More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1887 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  100 
 
 		 356 aa  727    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  64.58 
 
 		 333 aa  443  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  49.24 
 
 		 331 aa  309  4e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  48.31 
 
 		 329 aa  300  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  49.53 
 
 		 328 aa  292  6e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  46.28 
 
 		 306 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  46.44 
 
 		 329 aa  281  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  43.67 
 
 		 330 aa  279  5e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  45.65 
 
 		 326 aa  272  8.000000000000001e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  45.11 
 
 		 322 aa  271  2e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  42.95 
 
 		 354 aa  263  4e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  39.72 
 
 		 340 aa  249  4e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  42.39 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  40.44 
 
 		 317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  40.55 
 
 		 347 aa  235  9e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  41.24 
 
 		 346 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  41.24 
 
 		 346 aa  233  3e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  38.25 
 
 		 346 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  37.99 
 
 		 338 aa  202  5e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  37.41 
 
 		 664 aa  186  5e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  39.86 
 
 		 348 aa  186  5e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  34.59 
 
 		 656 aa  179  4.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  40.83 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  41.56 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  31.16 
 
 		 640 aa  174  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  38.35 
 
 		 345 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  34.25 
 
 		 666 aa  171  2e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  33.85 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  34.4 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  34.86 
 
 		 332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  32.43 
 
 		 677 aa  163  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  31.93 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  29.93 
 
 		 290 aa  133  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  27.22 
 
 		 455 aa  96.7  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  30.86 
 
 		 326 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  32.38 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  33.96 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.73 
 
 		 505 aa  67.4  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  30.77 
 
 		 427 aa  67  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  29.21 
 
 		 419 aa  67  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  30.21 
 
 		 476 aa  67  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  29.5 
 
 		 519 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45203  predicted protein  36 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.017445  normal  0.182069 
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  30.18 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.2 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18250  GTPase ObgE  31.76 
 
 		 509 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106834  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  35.88 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0137  tRNA modification GTPase TrmE  26.76 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.210433  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.5 
 
 		 517 aa  63.2  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.56 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.43 
 
 		 482 aa  62.8  0.000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  30.23 
 
 		 424 aa  62.8  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  33.33 
 
 		 367 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2258  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.64 
 
 		 503 aa  61.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.979161  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  28.99 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1650  GTPase ObgE  31.29 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420929  hitchhiker  0.000176178 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0895  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.22 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000142797  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  32.87 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.73 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  33.79 
 
 		 467 aa  60.1  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.89 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  31.43 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  29.94 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.81 
 
 		 454 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3835  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.35 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.07 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2389  GTPase ObgE  32.76 
 
 		 529 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  27.65 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.37 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  31.53 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2078  GTPase ObgE  28.06 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  33.96 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  32.82 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1650  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.45 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10130  GTPase ObgE  31.9 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.398815  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15330  cytidylate kinase  31.18 
 
 		 755 aa  57.8  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.201651  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3727  ribosome-associated GTPase EngA  30.95 
 
 		 518 aa  57.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  41.67 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1653  small GTP-binding protein Era  26.87 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2143  GTPase ObgE  31.9 
 
 		 529 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.37985e-16 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  27.89 
 
 		 516 aa  57.4  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  27.69 
 
 		 330 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1336  tRNA modification GTPase TrmE  31.65 
 
 		 441 aa  57  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.24 
 
 		 463 aa  56.6  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  28.86 
 
 		 369 aa  57  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  44.07 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  25.7 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4183  tRNA modification GTPase TrmE  30.25 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000380111  normal  0.0649437 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  29.09 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  30.28 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.89 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  31.03 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  34.09 
 
 		 454 aa  55.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  32.58 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  28.81 
 
 		 454 aa  55.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1189  GTPase ObgE  29.08 
 
 		 488 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2382  GTPase ObgE  33.6 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0660181  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2094  GTPase ObgE  33.6 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0511635  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4158  tRNA modification GTPase TrmE  29.83 
 
 		 454 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000196641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>