More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2933 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2933  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 
324 aa  659    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000336633  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2103  small GTP-binding protein  58.97 
 
 
330 aa  387  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1923  small GTP-binding protein  57.94 
 
 
326 aa  361  1e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1570  small GTP-binding protein  57.19 
 
 
354 aa  360  2e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0641  hypothetical protein  55.73 
 
 
340 aa  359  3e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2164  GTP-binding protein  41.72 
 
 
333 aa  263  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.311194  normal  0.912911 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0267  nucleolar GTP-binding 1  42.53 
 
 
306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.809465  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1887  GTP-binding protein  42.45 
 
 
356 aa  246  4e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3556  GTP-binding protein HSR1-related protein  41.96 
 
 
329 aa  245  6.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2297  GTP-binding protein HSR1-related  42.26 
 
 
328 aa  239  4e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.754733 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1571  GTP-binding protein HSR1-related protein  40.69 
 
 
331 aa  238  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0546  GTP-binding protein HSR1-related  40.38 
 
 
329 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.879675  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0093  small GTP-binding protein  38.76 
 
 
317 aa  222  7e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.333043  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  38.89 
 
 
322 aa  217  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0020  small GTP-binding protein  38.49 
 
 
347 aa  215  7e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0148  small GTP-binding protein  38.28 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0331774  normal  0.033756 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0708  small GTP-binding protein  37.95 
 
 
346 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1755  small GTP-binding protein  37.27 
 
 
346 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  41.01 
 
 
338 aa  211  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0918  small GTP-binding protein  40.34 
 
 
351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.259421  normal  0.0321262 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2010  small GTP-binding protein  37.65 
 
 
348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0504826 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0752  small GTP-binding protein  36.25 
 
 
344 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.741374 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2208  small GTP-binding protein  35.8 
 
 
345 aa  181  1e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.739861 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75790  predicted protein  31.23 
 
 
640 aa  171  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.113893  normal  0.814262 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05865  nucleolar GTP-binding protein (Nog1), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11510)  31.16 
 
 
656 aa  167  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.181849  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  30.47 
 
 
664 aa  162  8.000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1306  small GTP-binding protein  33.67 
 
 
355 aa  160  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.294825  normal  0.393807 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01880  nucleolar GTP-binding protein 1, putative  29.58 
 
 
666 aa  160  3e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30365  predicted protein  30.58 
 
 
677 aa  152  8e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.660335  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1688  small GTP-binding protein  32.8 
 
 
332 aa  150  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0391  small GTP-binding protein  33.69 
 
 
334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1975  small GTP-binding protein  32.51 
 
 
331 aa  145  6e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_3188  predicted protein  27.51 
 
 
290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43105  predicted protein  32.2 
 
 
455 aa  95.5  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2170  GTP-binding protein HSR1-related  36.23 
 
 
324 aa  70.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000924799 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  33.89 
 
 
427 aa  70.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000127765  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.6 
 
 
458 aa  69.3  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2429  small GTP-binding protein  37.21 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1181  small GTP-binding protein  33.96 
 
 
370 aa  66.2  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  32 
 
 
370 aa  65.1  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1945  small GTP-binding protein  34.88 
 
 
368 aa  64.7  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0250  small GTP-binding protein  32.08 
 
 
370 aa  64.3  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.829825  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  29.3 
 
 
370 aa  64.7  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50671  predicted protein  37.21 
 
 
407 aa  63.2  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0728  GTP-binding protein Obg/CgtA  33.59 
 
 
356 aa  62.8  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.199071 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  33.53 
 
 
338 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0754  small GTP-binding protein  42.11 
 
 
369 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0780  GTPase  30.59 
 
 
303 aa  60.5  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00998411  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0688  small GTP-binding protein  42.11 
 
 
369 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.629301  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1553  small GTP-binding protein  27.22 
 
 
822 aa  60.1  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00130117  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0574  GTP-binding protein  33.33 
 
 
364 aa  59.7  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.437415  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0135  small GTP-binding protein  42.11 
 
 
369 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0782  small GTP-binding protein  33.02 
 
 
371 aa  59.7  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1230  small GTP-binding protein  42.11 
 
 
369 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35696  predicted protein  34.88 
 
 
410 aa  59.3  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0684  small GTP-binding protein  31.03 
 
 
369 aa  58.9  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02244  GTP binding protein (Gtp1), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06770)  33.01 
 
 
367 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  30.37 
 
 
435 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02790  cytoplasm protein, putative  30.63 
 
 
368 aa  58.9  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0463275  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0627  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.03 
 
 
370 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0262779  normal  0.220202 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  35.23 
 
 
371 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1556  tRNA modification GTPase TrmE  28.18 
 
 
464 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1871  GTPase ObgE  31.93 
 
 
338 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1541  small GTP-binding protein  32.18 
 
 
363 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1523  GTPase ObgE  32.48 
 
 
411 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  28.66 
 
 
419 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1762  GTP-binding protein HSR1-related  31.51 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_20124  predicted protein  33.59 
 
 
400 aa  57.8  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.902407  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02641  tRNA modification GTPase TrmE  28.73 
 
 
464 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  28.42 
 
 
434 aa  57.4  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2226  GTP-binding protein Obg/CgtA  28.57 
 
 
416 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00929863  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  31.03 
 
 
371 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  30.83 
 
 
423 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03250  cytoplasm protein, putative  33.01 
 
 
367 aa  57.4  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.594558  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  29.84 
 
 
435 aa  57  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  27.81 
 
 
427 aa  57.4  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1908  tRNA modification GTPase TrmE  31.69 
 
 
464 aa  57.4  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.991823  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0871  small GTP-binding protein  32.94 
 
 
367 aa  57  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.548847  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2445  GTPase ObgE  28.12 
 
 
337 aa  57  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42420  predicted protein  31.82 
 
 
368 aa  56.6  0.0000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.257266  normal  0.210698 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  32.81 
 
 
680 aa  56.6  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  27.98 
 
 
303 aa  56.6  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  30.39 
 
 
338 aa  56.2  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312232  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09700  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  27.87 
 
 
438 aa  56.6  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.253075  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81735  predicted protein  30.09 
 
 
367 aa  56.6  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1842  TGS domain protein  30.82 
 
 
330 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.2616  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2453  tRNA modification GTPase TrmE  31.25 
 
 
450 aa  55.8  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  27.17 
 
 
296 aa  55.8  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0314  tRNA modification GTPase TrmE  30.63 
 
 
450 aa  55.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00576337  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2114  GTP-binding protein, HSR1-related  31.54 
 
 
330 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_13035  predicted protein  33.33 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0163002  normal  0.451283 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0191  TGS domain-containing protein  35.23 
 
 
329 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230896 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3835  GTP-binding protein Obg/CgtA  31.16 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  30.36 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04098  tRNA modification GTPase  28.18 
 
 
462 aa  54.7  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0866  GTPase ObgE  35.2 
 
 
350 aa  54.7  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0442  GTPase ObgE  29.38 
 
 
358 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3560  tRNA modification GTPase TrmE  28.22 
 
 
457 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1618  GTPase ObgE  30.69 
 
 
563 aa  55.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.664599  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0505  GTPase ObgE  30.34 
 
 
435 aa  54.7  0.000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>