More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0020 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0020  GTPase ObgE  100 
 
 
365 aa  733    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  57.41 
 
 
440 aa  334  1e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  54.15 
 
 
346 aa  329  4e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  57.01 
 
 
353 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.13 
 
 
426 aa  322  6e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  54.18 
 
 
425 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  53.35 
 
 
347 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  57.32 
 
 
354 aa  316  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  57.32 
 
 
354 aa  316  5e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  57.8 
 
 
417 aa  316  5e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  57.01 
 
 
354 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  53.04 
 
 
435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  53.33 
 
 
435 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  51.88 
 
 
337 aa  312  5.999999999999999e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  53.96 
 
 
419 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  50.14 
 
 
423 aa  308  9e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  52.44 
 
 
439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  49.71 
 
 
337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  52.44 
 
 
343 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.15 
 
 
425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  52.42 
 
 
427 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0843  GTPase ObgE  52.31 
 
 
379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.946123  normal  0.830278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0772  GTPase ObgE  52.31 
 
 
357 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  51.03 
 
 
387 aa  301  8.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0513  hypothetical protein  50.27 
 
 
370 aa  301  1e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.609745  normal  0.0660512 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4216  GTPase ObgE  52.02 
 
 
362 aa  300  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.862872  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.65 
 
 
482 aa  299  5e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0837  GTPase ObgE  51.58 
 
 
361 aa  299  5e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330133  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  52.45 
 
 
338 aa  299  6e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  50 
 
 
397 aa  298  7e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.43 
 
 
464 aa  298  1e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  50.6 
 
 
338 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  50.15 
 
 
326 aa  298  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.5 
 
 
434 aa  298  1e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  54.02 
 
 
348 aa  297  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  49.25 
 
 
345 aa  297  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  52.69 
 
 
356 aa  297  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  51.52 
 
 
365 aa  297  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  50.6 
 
 
338 aa  296  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  51.82 
 
 
365 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  51.69 
 
 
364 aa  296  4e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.71 
 
 
350 aa  296  5e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  54.01 
 
 
422 aa  295  9e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.07 
 
 
336 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  52.47 
 
 
327 aa  293  2e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2702  GTPase ObgE  48.38 
 
 
341 aa  294  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  50.3 
 
 
338 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.01 
 
 
369 aa  293  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  51.65 
 
 
338 aa  293  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  51.41 
 
 
428 aa  293  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  52.12 
 
 
428 aa  293  3e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2574  GTPase ObgE  48.53 
 
 
341 aa  292  5e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.85 
 
 
333 aa  292  6e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3673  GTPase ObgE  52.4 
 
 
357 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3619  GTPase ObgE  45.79 
 
 
392 aa  291  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000171752  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  50.3 
 
 
430 aa  291  2e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  49.7 
 
 
430 aa  290  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  49.7 
 
 
430 aa  290  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  48.49 
 
 
338 aa  290  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1270  GTPase ObgE  51.69 
 
 
355 aa  289  4e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0124615  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  48.55 
 
 
356 aa  289  6e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1378  GTPase ObgE  50.45 
 
 
368 aa  288  9e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5484  GTP-binding protein Obg/CgtA  52.1 
 
 
371 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215863  normal  0.278538 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.8 
 
 
429 aa  288  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  50 
 
 
370 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  48.2 
 
 
353 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2248  GTPase ObgE  48.66 
 
 
366 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0879905  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  48 
 
 
370 aa  288  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  51.79 
 
 
428 aa  287  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2056  GTPase ObgE  50.62 
 
 
366 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.520405  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  46.85 
 
 
372 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  47.41 
 
 
358 aa  287  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  50.57 
 
 
427 aa  287  2e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  50.15 
 
 
338 aa  287  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  48.28 
 
 
362 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  48.84 
 
 
372 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  46.85 
 
 
372 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  46.85 
 
 
372 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  46.85 
 
 
372 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  46.85 
 
 
372 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  46.85 
 
 
372 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  46.85 
 
 
372 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  51.49 
 
 
428 aa  286  5e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  51.49 
 
 
428 aa  286  5e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  51.49 
 
 
428 aa  286  5e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  51.49 
 
 
428 aa  286  5e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  50.31 
 
 
338 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000099426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  51.19 
 
 
428 aa  285  7e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  51.19 
 
 
428 aa  285  7e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  46.52 
 
 
373 aa  285  7e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  49.39 
 
 
405 aa  285  7e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1601  GTPase ObgE  49.24 
 
 
402 aa  285  8e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000135042  hitchhiker  0.000110073 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.95 
 
 
340 aa  285  9e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  51.19 
 
 
428 aa  285  9e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1504  GTPase ObgE  48.79 
 
 
405 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  49.23 
 
 
358 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  49.7 
 
 
364 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  49.7 
 
 
364 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4115  GTPase ObgE  48.7 
 
 
352 aa  285  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593697  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  50.29 
 
 
428 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>