More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0546 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 		 329 aa  669    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  73.03 
 
 		 322 aa  489  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  66.57 
 
 		 329 aa  432  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  64.88 
 
 		 331 aa  422  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  60.73 
 
 		 328 aa  394  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  43.03 
 
 		 333 aa  277  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  46.44 
 
 		 356 aa  261  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  44.87 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  39.25 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  41.61 
 
 		 340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  41.1 
 
 		 330 aa  230  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  39.16 
 
 		 354 aa  224  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  40.38 
 
 		 324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  35.74 
 
 		 317 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  34.33 
 
 		 346 aa  202  5e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  35.55 
 
 		 347 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  34.88 
 
 		 346 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  34.55 
 
 		 346 aa  200  3e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  38.49 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  35.74 
 
 		 348 aa  172  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  30.79 
 
 		 640 aa  169  4e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  36.21 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  38.98 
 
 		 344 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  37.25 
 
 		 666 aa  163  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  31.02 
 
 		 656 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  33.79 
 
 		 355 aa  160  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  34.68 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.739861 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  35.17 
 
 		 332 aa  156  6e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  32.1 
 
 		 664 aa  154  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  30.54 
 
 		 677 aa  150  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  30.23 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  31.83 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  30.04 
 
 		 290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  27 
 
 		 455 aa  98.2  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  37.78 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  39.53 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  38.37 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.95 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1705  GTPase ObgE  31.18 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.074389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  32.18 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  39.53 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  32.8 
 
 		 434 aa  62  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3835  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.56 
 
 		 346 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  35.87 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.82 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  33.61 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  36.81 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.61 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  36.36 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  36.96 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  34.38 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  28.97 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  28.97 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  46.43 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  30.43 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  43.86 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  32.35 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  32.26 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3727  ribosome-associated GTPase EngA  35.26 
 
 		 518 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.54 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.25 
 
 		 434 aa  57  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  42.11 
 
 		 424 aa  57  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0076  GTP-binding protein EngA  31.76 
 
 		 490 aa  56.6  0.0000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0791238  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2892  GTPase family protein  33.08 
 
 		 463 aa  56.2  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3895  GTPase ObgE  29.34 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2981  GTP-binding protein EngA  30.18 
 
 		 443 aa  56.2  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02977  GTP-binding protein EngA  29.79 
 
 		 481 aa  56.2  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  29.6 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0505  GTPase ObgE  26.34 
 
 		 435 aa  55.8  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  40.35 
 
 		 424 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1951  ferrous iron transport protein B  35.11 
 
 		 654 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  39.66 
 
 		 371 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2399  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.3 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  36.78 
 
 		 407 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  40.35 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  40.35 
 
 		 369 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  25.81 
 
 		 364 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  40.35 
 
 		 369 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  31.82 
 
 		 363 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18250  GTPase ObgE  40.58 
 
 		 509 aa  55.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  40.35 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45203  predicted protein  31.37 
 
 		 457 aa  54.3  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.017445  normal  0.182069 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  38.57 
 
 		 517 aa  54.3  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  27.64 
 
 		 637 aa  54.3  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  40.35 
 
 		 367 aa  54.3  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  25.75 
 
 		 458 aa  53.9  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  40.58 
 
 		 513 aa  53.5  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  31.53 
 
 		 367 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  34.41 
 
 		 371 aa  53.5  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  31.43 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  32.28 
 
 		 439 aa  53.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0535  GTP-binding protein  30.07 
 
 		 227 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.981766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  40.58 
 
 		 505 aa  53.5  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  41.82 
 
 		 328 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  31.55 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2258  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.13 
 
 		 503 aa  53.1  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.979161  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0185  GTPase ObgE  42.86 
 
 		 347 aa  53.1  0.000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1384  GTP-binding protein  30.07 
 
 		 227 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.304581  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0638  small GTP-binding protein  29.63 
 
 		 328 aa  52.8  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4265  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.38 
 
 		 454 aa  52.8  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256023  normal  0.274085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>