More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0623 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01364  hypothetical protein  46.01 
 
 
758 aa  680    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  53.92 
 
 
774 aa  840    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1784  ferrous iron transport protein B  46.29 
 
 
764 aa  681    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004103  ferrous iron transport protein B  46.95 
 
 
758 aa  678    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2517  ferrous iron transport protein B  46.95 
 
 
764 aa  675    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.487661  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2711  ferrous iron transporter B  46.51 
 
 
751 aa  676    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2584  ferrous iron transporter B  46.25 
 
 
751 aa  677    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1481  ferrous iron transport protein B  45.96 
 
 
764 aa  677    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.725722  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  47.4 
 
 
778 aa  730    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0169  ferrous iron transport protein B  53.88 
 
 
778 aa  807    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  56.55 
 
 
770 aa  835    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0239  ferrous iron transport protein B  46.61 
 
 
816 aa  716    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2759  ferrous iron transport protein B  45.9 
 
 
764 aa  681    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383541  hitchhiker  0.00159456 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  57.09 
 
 
786 aa  853    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3122  ferrous iron transport protein B  47.07 
 
 
764 aa  669    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000440223 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1595  ferrous iron transport protein B  46.03 
 
 
764 aa  683    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000195581  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  100 
 
 
783 aa  1579    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  45.63 
 
 
766 aa  648    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2414  ferrous iron transport protein B  45.44 
 
 
772 aa  667    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331306  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2690  ferrous iron transport protein B  47.46 
 
 
764 aa  681    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.878145  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1618  ferrous iron transport protein B  45.9 
 
 
764 aa  681    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00477082  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  55.06 
 
 
776 aa  854    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2258  ferrous iron transport protein FeoB  46.54 
 
 
758 aa  687    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.694686  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2504  ferrous iron transport protein B  46.43 
 
 
764 aa  676    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112841  hitchhiker  0.00221536 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2572  ferrous iron transport protein B  46.56 
 
 
764 aa  679    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148151  normal  0.0102392 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2616  ferrous iron transport protein B  44.46 
 
 
770 aa  658    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  55.28 
 
 
774 aa  848    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  45.63 
 
 
766 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22730  ferrous iron transport protein B  52.79 
 
 
778 aa  781    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524583  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  62.94 
 
 
786 aa  997    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2670  ferrous iron transport protein B  46.3 
 
 
764 aa  676    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.360786  normal  0.0737302 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1584  ferrous iron transport protein B  45.9 
 
 
764 aa  682    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000129381  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0321  ferrous iron transport protein B  60.66 
 
 
751 aa  907    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.397467  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1215  ferrous iron transport protein B  47.46 
 
 
764 aa  664    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1532  ferrous iron transport protein B  47.72 
 
 
764 aa  664    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1664  ferrous iron transport protein B  45.41 
 
 
758 aa  686    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1959  ferrous iron transport protein B  46.37 
 
 
816 aa  713    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  56.95 
 
 
770 aa  844    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1841  ferrous iron transport protein B  44.65 
 
 
769 aa  626  1e-178  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.547404  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3822  ferrous iron transport protein B  45.92 
 
 
772 aa  625  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.848053  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03261  ferrous iron transport protein B  45.08 
 
 
773 aa  619  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.313443  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3746  ferrous iron transport protein B  46.45 
 
 
771 aa  621  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3790  ferrous iron transport protein B  45.08 
 
 
773 aa  619  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3690  ferrous iron transport protein B  45.08 
 
 
773 aa  619  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03213  hypothetical protein  45.08 
 
 
773 aa  619  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.267012  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3813  ferrous iron transport protein B  45.02 
 
 
772 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0304  ferrous iron transport protein B  45.08 
 
 
773 aa  618  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3707  ferrous iron transport protein B  45.02 
 
 
772 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3704  ferrous iron transport protein B  45.02 
 
 
772 aa  616  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3985  ferrous iron transport protein B  46.52 
 
 
771 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3884  ferrous iron transport protein B  44.95 
 
 
773 aa  618  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0168  ferrous iron transport protein B  46.32 
 
 
771 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4716  ferrous iron transport protein B  44.95 
 
 
773 aa  618  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3779  ferrous iron transport protein B  45.02 
 
 
772 aa  618  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3606  ferrous iron transport protein B  44.95 
 
 
773 aa  618  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0304  ferrous iron transport protein B  44.95 
 
 
773 aa  618  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0656913 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4629  ferrous iron transport protein B  46.1 
 
 
771 aa  613  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3875  ferrous iron transport protein B  44.3 
 
 
772 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551384  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0648  ferrous iron transport protein B  40.94 
 
 
727 aa  559  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2152  ferrous iron transport protein B  40.1 
 
 
782 aa  557  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.264076  hitchhiker  0.0000442692 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2524  ferrous iron transport protein B  40.26 
 
 
766 aa  556  1e-157  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  39.65 
 
 
680 aa  523  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  38.74 
 
 
743 aa  509  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  38.93 
 
 
728 aa  505  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  37.2 
 
 
741 aa  499  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  39.73 
 
 
680 aa  496  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  38.1 
 
 
747 aa  492  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  38.42 
 
 
740 aa  490  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  38.56 
 
 
738 aa  489  1e-136  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  37.53 
 
 
713 aa  486  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  38.35 
 
 
740 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  38.93 
 
 
741 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  38.81 
 
 
676 aa  480  1e-134  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  39.21 
 
 
676 aa  477  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  38.92 
 
 
688 aa  478  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  36.65 
 
 
669 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  38.94 
 
 
753 aa  473  1e-132  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  36.02 
 
 
669 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  34.94 
 
 
697 aa  466  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  36.83 
 
 
666 aa  462  9.999999999999999e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  37.91 
 
 
631 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  38.02 
 
 
666 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  37.32 
 
 
714 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  36.65 
 
 
715 aa  444  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3383  ferrous iron transport protein B  45.42 
 
 
683 aa  443  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.378196 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  36.56 
 
 
662 aa  438  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  36.13 
 
 
631 aa  438  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  35.39 
 
 
716 aa  436  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  36.95 
 
 
669 aa  434  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  35.69 
 
 
721 aa  435  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  40.64 
 
 
662 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  40.47 
 
 
662 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  40.47 
 
 
662 aa  431  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  34.82 
 
 
668 aa  431  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  36.13 
 
 
662 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  40.47 
 
 
662 aa  431  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  40.3 
 
 
662 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  40.47 
 
 
662 aa  428  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  40.3 
 
 
662 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20050  ferrous iron transporter FeoB  34.38 
 
 
749 aa  426  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.558981  normal  0.661098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>