More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0391 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  100 
 
 		 334 aa  675    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  40.51 
 
 		 348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  37.26 
 
 		 344 aa  212  7.999999999999999e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  38.1 
 
 		 345 aa  209  7e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  35.62 
 
 		 346 aa  208  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  35 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  35.93 
 
 		 355 aa  203  4e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  35 
 
 		 346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  34.97 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  40 
 
 		 351 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  39.3 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  35.59 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  34.72 
 
 		 677 aa  179  9e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  37.07 
 
 		 338 aa  175  9e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  33.46 
 
 		 664 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  34.48 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  31.99 
 
 		 656 aa  169  7e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  37.37 
 
 		 322 aa  169  8e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  30.56 
 
 		 666 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  32.95 
 
 		 640 aa  166  4e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  34.18 
 
 		 330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  35.71 
 
 		 329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  33.56 
 
 		 356 aa  162  7e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  34.52 
 
 		 331 aa  162  7e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  37.4 
 
 		 331 aa  162  8.000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  35.59 
 
 		 328 aa  159  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  32.54 
 
 		 354 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  35.61 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  34.59 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  30.23 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  35.06 
 
 		 326 aa  146  5e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  33.69 
 
 		 324 aa  143  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  31.14 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  26.73 
 
 		 455 aa  107  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  34.03 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.93 
 
 		 415 aa  66.2  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000093637  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  30 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.12 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0117  tRNA modification GTPase TrmE  31.71 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.11 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0895  GTP-binding protein Obg/CgtA  29.38 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000142797  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0002  GTPase ObgE  52.46 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  31.4 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_2  GTP-binding protein, GTP1/OBG family  51.67 
 
 		 424 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  38.37 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2218  GTPase ObgE  32.84 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1498  GTP-binding protein EngA  29.94 
 
 		 462 aa  59.3  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0002  GTPase ObgE  31.43 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1485  GTP-binding protein EngA  30.95 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  50.88 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  50.88 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  37.93 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  50.88 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  36.05 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  46.55 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4633  GTP-binding protein EngA  32.34 
 
 		 511 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2007  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.37 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.339199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3835  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.25 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2526  TGS domain-containing protein  34.51 
 
 		 328 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00530169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  36.05 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  47.37 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  49.12 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  51.92 
 
 		 330 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  37.93 
 
 		 363 aa  57  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  45.61 
 
 		 370 aa  57  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1422  ribosome-associated GTPase EngA  29.82 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  51.92 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  34.83 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  30.66 
 
 		 680 aa  56.6  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  41.18 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0343  GTPase ObgE  29.44 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591605  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  37.78 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14801  GTP-binding protein Era  29.88 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0680  GTP-binding protein Era  30.18 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  47.37 
 
 		 367 aa  56.2  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0469  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.54 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1201  hypothetical protein  30.48 
 
 		 455 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00128445 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0847  GTP1/OBG domain-containing protein  31.91 
 
 		 358 aa  55.8  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1291  GTP-binding protein Era  33.73 
 
 		 449 aa  55.8  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.537318 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  30.06 
 
 		 294 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  34.15 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4365  tRNA modification GTPase TrmE  31.9 
 
 		 461 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  34.15 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  34.97 
 
 		 441 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  36 
 
 		 300 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  34.15 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3324  tRNA modification GTPase TrmE  29.79 
 
 		 461 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  37.93 
 
 		 369 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14661  GTP-binding protein Era  29.27 
 
 		 303 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0958  small GTP-binding protein  32.41 
 
 		 365 aa  54.7  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  45.61 
 
 		 371 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0191  TGS domain-containing protein  27.78 
 
 		 329 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230896 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0106  tRNA modification GTPase TrmE  32.84 
 
 		 457 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.446893  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  33.71 
 
 		 368 aa  54.7  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2181  GTP-binding protein Era  31.33 
 
 		 451 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.49 
 
 		 426 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2734  tRNA modification GTPase TrmE  28.48 
 
 		 459 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  34.48 
 
 		 364 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1999  GTP-binding protein Era  29.09 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00245097  normal  0.170992 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2791  tRNA modification GTPase TrmE  28.48 
 
 		 459 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>