More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2010 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  100 
 
 		 348 aa  704    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  78.55 
 
 		 345 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  73.84 
 
 		 344 aa  552  1e-156  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  75.65 
 
 		 351 aa  548  1e-155  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  47.87 
 
 		 355 aa  315  6e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  42.25 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  41.73 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  40.51 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  40.49 
 
 		 322 aa  189  7e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  38.38 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  37.24 
 
 		 326 aa  186  4e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  35.69 
 
 		 333 aa  186  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  33.03 
 
 		 346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  33.12 
 
 		 346 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  33.44 
 
 		 346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  41.56 
 
 		 356 aa  182  6e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  38.01 
 
 		 354 aa  182  6e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  36.42 
 
 		 340 aa  182  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  33.33 
 
 		 347 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  31.17 
 
 		 640 aa  176  4e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  37.65 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  39.3 
 
 		 329 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  34.24 
 
 		 664 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  39.1 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  38.4 
 
 		 332 aa  172  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  35.74 
 
 		 329 aa  172  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  33.02 
 
 		 677 aa  169  9e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  38.11 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  37.72 
 
 		 666 aa  165  9e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  33.57 
 
 		 338 aa  162  9e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  30.14 
 
 		 656 aa  156  5.0000000000000005e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  37.31 
 
 		 331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  30.88 
 
 		 290 aa  135  7.000000000000001e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  28.27 
 
 		 455 aa  102  8e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  35.03 
 
 		 365 aa  75.9  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  34.24 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  34.24 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  34.24 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  34.25 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  34.24 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  34.24 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  34.24 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  34.24 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  33.14 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0511  GTPase ObgE  34.81 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166146  normal  0.91816 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  34.62 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0486  GTPase ObgE  34.81 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165624  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  33.33 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  31.46 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0101  GTPase ObgE  33.7 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0583  GTPase ObgE  33.7 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0553  GTPase ObgE  33.7 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000106913  normal  0.0178049 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  30.93 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  28.65 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  32.97 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  32.42 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2800  GTPase ObgE  32.97 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0270558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  33.53 
 
 		 353 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  34.43 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1631  GTPase ObgE  32.76 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001671  GTP-binding protein Obg  32.74 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000343056  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1618  GTPase ObgE  30.35 
 
 		 563 aa  68.2  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.664599  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  32.97 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  31.67 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  33.16 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  32.6 
 
 		 362 aa  67  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00802  GTPase ObgE  32.14 
 
 		 391 aa  67  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3476  GTPase ObgE  34.75 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000303711  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3357  GTPase ObgE  36 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0207536  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2248  GTPase ObgE  37.16 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0879905  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  30.05 
 
 		 343 aa  67.4  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  29.74 
 
 		 358 aa  67  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2056  GTPase ObgE  32.53 
 
 		 366 aa  67  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.520405  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0268  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.22 
 
 		 375 aa  66.6  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3065  GTPase ObgE  32.28 
 
 		 364 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2655  GTPase ObgE  32.28 
 
 		 364 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.031606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  32.95 
 
 		 434 aa  66.2  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0527  GTPase ObgE  32.2 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2855  GTPase ObgE  31.79 
 
 		 395 aa  65.9  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000349951  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  33.61 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0363  GTPase ObgE  33.14 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0223104  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0460  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.23 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177259 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2248  GTPase ObgE  32.77 
 
 		 345 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000169157  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0956  GTPase ObgE  32.97 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  30.81 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3598  GTPase ObgE  34.06 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1006  GTPase ObgE  31.46 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134861  decreased coverage  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3493  GTPase ObgE  34.06 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3491  GTPase ObgE  34.06 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000240056  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3562  GTPase ObgE  34.06 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.238363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0283  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.23 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  30.19 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3660  GTPase ObgE  34.06 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0449011  normal  0.0890894 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0561  GTPase ObgE  34.93 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00587502  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0796  GTPase ObgE  34.93 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000620978  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  31.1 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  34.27 
 
 		 435 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.93 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  33.73 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  34.27 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>