More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3268 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  100 
 
 
747 aa  1520    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  76.2 
 
 
743 aa  1172    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  48.34 
 
 
680 aa  684    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  70.64 
 
 
741 aa  1006    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  73.04 
 
 
713 aa  1075    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  70.17 
 
 
740 aa  1009    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  75.28 
 
 
738 aa  1085    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  75.14 
 
 
728 aa  1112    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  74.3 
 
 
741 aa  1132    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  69.7 
 
 
740 aa  996    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  46.98 
 
 
680 aa  634  1e-180  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  45.14 
 
 
676 aa  613  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0901  ferrous iron transport protein B  42.58 
 
 
708 aa  601  1e-170  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000608812  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  41.14 
 
 
669 aa  570  1e-161  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  41.03 
 
 
669 aa  569  1e-161  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  46.34 
 
 
676 aa  572  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  43.89 
 
 
665 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  42.16 
 
 
688 aa  560  1e-158  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  43.81 
 
 
666 aa  560  1e-158  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  43.76 
 
 
631 aa  556  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  43.02 
 
 
666 aa  555  1e-157  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  38.21 
 
 
724 aa  543  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  42.62 
 
 
664 aa  533  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  41.67 
 
 
662 aa  532  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  40.36 
 
 
665 aa  533  1e-150  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  41.33 
 
 
662 aa  533  1e-150  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  42.16 
 
 
649 aa  533  1e-150  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  41.08 
 
 
844 aa  531  1e-149  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  41.19 
 
 
662 aa  529  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  40.9 
 
 
631 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  41.44 
 
 
662 aa  529  1e-149  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  37.78 
 
 
711 aa  525  1e-148  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  41.19 
 
 
662 aa  527  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0894  ferrous iron transport protein B  43.96 
 
 
741 aa  526  1e-148  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.828262 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  40.97 
 
 
662 aa  525  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  40.75 
 
 
662 aa  523  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  41.05 
 
 
662 aa  521  1e-146  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  40.78 
 
 
662 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  40.92 
 
 
662 aa  519  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  40.92 
 
 
662 aa  519  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  39.83 
 
 
669 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0637  ferrous iron transport protein B  39.37 
 
 
739 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000736261  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  40.51 
 
 
778 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  40.21 
 
 
776 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  37.57 
 
 
664 aa  512  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  37.55 
 
 
712 aa  509  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  39.08 
 
 
712 aa  510  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1929  ferrous iron transport protein B  38.11 
 
 
712 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000762105  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  38.99 
 
 
786 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  38.78 
 
 
774 aa  504  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  37.11 
 
 
712 aa  504  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  38.08 
 
 
712 aa  504  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  38.52 
 
 
665 aa  505  1e-141  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  38.88 
 
 
774 aa  500  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  38.27 
 
 
786 aa  500  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  40.44 
 
 
662 aa  501  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  38.31 
 
 
664 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  38.31 
 
 
664 aa  499  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  39.14 
 
 
668 aa  496  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22730  ferrous iron transport protein B  41.32 
 
 
778 aa  497  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524583  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2213  ferrous iron transport protein B  37.52 
 
 
713 aa  498  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1729  ferrous iron transport protein B  36.65 
 
 
717 aa  498  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0580785 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  35.72 
 
 
829 aa  499  1e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  38.16 
 
 
783 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  39.29 
 
 
753 aa  493  9.999999999999999e-139  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  41.06 
 
 
770 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  40.81 
 
 
770 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  39.12 
 
 
766 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1959  ferrous iron transport protein B  37.22 
 
 
816 aa  483  1e-135  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2669  ferrous iron transport protein B  37.35 
 
 
725 aa  485  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  38.81 
 
 
715 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0239  ferrous iron transport protein B  37.35 
 
 
816 aa  484  1e-135  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  38.45 
 
 
714 aa  481  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  38.21 
 
 
721 aa  481  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  39.17 
 
 
766 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2152  ferrous iron transport protein B  37.37 
 
 
782 aa  475  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.264076  hitchhiker  0.0000442692 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  37.98 
 
 
720 aa  476  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2414  ferrous iron transport protein B  37.58 
 
 
772 aa  473  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331306  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2524  ferrous iron transport protein B  37.76 
 
 
766 aa  472  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0555  ferrous iron transport B domain-containing protein  46.58 
 
 
577 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  35.76 
 
 
697 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1761  ferrous iron transport protein B  36.17 
 
 
711 aa  468  9.999999999999999e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0890  ferrous iron transport protein B  36.18 
 
 
684 aa  467  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2690  ferrous iron transport protein B  38.42 
 
 
764 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.878145  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1622  ferrous iron transport protein B  36.78 
 
 
722 aa  463  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.782227  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2517  ferrous iron transport protein B  37.79 
 
 
764 aa  465  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.487661  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20050  ferrous iron transporter FeoB  38.57 
 
 
749 aa  461  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.558981  normal  0.661098 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1481  ferrous iron transport protein B  37.6 
 
 
764 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.725722  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3985  ferrous iron transport protein B  38.57 
 
 
771 aa  462  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3813  ferrous iron transport protein B  39.42 
 
 
772 aa  462  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3704  ferrous iron transport protein B  39.28 
 
 
772 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  37.42 
 
 
784 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  36.58 
 
 
691 aa  461  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0976  ferrous iron transport protein B  41.56 
 
 
676 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00114707  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3707  ferrous iron transport protein B  39.42 
 
 
772 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3779  ferrous iron transport protein B  39.42 
 
 
772 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0168  ferrous iron transport protein B  38.57 
 
 
771 aa  462  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426324  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3746  ferrous iron transport protein B  38.21 
 
 
771 aa  457  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1784  ferrous iron transport protein B  37.72 
 
 
764 aa  458  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4716  ferrous iron transport protein B  39.14 
 
 
773 aa  457  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>