More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2567 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  100 
 
 
753 aa  1503    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3827  ferrous iron transport protein B  42.36 
 
 
700 aa  590  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.792233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0784  ferrous iron transport protein B  41.06 
 
 
711 aa  567  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3726  ferrous iron transport protein B  41.9 
 
 
696 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0871  ferrous iron transport protein B  44.88 
 
 
716 aa  563  1.0000000000000001e-159  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1451  ferrous iron transport protein B  42.31 
 
 
705 aa  548  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0248254  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4234  ferrous iron transport protein B  43.36 
 
 
722 aa  528  1e-148  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.322995  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2698  ferrous iron transport protein B  39.95 
 
 
780 aa  511  1e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.619661  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0962  ferrous iron transport protein B  40.41 
 
 
699 aa  509  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5086  ferrous iron transport protein B  41.02 
 
 
712 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000565138  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03990  ferrous iron transport protein B-like protein  40.11 
 
 
699 aa  501  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.625523  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  39.57 
 
 
724 aa  496  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  39.41 
 
 
844 aa  493  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  39.22 
 
 
680 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  37.8 
 
 
665 aa  488  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  39.52 
 
 
680 aa  480  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  37.76 
 
 
712 aa  476  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0012  ferrous iron transport protein B  39.65 
 
 
717 aa  477  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00299021  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4039  ferrous iron transport protein B  40.41 
 
 
625 aa  478  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129654 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0623  ferrous iron transport protein B  38.9 
 
 
637 aa  478  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.356093  normal  0.228705 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1929  ferrous iron transport protein B  36.78 
 
 
712 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000762105  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1329  ferrous iron transport protein B  38.36 
 
 
637 aa  468  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  36.51 
 
 
712 aa  468  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  38.29 
 
 
666 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5116  ferrous iron transport protein B  40 
 
 
626 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2975  ferrous iron transport protein B  39.62 
 
 
626 aa  462  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.949455  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  37.09 
 
 
712 aa  464  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  37.43 
 
 
712 aa  465  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  38.26 
 
 
662 aa  464  1e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  39.59 
 
 
676 aa  462  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  36.19 
 
 
711 aa  458  1e-127  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  38.45 
 
 
666 aa  458  1e-127  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  38.65 
 
 
618 aa  456  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  37.28 
 
 
720 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0316  ferrous iron transport protein B  37.57 
 
 
725 aa  451  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000873753  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  37.11 
 
 
688 aa  449  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  34.77 
 
 
829 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1111  ferrous iron transport protein B  37.57 
 
 
626 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5890  Fe2+ transport system protein B  40.46 
 
 
620 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47490  ferrous iron transport protein B  40.03 
 
 
615 aa  444  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2493  ferrous iron transport protein B  37.63 
 
 
743 aa  444  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9646  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2213  ferrous iron transport protein B  36.05 
 
 
713 aa  445  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1015  ferrous iron transport protein B  39.17 
 
 
759 aa  445  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.913336 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0676  ferrous iron transport protein B  35.81 
 
 
636 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0954  ferrous iron transport protein B  39.12 
 
 
626 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  34.33 
 
 
743 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  36.41 
 
 
676 aa  436  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0251  ferrous IRON transport B transmembrane protein  38.81 
 
 
621 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.563283  normal  0.119264 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1058  ferrous iron transport protein B  38.57 
 
 
626 aa  439  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2176  ferrous iron transport protein B  40.25 
 
 
647 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0675  ferrous iron transport protein B  37.58 
 
 
732 aa  438  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.183925  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1729  ferrous iron transport protein B  34.86 
 
 
717 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0580785 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2434  ferrous iron transport protein B  38.71 
 
 
633 aa  430  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2669  ferrous iron transport protein B  36.53 
 
 
725 aa  432  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  35.73 
 
 
741 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  33.69 
 
 
664 aa  426  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  37.03 
 
 
665 aa  429  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1973  ferrous iron transport protein B  33.24 
 
 
718 aa  426  1e-118  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  35.55 
 
 
716 aa  427  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  37.13 
 
 
664 aa  429  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  34.53 
 
 
741 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  35.67 
 
 
740 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  34.85 
 
 
669 aa  425  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  35.18 
 
 
664 aa  425  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  35.18 
 
 
664 aa  425  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  34.19 
 
 
631 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  34.72 
 
 
669 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  35.33 
 
 
631 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1585  ferrous iron transport protein B  36.78 
 
 
723 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0104102  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  35.48 
 
 
740 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  33.08 
 
 
713 aa  415  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  33.96 
 
 
665 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  36.33 
 
 
738 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  35.07 
 
 
668 aa  411  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  34.95 
 
 
784 aa  412  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  36.22 
 
 
649 aa  410  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  37.65 
 
 
621 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1622  ferrous iron transport protein B  36.65 
 
 
722 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.782227  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  33.85 
 
 
728 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1583  ferrous iron transport protein B  34.84 
 
 
698 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.983768  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  34.62 
 
 
721 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  34.69 
 
 
691 aa  402  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  32.86 
 
 
747 aa  395  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  33.11 
 
 
662 aa  395  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1761  ferrous iron transport protein B  32.11 
 
 
711 aa  393  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  33.42 
 
 
753 aa  395  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  33.81 
 
 
712 aa  393  1e-108  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  32.45 
 
 
697 aa  392  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  35.36 
 
 
669 aa  390  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0976  ferrous iron transport protein B  37.11 
 
 
676 aa  389  1e-106  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00114707  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  33.82 
 
 
715 aa  385  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0441  ferrous iron transport protein B  31.3 
 
 
700 aa  382  1e-104  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  34.61 
 
 
783 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  32.88 
 
 
667 aa  380  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  32.54 
 
 
714 aa  382  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16120  ferrous iron transporter FeoB  34.35 
 
 
785 aa  381  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000453744 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  34.93 
 
 
848 aa  379  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  32.74 
 
 
669 aa  377  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  39.88 
 
 
770 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  38.34 
 
 
776 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>