More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2164 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  100 
 
 		 333 aa  681    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  65.08 
 
 		 356 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  51.11 
 
 		 328 aa  312  4.999999999999999e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  50.31 
 
 		 329 aa  310  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  46.73 
 
 		 306 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  46.65 
 
 		 331 aa  299  4e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  47 
 
 		 322 aa  280  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  43.37 
 
 		 330 aa  278  7e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  43.03 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  43.28 
 
 		 354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  45.17 
 
 		 340 aa  269  5e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  44.41 
 
 		 326 aa  264  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  43.34 
 
 		 317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  41.72 
 
 		 324 aa  252  6e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  39.22 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  39.52 
 
 		 346 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  38.69 
 
 		 347 aa  249  4e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  39.22 
 
 		 346 aa  249  7e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  40.14 
 
 		 338 aa  207  1e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  35.69 
 
 		 348 aa  186  5e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  31.32 
 
 		 664 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  35.19 
 
 		 345 aa  179  5.999999999999999e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  35.96 
 
 		 640 aa  174  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  37.46 
 
 		 344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.741374 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  32.52 
 
 		 656 aa  172  9e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  36.96 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  31.32 
 
 		 666 aa  172  1e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  34.48 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  33 
 
 		 677 aa  170  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  34.76 
 
 		 332 aa  169  7e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  38.3 
 
 		 355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  32.08 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  31.39 
 
 		 290 aa  135  7.000000000000001e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  25.46 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1222  Obg family GTPase CgtA  28.92 
 
 		 560 aa  80.1  0.00000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000289684 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.14 
 
 		 458 aa  78.2  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  33.15 
 
 		 435 aa  72  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  30.77 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.33 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0157  GTPase ObgE  29.47 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.41 
 
 		 517 aa  70.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1618  GTPase ObgE  27.8 
 
 		 563 aa  70.9  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.664599  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  29.61 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  32.04 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.61 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.34 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  28.99 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  28.81 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3944  GTPase ObgE  30.35 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0423  GTPase ObgE  29.55 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0020  GTPase ObgE  29.41 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.82 
 
 		 417 aa  65.9  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.69 
 
 		 463 aa  66.2  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1189  GTPase ObgE  29.29 
 
 		 488 aa  65.9  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1475  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.43 
 
 		 486 aa  65.9  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2258  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.35 
 
 		 503 aa  65.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.979161  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1027  GTPase ObgE  30.3 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2458  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.65 
 
 		 450 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  32.79 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  29.15 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  28.3 
 
 		 519 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  26.32 
 
 		 505 aa  64.7  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0251  GTPase ObgE  27.86 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4148  tRNA modification GTPase TrmE  35.76 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.421634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3458  GTPase ObgE  28.22 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  29.51 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.44 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.59 
 
 		 463 aa  64.3  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0584  GTPase ObgE  28.36 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3548  GTPase ObgE  29.76 
 
 		 485 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3621  GTPase ObgE  29.76 
 
 		 485 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3553  GTPase ObgE  29.76 
 
 		 485 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  29.8 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  28.72 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1650  GTPase ObgE  27.46 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420929  hitchhiker  0.000176178 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2399  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.73 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2637  GTPase ObgE  29.35 
 
 		 482 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.869058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3858  GTPase ObgE  27.6 
 
 		 481 aa  63.2  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.4 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5478  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.13 
 
 		 480 aa  62.8  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  31.07 
 
 		 439 aa  62.4  0.000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  31.95 
 
 		 424 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  31.58 
 
 		 424 aa  62  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3479  GTPase ObgE  28.88 
 
 		 481 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.395045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  31.97 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0517  GTPase ObgE  28.95 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3577  GTP1/OBG domain-containing protein  29.89 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0895  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.27 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000142797  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3835  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.94 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3073  tRNA modification GTPase TrmE  29.38 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  34.09 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  0.00000000000109453 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0233  GTPase ObgE  29.08 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4198  GTPase ObgE  28.92 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.501209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3874  GTPase ObgE  28.16 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00849027 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.78 
 
 		 482 aa  61.2  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000715993  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10130  GTPase ObgE  26.57 
 
 		 515 aa  61.6  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.398815  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1559  TGS domain-containing protein  26.82 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.397282  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  26.32 
 
 		 513 aa  60.8  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3350  GTP1/OBG domain-containing protein  31.03 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12467  GTPase ObgE  28.43 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.642368  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>