More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0958 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  100 
 
 
365 aa  738    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  50 
 
 
367 aa  387  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  47.93 
 
 
364 aa  372  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  50.41 
 
 
371 aa  368  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  49.59 
 
 
370 aa  370  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  50.41 
 
 
369 aa  367  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  47.41 
 
 
363 aa  363  3e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  50.41 
 
 
369 aa  360  2e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  50.14 
 
 
369 aa  359  4e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  50.14 
 
 
369 aa  358  7e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  48.1 
 
 
369 aa  352  5e-96  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  47.55 
 
 
371 aa  349  5e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  48.02 
 
 
370 aa  345  7e-94  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  43.36 
 
 
370 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  44.07 
 
 
370 aa  311  7.999999999999999e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  43.87 
 
 
368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  40.96 
 
 
370 aa  297  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0093  TGS domain-containing protein  45.43 
 
 
346 aa  295  9e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0617741  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  42.11 
 
 
369 aa  294  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  43.44 
 
 
368 aa  292  7e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_51277  predicted protein  40.59 
 
 
373 aa  278  1e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  39.52 
 
 
367 aa  276  5e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  41.26 
 
 
374 aa  270  4e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  40.32 
 
 
410 aa  270  4e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  40.11 
 
 
367 aa  267  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  38.95 
 
 
407 aa  267  2e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04080  GTP binding protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05560)  42.66 
 
 
378 aa  266  2.9999999999999995e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.256152 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  41.03 
 
 
367 aa  264  1e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  39.89 
 
 
368 aa  264  2e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  42.37 
 
 
371 aa  263  3e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0581  TGS domain-containing protein  28.61 
 
 
389 aa  158  1e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1844  TGS domain-containing protein  28.5 
 
 
389 aa  157  3e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0697  TGS domain-containing protein  27.91 
 
 
387 aa  149  8e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  30.35 
 
 
324 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0678  TGS domain-containing protein  28.07 
 
 
377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0982  TGS domain-containing protein  28.38 
 
 
380 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.741056 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1670  TGS domain-containing protein  27.57 
 
 
387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00970961 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  29.09 
 
 
328 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  31.13 
 
 
328 aa  119  7.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0194  TGS domain protein  27.4 
 
 
351 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0662  TGS domain-containing protein  26.85 
 
 
357 aa  105  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00027327  normal  0.0103543 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1145  GTPase ObgE  28.45 
 
 
352 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  37.5 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  37.5 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0810  GTPase ObgE  37.3 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0769748  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  32.24 
 
 
348 aa  79  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  31.03 
 
 
311 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  33.92 
 
 
432 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf270  GTPase ObgE  31.14 
 
 
422 aa  76.6  0.0000000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.320591  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.72 
 
 
517 aa  76.3  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0418  GTPase ObgE  40.8 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl522  GTPase ObgE  33.33 
 
 
432 aa  75.5  0.000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05575  GTP-binding protein  38.1 
 
 
333 aa  75.9  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  34.15 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  38.71 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  33.92 
 
 
428 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  43.68 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.34 
 
 
463 aa  73.9  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0773  GTP-binding protein Obg/CgtA  50 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  33.33 
 
 
344 aa  73.6  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.3 
 
 
458 aa  73.2  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  38.74 
 
 
516 aa  73.2  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  34.96 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3380  GTPase ObgE  37.6 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0532  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.88 
 
 
452 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0136129  normal  0.438452 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0837  GTP-binding protein Obg/CgtA  36 
 
 
359 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0069  GTPase ObgE  38.89 
 
 
337 aa  72.8  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0191  TGS domain-containing protein  33.07 
 
 
329 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230896 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  37.01 
 
 
437 aa  72.4  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  40.74 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.43 
 
 
416 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  37.01 
 
 
435 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1105  GTP-dependent nucleic acid-binding protein EngD  27.54 
 
 
361 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.692178 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  40.74 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0020  GTPase ObgE  37.12 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  40.74 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2061  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.86 
 
 
488 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0489  GTPase ObgE  36.51 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0490  GTPase ObgE  36.07 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.831388  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1650  GTPase ObgE  40.91 
 
 
509 aa  71.2  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420929  hitchhiker  0.000176178 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  28.86 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  38.28 
 
 
500 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.8 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  28.86 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.9 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  38.18 
 
 
519 aa  70.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_002950  PG0790  GTPase ObgE  37.6 
 
 
394 aa  70.1  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.25 
 
 
415 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1505  GTPase ObgE  42.7 
 
 
504 aa  70.1  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00667966  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  36.54 
 
 
408 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  35.48 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  34.39 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  33.33 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.32 
 
 
482 aa  69.7  0.00000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5258  GTPase ObgE  36.15 
 
 
541 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.65 
 
 
396 aa  69.7  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  40.16 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.09 
 
 
505 aa  69.7  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  32.52 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  40.16 
 
 
408 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0320956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>