More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0728 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 
356 aa  726    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3835  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.51 
 
 
346 aa  278  7e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.56 
 
 
426 aa  276  5e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.26 
 
 
426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  48.96 
 
 
428 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  46.11 
 
 
423 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  48.07 
 
 
432 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  47.4 
 
 
435 aa  264  2e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.72 
 
 
437 aa  264  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  47.11 
 
 
435 aa  262  6e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.77 
 
 
425 aa  262  6.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.69 
 
 
425 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  45.56 
 
 
430 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  44.22 
 
 
427 aa  258  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  45.56 
 
 
430 aa  258  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  44.8 
 
 
434 aa  257  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  45.11 
 
 
439 aa  257  2e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.82 
 
 
464 aa  257  3e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.41 
 
 
429 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.93 
 
 
417 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  45.1 
 
 
430 aa  253  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.23 
 
 
464 aa  253  4.0000000000000004e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  45.27 
 
 
424 aa  251  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.62 
 
 
463 aa  251  1e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  45.99 
 
 
428 aa  251  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  44.12 
 
 
353 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  43.6 
 
 
338 aa  249  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  43.93 
 
 
338 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  45.7 
 
 
428 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.69 
 
 
439 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  44.12 
 
 
354 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  45.24 
 
 
422 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0699  GTPase ObgE  44.48 
 
 
335 aa  248  2e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.244108  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  44.12 
 
 
354 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.1 
 
 
452 aa  248  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  43.31 
 
 
346 aa  247  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  45.4 
 
 
428 aa  247  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  45.4 
 
 
428 aa  247  3e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  45.4 
 
 
428 aa  247  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  45.4 
 
 
428 aa  246  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  43.82 
 
 
354 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  45.1 
 
 
428 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  45.1 
 
 
428 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  45.4 
 
 
428 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  46.9 
 
 
419 aa  245  6.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  44 
 
 
426 aa  245  9e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  45.13 
 
 
327 aa  245  9e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  39.55 
 
 
500 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  46.29 
 
 
427 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  45.4 
 
 
428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  45.56 
 
 
440 aa  242  7e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  44.15 
 
 
387 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.84 
 
 
434 aa  240  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  44.84 
 
 
337 aa  241  2e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  46.9 
 
 
338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  42.15 
 
 
338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  41.98 
 
 
334 aa  239  4e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  41.98 
 
 
338 aa  239  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.06 
 
 
435 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  45 
 
 
365 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2399  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.12 
 
 
428 aa  236  4e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  45 
 
 
365 aa  236  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  45.29 
 
 
428 aa  235  7e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  45.29 
 
 
428 aa  235  7e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  43.7 
 
 
343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  42.14 
 
 
338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  42.4 
 
 
439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  42.14 
 
 
338 aa  233  3e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  45.45 
 
 
439 aa  233  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  41.11 
 
 
428 aa  233  3e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  43.36 
 
 
337 aa  233  5e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4334  GTPase ObgE  46.88 
 
 
424 aa  232  6e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00027074  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  41.64 
 
 
437 aa  232  6e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  44.25 
 
 
326 aa  232  7.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  41.28 
 
 
338 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.77 
 
 
454 aa  231  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0476  GTPase ObgE  43.66 
 
 
395 aa  230  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2180  GTPase ObgE  43.32 
 
 
350 aa  230  3e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236885  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.73 
 
 
340 aa  229  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  42.2 
 
 
353 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.03 
 
 
438 aa  229  6e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  42.2 
 
 
349 aa  229  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  43.14 
 
 
433 aa  229  7e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  43.59 
 
 
364 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.09 
 
 
427 aa  227  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.52 
 
 
333 aa  227  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  45.7 
 
 
423 aa  227  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  43.59 
 
 
364 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2820  GTPase ObgE  43.59 
 
 
366 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0271751  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.61 
 
 
348 aa  226  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  41.36 
 
 
435 aa  226  6e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.04 
 
 
482 aa  226  7e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1817  GTPase ObgE  41.47 
 
 
354 aa  225  7e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.389419  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.36 
 
 
458 aa  225  9e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  42.69 
 
 
358 aa  224  2e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5258  GTPase ObgE  44.16 
 
 
541 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  43.02 
 
 
424 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  43.82 
 
 
362 aa  223  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  41.33 
 
 
353 aa  223  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  41.5 
 
 
358 aa  223  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>