.05 
 
 
405 aa  258  1e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>