More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0752 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  100 
 
 		 344 aa  693    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  80.81 
 
 		 351 aa  601  1.0000000000000001e-171  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  73.84 
 
 		 345 aa  554  1e-156  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  73.84 
 
 		 348 aa  552  1e-156  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  46.34 
 
 		 355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  39.93 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  37.26 
 
 		 334 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  40.58 
 
 		 306 aa  206  5e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  37.85 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  40.46 
 
 		 354 aa  183  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  40.07 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  32.56 
 
 		 640 aa  178  1e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  33.44 
 
 		 677 aa  177  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  38.03 
 
 		 322 aa  177  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  31.8 
 
 		 346 aa  176  8e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  31.8 
 
 		 346 aa  175  9e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  41.56 
 
 		 356 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  37.46 
 
 		 333 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  32.89 
 
 		 346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  42.37 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  36.47 
 
 		 664 aa  170  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  36.25 
 
 		 324 aa  170  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  34.5 
 
 		 347 aa  169  5e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  35.42 
 
 		 326 aa  169  6e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  38.89 
 
 		 331 aa  169  9e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  40.82 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  38.98 
 
 		 329 aa  166  8e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  33.01 
 
 		 666 aa  164  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  30.84 
 
 		 656 aa  163  5.0000000000000005e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  38.57 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  32.49 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  37.6 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  31.42 
 
 		 290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  30.07 
 
 		 455 aa  103  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  31.06 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  30.73 
 
 		 350 aa  67.4  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  30.51 
 
 		 397 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  31.43 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3514  GTPase ObgE  29.88 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3822  GTPase ObgE  29.88 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  30.43 
 
 		 372 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1618  GTPase ObgE  26.95 
 
 		 563 aa  65.1  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.664599  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  29.82 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  30.77 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  31.43 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  30.43 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  30.43 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  30.43 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  30.43 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  30.43 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  30.43 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3743  GTPase ObgE  35.14 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3609  GTPase ObgE  35.14 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696199  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3978  GTPase ObgE  35.14 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000165157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001671  GTP-binding protein Obg  31.79 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000343056  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  28.92 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  28.49 
 
 		 373 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  32.88 
 
 		 390 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3802  GTPase ObgE  28.57 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.499409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  32.88 
 
 		 390 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2581  GTPase ObgE  30.69 
 
 		 356 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.96662e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  32.88 
 
 		 390 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  32.88 
 
 		 390 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  32.88 
 
 		 390 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  29.63 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  34.13 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0524  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.88 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000179136  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  30.77 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  30.29 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0553  GTPase ObgE  29.83 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000106913  normal  0.0178049 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0101  GTPase ObgE  29.83 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3548  GTPase ObgE  29.02 
 
 		 485 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4505  GTPase ObgE  32.88 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000250571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0248  GTPase ObgE  33.99 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3553  GTPase ObgE  29.02 
 
 		 485 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0583  GTPase ObgE  29.83 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3621  GTPase ObgE  29.02 
 
 		 485 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  27.45 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2800  GTPase ObgE  30.22 
 
 		 369 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0270558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13035  predicted protein  29.14 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163002  normal  0.451283 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2061  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.04 
 
 		 488 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  31.03 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0498  GTPase ObgE  30.41 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000072734  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1681  GTPase ObgE  30.41 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00207916  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0511  GTPase ObgE  29.83 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166146  normal  0.91816 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00802  GTPase ObgE  31.21 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2855  GTPase ObgE  29.48 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000349951  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0486  GTPase ObgE  29.83 
 
 		 370 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165624  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0363  GTPase ObgE  31.14 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0223104  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  34.01 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  27.93 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3357  GTPase ObgE  33.56 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0207536  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0749  GTPase ObgE  28.09 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709359 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0283  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.81 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  28.74 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0460  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.81 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177259 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  29.89 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  28.49 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  27.59 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3476  GTPase ObgE  30.77 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000303711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>