More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2208 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  100 
 
 		 345 aa  702    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  78.55 
 
 		 348 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  75.29 
 
 		 351 aa  555  1e-157  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  73.84 
 
 		 344 aa  554  1e-156  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  46.96 
 
 		 355 aa  318  1e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  39.79 
 
 		 317 aa  218  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  39.21 
 
 		 306 aa  210  3e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  38.1 
 
 		 334 aa  209  7e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  35.83 
 
 		 354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  31.8 
 
 		 346 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  33.22 
 
 		 346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  35.19 
 
 		 333 aa  179  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  36.84 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  36.5 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  30.89 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  31.38 
 
 		 347 aa  176  6e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  35.13 
 
 		 677 aa  175  8e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  34.86 
 
 		 330 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  38.73 
 
 		 322 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  29.31 
 
 		 640 aa  174  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  38.35 
 
 		 356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  39.41 
 
 		 332 aa  172  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  40.16 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  32.53 
 
 		 664 aa  171  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  35.8 
 
 		 324 aa  169  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  38.28 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  34.8 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  38.01 
 
 		 331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  34.13 
 
 		 666 aa  163  3e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  34.68 
 
 		 329 aa  160  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  27.11 
 
 		 656 aa  157  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  34.04 
 
 		 338 aa  155  7e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  33.9 
 
 		 290 aa  145  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  30.34 
 
 		 455 aa  110  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1303  GTPase ObgE  33.16 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2521  GTPase ObgE  33.16 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.685664  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0444  GTPase ObgE  33.16 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3522  GTPase ObgE  33.16 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.091064  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3260  GTPase ObgE  33.16 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2650  GTPase ObgE  33.52 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0689213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3487  GTPase ObgE  33.16 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3524  GTPase ObgE  33.16 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4056  GTPase ObgE  31.58 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.747306 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  31.43 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2855  GTPase ObgE  32.95 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000349951  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0527  GTPase ObgE  32.75 
 
 		 386 aa  67  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1618  GTPase ObgE  27.64 
 
 		 563 aa  66.6  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.664599  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3187  GTPase ObgE  30.46 
 
 		 350 aa  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3736  GTPase ObgE  36.42 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0046392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3035  GTPase ObgE  29.94 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.736033  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3668  GTPase ObgE  33.92 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0100142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1142  GTPase ObgE  33.7 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  36.81 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0509  GTPase ObgE  34.81 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1006  GTPase ObgE  32.02 
 
 		 389 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134861  decreased coverage  0.00000589779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3472  GTPase ObgE  29.69 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.004996  normal  0.428622 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  34.29 
 
 		 365 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1466  GTPase ObgE  30.3 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.913357  normal  0.0387806 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0214  GTPase ObgE  32.78 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301302 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0511  GTPase ObgE  32.57 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166146  normal  0.91816 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0486  GTPase ObgE  32.57 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.165624  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3447  GTPase ObgE  32.97 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179081  hitchhiker  0.00548922 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  33.14 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1480  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.75 
 
 		 348 aa  62.8  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3419  GTPase ObgE  31.21 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  32.22 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0703  GTPase ObgE  34.44 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.718504 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001671  GTP-binding protein Obg  32.53 
 
 		 391 aa  62.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000343056  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0543  GTPase ObgE  31.13 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0101  GTPase ObgE  33.92 
 
 		 370 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3087  GTPase ObgE  31.38 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2800  GTPase ObgE  31.98 
 
 		 369 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0270558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13035  predicted protein  29.76 
 
 		 305 aa  62.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163002  normal  0.451283 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0690  GTPase ObgE  33.88 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3649  GTPase ObgE  35.04 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  27.03 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  31.18 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0363  GTPase ObgE  36.11 
 
 		 392 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0223104  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0553  GTPase ObgE  33.92 
 
 		 370 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000106913  normal  0.0178049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2283  GTPase ObgE  30.97 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.79982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1010  GTPase ObgE  30.56 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000125239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0157  GTPase ObgE  34.06 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.526376  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40770  GTPase ObgE  32.58 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0722  GTPase ObgE  33.88 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320956 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0854  GTPase ObgE  32.54 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000429069  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4495  GTPase ObgE  33.7 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.589803  normal  0.496901 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0897  GTPase ObgE  31.95 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00842399  normal  0.946957 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3123  GTPase ObgE  31.95 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0347517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0583  GTPase ObgE  33.92 
 
 		 370 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0349123  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3217  GTPase ObgE  31.95 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000011291  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0799  GTP-binding protein, GTP1/Obg family  33.7 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  32.4 
 
 		 350 aa  60.8  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1683  GTPase ObgE  35.82 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0638359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0722  GTPase ObgE  33.88 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91341 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4236  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.64 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000643018  hitchhiker  0.00000182471 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0268  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.39 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1504  GTPase ObgE  35.82 
 
 		 405 aa  60.5  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  34.93 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2056  GTPase ObgE  30.54 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.520405  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.58 
 
 		 680 aa  60.5  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>