More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1553 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1553  small GTP-binding protein  100 
 
 
822 aa  1692    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00130117  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0646  small GTP-binding protein  44.61 
 
 
826 aa  731    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2063  ferrous iron transport protein B  34.35 
 
 
944 aa  517  1.0000000000000001e-145  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000695789  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  34.43 
 
 
720 aa  485  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2493  ferrous iron transport protein B  33.25 
 
 
743 aa  483  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9646  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0675  ferrous iron transport protein B  31.7 
 
 
732 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.183925  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2669  ferrous iron transport protein B  31.36 
 
 
725 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1585  ferrous iron transport protein B  32.13 
 
 
723 aa  437  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0104102  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  31.31 
 
 
724 aa  412  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0316  ferrous iron transport protein B  36.26 
 
 
725 aa  403  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000873753  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0012  ferrous iron transport protein B  34.8 
 
 
717 aa  389  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00299021  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1015  ferrous iron transport protein B  36.64 
 
 
759 aa  385  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.913336 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  38.55 
 
 
680 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  29.48 
 
 
712 aa  371  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  36.98 
 
 
688 aa  365  2e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  30.05 
 
 
712 aa  363  6e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  35.36 
 
 
844 aa  363  6e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1622  ferrous iron transport protein B  36.25 
 
 
722 aa  363  8e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.782227  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  36.45 
 
 
669 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  35.56 
 
 
711 aa  357  6.999999999999999e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  32.58 
 
 
741 aa  355  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  36.13 
 
 
829 aa  355  2.9999999999999997e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  34.6 
 
 
669 aa  353  5.9999999999999994e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1929  ferrous iron transport protein B  34.14 
 
 
712 aa  352  2e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000762105  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  28.96 
 
 
741 aa  352  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  34.43 
 
 
778 aa  350  7e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  35.04 
 
 
680 aa  350  8e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  34.43 
 
 
712 aa  348  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  35.98 
 
 
776 aa  348  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2213  ferrous iron transport protein B  29.62 
 
 
713 aa  348  2e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  32.53 
 
 
743 aa  347  5e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  33.88 
 
 
669 aa  347  6e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  37.43 
 
 
721 aa  346  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  33.95 
 
 
738 aa  345  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  36.83 
 
 
753 aa  344  2.9999999999999997e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  28.64 
 
 
753 aa  342  1e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  34.82 
 
 
676 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  34.33 
 
 
786 aa  340  9e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  36.75 
 
 
716 aa  339  9.999999999999999e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  36.48 
 
 
770 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  33.51 
 
 
666 aa  338  2.9999999999999997e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  35.82 
 
 
649 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  34.74 
 
 
715 aa  337  5e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  32.87 
 
 
665 aa  337  7e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  32.35 
 
 
712 aa  336  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  33.45 
 
 
747 aa  335  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  36.48 
 
 
770 aa  335  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2698  ferrous iron transport protein B  28.78 
 
 
780 aa  335  2e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.619661  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  34.7 
 
 
666 aa  333  8e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  31.11 
 
 
728 aa  332  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1729  ferrous iron transport protein B  33.44 
 
 
717 aa  331  3e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0580785 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2524  ferrous iron transport protein B  27.99 
 
 
766 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2152  ferrous iron transport protein B  27.97 
 
 
782 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.264076  hitchhiker  0.0000442692 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  31.36 
 
 
713 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0901  ferrous iron transport protein B  29.12 
 
 
708 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000608812  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  37.16 
 
 
714 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  32.89 
 
 
740 aa  328  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22730  ferrous iron transport protein B  34.56 
 
 
778 aa  325  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524583  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20050  ferrous iron transporter FeoB  34.31 
 
 
749 aa  325  2e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.558981  normal  0.661098 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  32.56 
 
 
740 aa  325  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  34.81 
 
 
691 aa  324  3e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0286  Fe2+ transport system protein B  33.99 
 
 
704 aa  323  7e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  32.52 
 
 
783 aa  323  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  36.48 
 
 
712 aa  322  1.9999999999999998e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  34.69 
 
 
774 aa  319  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  34.7 
 
 
774 aa  319  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  32.06 
 
 
697 aa  318  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  34.97 
 
 
676 aa  318  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  36.15 
 
 
665 aa  318  3e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1761  ferrous iron transport protein B  35.03 
 
 
711 aa  316  9.999999999999999e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  33.84 
 
 
786 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0169  ferrous iron transport protein B  32.19 
 
 
778 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  36.91 
 
 
664 aa  314  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  35.71 
 
 
665 aa  312  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  30.54 
 
 
668 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  33.39 
 
 
631 aa  304  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2414  ferrous iron transport protein B  33.16 
 
 
772 aa  300  9e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331306  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  30.66 
 
 
667 aa  299  1e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  30.84 
 
 
669 aa  299  1e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1973  ferrous iron transport protein B  28.43 
 
 
718 aa  299  2e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  31.78 
 
 
631 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0239  ferrous iron transport protein B  26.95 
 
 
816 aa  298  4e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  31.22 
 
 
664 aa  296  7e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2690  ferrous iron transport protein B  34.92 
 
 
764 aa  296  8e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.878145  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1959  ferrous iron transport protein B  26.65 
 
 
816 aa  296  1e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  31.96 
 
 
662 aa  296  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2759  ferrous iron transport protein B  31.75 
 
 
764 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383541  hitchhiker  0.00159456 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0441  ferrous iron transport protein B  32.21 
 
 
700 aa  295  2e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  31.97 
 
 
662 aa  295  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  31.97 
 
 
662 aa  295  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  31.97 
 
 
662 aa  295  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  31.96 
 
 
662 aa  295  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  31.96 
 
 
662 aa  294  5e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2670  ferrous iron transport protein B  32.52 
 
 
764 aa  293  7e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.360786  normal  0.0737302 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1583  ferrous iron transport protein B  31.69 
 
 
698 aa  293  1e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.983768  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2504  ferrous iron transport protein B  32.34 
 
 
764 aa  292  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112841  hitchhiker  0.00221536 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2616  ferrous iron transport protein B  31.41 
 
 
770 aa  292  2e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1618  ferrous iron transport protein B  31.4 
 
 
764 aa  292  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00477082  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1595  ferrous iron transport protein B  31.4 
 
 
764 aa  292  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000195581  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0259  ferrous iron transport protein B  32.47 
 
 
628 aa  292  2e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00038951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>