More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1923 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  100 
 
 		 326 aa  661    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  62.78 
 
 		 330 aa  394  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  55.93 
 
 		 340 aa  382  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  58.75 
 
 		 354 aa  368  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  57.94 
 
 		 324 aa  344  2e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  44.41 
 
 		 333 aa  264  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  45.34 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  46.18 
 
 		 356 aa  256  3e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  44.87 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  45.4 
 
 		 329 aa  246  4e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  45.54 
 
 		 328 aa  242  7e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  42.09 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  43.53 
 
 		 331 aa  238  8e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  44.3 
 
 		 322 aa  232  7.000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  38.46 
 
 		 347 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  36.97 
 
 		 346 aa  219  7e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  37.38 
 
 		 346 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  43.2 
 
 		 338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  36.7 
 
 		 346 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  37.24 
 
 		 348 aa  186  3e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  35.27 
 
 		 640 aa  181  2e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  36.84 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  32.67 
 
 		 664 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  35.06 
 
 		 351 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  33.22 
 
 		 656 aa  171  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  35.42 
 
 		 344 aa  169  6e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  32.65 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  32.76 
 
 		 666 aa  162  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  30.32 
 
 		 677 aa  153  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  34.33 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  35.06 
 
 		 334 aa  146  5e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  33.22 
 
 		 331 aa  138  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  30.26 
 
 		 290 aa  126  5e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  28.65 
 
 		 455 aa  98.2  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  38.28 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  36.28 
 
 		 369 aa  67  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  39.25 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  39.06 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  31.22 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1694  GTPase ObgE  36.72 
 
 		 437 aa  62.4  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  37.38 
 
 		 367 aa  62  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  33.99 
 
 		 364 aa  62  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  31.86 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  33.98 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  33.95 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.54 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  30.35 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  32.73 
 
 		 371 aa  59.7  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  37.96 
 
 		 463 aa  59.7  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  38.2 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  28.89 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  35.17 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4428  tRNA modification GTPase TrmE  31.98 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1726  GTPase ObgE  34.86 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1582  GTPase ObgE  34.81 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1525  GTPase ObgE  37.31 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3505  GTP-binding protein EngA  32.1 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0442058  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.43 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  40.23 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  35.51 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  33.53 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  34.74 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3644  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.53 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0336528  normal  0.0121811 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0488  GTP-binding protein EngA  35.66 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  34.97 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  30.92 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  28.86 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  38.04 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15330  cytidylate kinase  35.19 
 
 		 755 aa  57  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.201651  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.44 
 
 		 370 aa  57  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  31.07 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3835  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.08 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1536  GTPase ObgE  34.55 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  36.36 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4729  tRNA modification GTPase TrmE  28.11 
 
 		 454 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2789  small GTP-binding protein  35.85 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  35.24 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  34.44 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.33 
 
 		 435 aa  56.2  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  34.91 
 
 		 470 aa  56.2  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1470  GTPase ObgE  35.94 
 
 		 435 aa  55.8  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3106  GTP-binding protein EngA  34.48 
 
 		 479 aa  55.8  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.564911 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29231  predicted protein  38.46 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  33.08 
 
 		 430 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000454316  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2892  GTPase family protein  32.16 
 
 		 463 aa  55.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.03 
 
 		 426 aa  55.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0895  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.08 
 
 		 453 aa  55.8  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000142797  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  35.05 
 
 		 367 aa  55.5  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0292  GTP-binding protein EngA  29.81 
 
 		 494 aa  55.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1504  GTPase ObgE  30.36 
 
 		 405 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.33 
 
 		 482 aa  55.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.33 
 
 		 434 aa  55.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1686  GTP-binding protein EngA  30.59 
 
 		 460 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0325003  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  30.36 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  29.95 
 
 		 435 aa  55.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60445  GTPase ObgE  39.51 
 
 		 406 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233536 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0104  tRNA modification GTPase TrmE  31.87 
 
 		 462 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  39.51 
 
 		 405 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5206  GTPase ObgE  39.51 
 
 		 406 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.683682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>