More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1688 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  100 
 
 		 332 aa  669    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  51.54 
 
 		 331 aa  339  2.9999999999999998e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  37.41 
 
 		 317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  34.4 
 
 		 322 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  38.4 
 
 		 348 aa  172  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  39.41 
 
 		 345 aa  172  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  38.57 
 
 		 351 aa  170  3e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  34.76 
 
 		 333 aa  169  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  39.11 
 
 		 306 aa  168  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  38.57 
 
 		 344 aa  161  1e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  33.44 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  32.06 
 
 		 664 aa  160  4e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  32.51 
 
 		 329 aa  159  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  32.29 
 
 		 331 aa  159  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  35.61 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  34.56 
 
 		 356 aa  156  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  35.17 
 
 		 329 aa  156  6e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  34.23 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  30.71 
 
 		 640 aa  149  7e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  33.14 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  34.33 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  29.25 
 
 		 677 aa  147  3e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  35.29 
 
 		 355 aa  146  6e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  32.07 
 
 		 346 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  32.74 
 
 		 347 aa  144  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  32.26 
 
 		 346 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  29.28 
 
 		 656 aa  142  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  31.85 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  29.64 
 
 		 666 aa  139  7.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  32.8 
 
 		 324 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  30.54 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  32.72 
 
 		 290 aa  132  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  34.35 
 
 		 354 aa  130  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  24.44 
 
 		 455 aa  89.7  5e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  36.21 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  33.17 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  27.01 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  33.33 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.59 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2248  GTPase ObgE  32 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0879905  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1378  GTPase ObgE  29.82 
 
 		 368 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  32.6 
 
 		 370 aa  67  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0191  TGS domain-containing protein  25.29 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230896 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  33.88 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  33.7 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.09 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1498  GTP-binding protein EngA  32.12 
 
 		 462 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  50 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  32.28 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45203  predicted protein  32.92 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.017445  normal  0.182069 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1485  GTP-binding protein EngA  31.1 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4324  tRNA modification GTPase TrmE  27.1 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0616134  unclonable  0.00000000000430527 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1986  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.92 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4378  tRNA modification GTPase TrmE  27.07 
 
 		 453 aa  63.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0292979  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  33.58 
 
 		 353 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0008  tRNA modification GTPase TrmE  27.42 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.185087  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4379  tRNA modification GTPase TrmE  27.1 
 
 		 479 aa  63.2  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000434128  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  32.93 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  34.85 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4520  tRNA modification GTPase TrmE  27.07 
 
 		 453 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.30842  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2800  GTPase ObgE  31.11 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0270558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  38.64 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2285  GTPase ObgE  30.51 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.397881  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0003  tRNA modification GTPase TrmE  27.04 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  34.09 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2180  GTPase ObgE  28.42 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236885  normal  0.801258 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  31.67 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  32.84 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  32.14 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  32.95 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  31.87 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4091  GTPase ObgE  33.91 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  29.09 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0292  GTP-binding protein EngA  25.88 
 
 		 494 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2309  GTPase ObgE  32.02 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000014819  normal  0.214603 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  32.2 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0088  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.73 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00208899  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  22.41 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0165  GTPase ObgE  30.48 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0020  GTPase ObgE  28.26 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0676  GTPase ObgE  41.67 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3865  tRNA modification GTPase TrmE  26.92 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000363316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.72 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  30.22 
 
 		 353 aa  59.7  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  30.17 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  46.3 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  30.77 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0101  GTPase ObgE  31.87 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0504  GTP-binding protein Obg/CgtA  51.72 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0553  GTPase ObgE  31.11 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000106913  normal  0.0178049 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0583  GTPase ObgE  31.11 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  46.3 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0267  hypothetical protein  32.56 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.757423 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  27.52 
 
 		 427 aa  59.3  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4001  tRNA modification GTPase TrmE  27.04 
 
 		 453 aa  59.3  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.73411  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4062  tRNA modification GTPase TrmE  26.77 
 
 		 453 aa  59.3  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112278  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4256  tRNA modification GTPase TrmE  26.13 
 
 		 453 aa  59.3  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257081  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  30.77 
 
 		 373 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4247  GTP-binding protein EngA  28.75 
 
 		 498 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0511  GTPase ObgE  31.32 
 
 		 370 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166146  normal  0.91816 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>