More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0773 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0773  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 		 422 aa  804    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  42.33 
 
 		 435 aa  296  6e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  42.56 
 
 		 435 aa  293  4e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.76 
 
 		 463 aa  290  3e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  40.94 
 
 		 427 aa  290  3e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  44.01 
 
 		 500 aa  288  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.36 
 
 		 482 aa  286  7e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.21 
 
 		 517 aa  285  9e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  46.28 
 
 		 519 aa  278  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.92 
 
 		 464 aa  278  2e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5258  GTPase ObgE  48.25 
 
 		 541 aa  277  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.19 
 
 		 505 aa  276  4e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  44 
 
 		 464 aa  275  8e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  42.42 
 
 		 428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.62 
 
 		 426 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.94 
 
 		 434 aa  270  4e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  42.52 
 
 		 419 aa  270  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  46.6 
 
 		 516 aa  268  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.15 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  45.09 
 
 		 346 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  39.1 
 
 		 423 aa  266  4e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  40.96 
 
 		 428 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  41.45 
 
 		 428 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.26 
 
 		 415 aa  266  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  48.26 
 
 		 476 aa  266  4e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  41.59 
 
 		 428 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  42.79 
 
 		 428 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  41.12 
 
 		 428 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  41.12 
 
 		 428 aa  264  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  40.61 
 
 		 427 aa  265  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  40.61 
 
 		 422 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  41.22 
 
 		 428 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  40.89 
 
 		 428 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  40.89 
 
 		 428 aa  264  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.71 
 
 		 417 aa  263  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  45.07 
 
 		 423 aa  264  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  41.12 
 
 		 428 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  42.69 
 
 		 432 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  43.46 
 
 		 450 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2258  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.42 
 
 		 503 aa  260  4e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.979161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.88 
 
 		 491 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1650  GTPase ObgE  43.96 
 
 		 509 aa  258  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420929  hitchhiker  0.000176178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.39 
 
 		 463 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18250  GTPase ObgE  45.75 
 
 		 509 aa  258  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106834  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  44.7 
 
 		 493 aa  256  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  45.51 
 
 		 327 aa  255  9e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.66 
 
 		 435 aa  255  9e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  45.67 
 
 		 454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  37.24 
 
 		 439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  48.02 
 
 		 338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3553  GTPase ObgE  45.7 
 
 		 485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3548  GTPase ObgE  45.7 
 
 		 485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3621  GTPase ObgE  45.7 
 
 		 485 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1475  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.23 
 
 		 486 aa  253  6e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.45 
 
 		 425 aa  252  7e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  38.79 
 
 		 430 aa  251  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5478  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.92 
 
 		 480 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  38.79 
 
 		 430 aa  251  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  40.09 
 
 		 424 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  51.65 
 
 		 348 aa  250  3e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1222  GTPase ObgE  46.26 
 
 		 529 aa  250  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2061  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.74 
 
 		 488 aa  250  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  40.42 
 
 		 428 aa  249  6e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  40.42 
 
 		 428 aa  249  6e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  46.5 
 
 		 338 aa  249  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  47.01 
 
 		 338 aa  249  8e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  45.75 
 
 		 338 aa  249  8e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.66 
 
 		 425 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.95 
 
 		 437 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  44.95 
 
 		 513 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12467  GTPase ObgE  44.57 
 
 		 479 aa  248  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.642368  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2458  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.09 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.66 
 
 		 350 aa  247  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  48.41 
 
 		 337 aa  246  4e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5095  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.03 
 
 		 334 aa  246  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2637  GTPase ObgE  45.48 
 
 		 482 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.869058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3479  GTPase ObgE  46.26 
 
 		 481 aa  246  8e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.395045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  48.25 
 
 		 338 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  40.75 
 
 		 424 aa  245  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3378  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.82 
 
 		 454 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  40.98 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3858  GTPase ObgE  46.6 
 
 		 481 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  44.78 
 
 		 370 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  47.23 
 
 		 357 aa  244  3e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  45.85 
 
 		 338 aa  244  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2143  GTPase ObgE  44.8 
 
 		 529 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.37985e-16 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  40.33 
 
 		 424 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  38.55 
 
 		 430 aa  243  5e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  46.06 
 
 		 355 aa  243  5e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  44.92 
 
 		 326 aa  243  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  46.94 
 
 		 379 aa  243  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  47.46 
 
 		 343 aa  243  6e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4726  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.1 
 
 		 342 aa  242  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0890343  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0105  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.47 
 
 		 342 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03729  GTPase ObgE  45.99 
 
 		 392 aa  242  9e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  37.24 
 
 		 434 aa  241  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  47.18 
 
 		 353 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3944  GTPase ObgE  44.57 
 
 		 480 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.27 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  42.99 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>