More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1523 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1523  GTPase ObgE  100 
 
 
411 aa  783    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.95 
 
 
426 aa  318  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000264035  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.64 
 
 
415 aa  300  4e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  45.06 
 
 
435 aa  298  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  45.18 
 
 
435 aa  297  2e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  46.46 
 
 
419 aa  296  4e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.72 
 
 
434 aa  296  6e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.36 
 
 
464 aa  294  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000147894  hitchhiker  0.0000000000000362877 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  47.45 
 
 
433 aa  290  3e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.03 
 
 
425 aa  288  1e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.14 
 
 
435 aa  288  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.61 
 
 
417 aa  286  4e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.5 
 
 
425 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.22 
 
 
482 aa  283  4.0000000000000003e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  49.76 
 
 
423 aa  283  5.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.75 
 
 
463 aa  281  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  41.69 
 
 
424 aa  279  7e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  41.94 
 
 
434 aa  277  2e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.55 
 
 
426 aa  276  5e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  39.82 
 
 
440 aa  275  8e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.65 
 
 
427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.94 
 
 
491 aa  274  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  42.23 
 
 
427 aa  273  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  40.05 
 
 
423 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  46.36 
 
 
519 aa  273  4.0000000000000004e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  41.51 
 
 
439 aa  272  9e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  43.66 
 
 
422 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  43.46 
 
 
432 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  43.68 
 
 
428 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  45.62 
 
 
516 aa  269  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  40.18 
 
 
500 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.03 
 
 
437 aa  269  5.9999999999999995e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  41.91 
 
 
464 aa  269  7e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2061  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.75 
 
 
488 aa  268  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  44.31 
 
 
450 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5258  GTPase ObgE  44.65 
 
 
541 aa  266  4e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0929  GTP-binding protein Obg/CgtA  40 
 
 
426 aa  265  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0009475  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  52.61 
 
 
327 aa  264  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3952  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.04 
 
 
350 aa  264  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  42.3 
 
 
428 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  46.53 
 
 
439 aa  264  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  40.47 
 
 
428 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  40.47 
 
 
428 aa  264  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0895  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.39 
 
 
453 aa  264  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000142797  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  42.53 
 
 
428 aa  264  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.76 
 
 
416 aa  264  2e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.22 
 
 
505 aa  264  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  42.76 
 
 
428 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  42.76 
 
 
428 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  42.3 
 
 
428 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  42.53 
 
 
428 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  42.53 
 
 
428 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  42.26 
 
 
428 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0872  GTPase ObgE  42.76 
 
 
428 aa  262  6.999999999999999e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.72581 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0959  GTPase ObgE  49.11 
 
 
343 aa  261  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  41.26 
 
 
430 aa  260  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  42.86 
 
 
427 aa  260  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  41.26 
 
 
430 aa  260  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  42.53 
 
 
428 aa  260  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45203  predicted protein  43.29 
 
 
457 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.017445  normal  0.182069 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  46.45 
 
 
337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  45.87 
 
 
513 aa  259  8e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2055  GTP-binding protein Obg/CgtA  49.57 
 
 
344 aa  258  9e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346924  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  48.47 
 
 
346 aa  258  1e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  41.8 
 
 
428 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  49.71 
 
 
358 aa  258  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  50.12 
 
 
425 aa  257  3e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.79 
 
 
463 aa  257  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.64 
 
 
458 aa  257  3e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  46.05 
 
 
454 aa  257  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  43.75 
 
 
493 aa  256  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  48.92 
 
 
333 aa  256  7e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  46.63 
 
 
326 aa  255  8e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3378  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.68 
 
 
454 aa  255  9e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  48.8 
 
 
338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.26 
 
 
517 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  43.36 
 
 
387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0415  GTP-binding protein Obg/CgtA  53.1 
 
 
348 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.345643 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  41.03 
 
 
430 aa  253  3e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  50.46 
 
 
348 aa  254  3e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4712  GTPase ObgE  50.88 
 
 
354 aa  253  5.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.224685 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0521  GTPase  40.14 
 
 
439 aa  253  5.000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3641  small GTP-binding protein  54.19 
 
 
348 aa  253  5.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587865  normal  0.516645 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  48.26 
 
 
338 aa  252  7e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  45.88 
 
 
454 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  48.66 
 
 
356 aa  252  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  47.65 
 
 
350 aa  252  9.000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3208  GTPase ObgE  49.26 
 
 
347 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  48.46 
 
 
353 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0658  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.09 
 
 
438 aa  252  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000277499  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3858  GTPase ObgE  45.01 
 
 
481 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  42.26 
 
 
437 aa  251  2e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1464  GTPase ObgE  41.01 
 
 
437 aa  251  2e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00245956  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  48.06 
 
 
343 aa  250  3e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.08 
 
 
429 aa  249  5e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  48.07 
 
 
353 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  50.31 
 
 
349 aa  249  6e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  40.19 
 
 
424 aa  248  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  48.1 
 
 
345 aa  247  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.35 
 
 
439 aa  248  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>