More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0646 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1553  small GTP-binding protein  44.59 
 
 		 822 aa  747    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00130117  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0646  small GTP-binding protein  100 
 
 		 826 aa  1674    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2493  ferrous iron transport protein B  37.61 
 
 		 743 aa  488  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0675  ferrous iron transport protein B  36.09 
 
 		 732 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.183925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0316  ferrous iron transport protein B  36.42 
 
 		 725 aa  464  1e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000873753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1622  ferrous iron transport protein B  35.31 
 
 		 722 aa  426  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.782227  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1585  ferrous iron transport protein B  33.46 
 
 		 723 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0104102  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  39.69 
 
 		 720 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1015  ferrous iron transport protein B  40.49 
 
 		 759 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.913336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0012  ferrous iron transport protein B  33.54 
 
 		 717 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00299021  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  33.21 
 
 		 844 aa  401  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2669  ferrous iron transport protein B  39.22 
 
 		 725 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  40.93 
 
 		 680 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  39.35 
 
 		 680 aa  392  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  34.83 
 
 		 712 aa  388  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  32.62 
 
 		 724 aa  383  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  33.81 
 
 		 712 aa  382  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2063  ferrous iron transport protein B  36.48 
 
 		 944 aa  367  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000695789  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  38.69 
 
 		 666 aa  367  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  31.52 
 
 		 713 aa  365  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  39.12 
 
 		 688 aa  366  1e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  38.41 
 
 		 676 aa  360  8e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  32.98 
 
 		 712 aa  357  5e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  31.49 
 
 		 829 aa  357  5e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2213  ferrous iron transport protein B  31.56 
 
 		 713 aa  357  6.999999999999999e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1929  ferrous iron transport protein B  33.11 
 
 		 712 aa  355  2.9999999999999997e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000762105  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  37.89 
 
 		 740 aa  350  8e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  38.25 
 
 		 740 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  34.1 
 
 		 669 aa  348  2e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  34.58 
 
 		 669 aa  348  3e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  38 
 
 		 741 aa  347  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  38.18 
 
 		 738 aa  347  7e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  31.4 
 
 		 753 aa  345  2.9999999999999997e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  39.31 
 
 		 676 aa  343  5.999999999999999e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  37.05 
 
 		 711 aa  343  7e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  38.76 
 
 		 666 aa  343  7e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  33.83 
 
 		 776 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  36.69 
 
 		 778 aa  341  2.9999999999999998e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  36.82 
 
 		 743 aa  340  9e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  40.11 
 
 		 770 aa  338  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  37.12 
 
 		 741 aa  337  7.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  37.55 
 
 		 786 aa  335  1e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  36.47 
 
 		 728 aa  335  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  40.11 
 
 		 770 aa  334  4e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  35.17 
 
 		 712 aa  331  3e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  37.09 
 
 		 747 aa  330  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  38.08 
 
 		 786 aa  328  4.0000000000000003e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  34.26 
 
 		 783 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22730  ferrous iron transport protein B  39.15 
 
 		 778 aa  326  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524583  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  35.29 
 
 		 665 aa  324  4e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  36.65 
 
 		 669 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2698  ferrous iron transport protein B  30.68 
 
 		 780 aa  321  3e-86  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.619661  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  37.11 
 
 		 665 aa  320  9e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  36.43 
 
 		 668 aa  319  1e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  36.19 
 
 		 774 aa  317  8e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20050  ferrous iron transporter FeoB  35.53 
 
 		 749 aa  315  1.9999999999999998e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.558981  normal  0.661098 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  34.91 
 
 		 774 aa  315  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  34.05 
 
 		 753 aa  313  9e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  32.66 
 
 		 664 aa  311  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  32.66 
 
 		 664 aa  311  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  34 
 
 		 662 aa  310  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  34 
 
 		 662 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  34 
 
 		 662 aa  309  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  34 
 
 		 662 aa  309  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  34 
 
 		 662 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  34 
 
 		 662 aa  309  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  34.67 
 
 		 716 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  34.05 
 
 		 662 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  34.72 
 
 		 691 aa  309  2.0000000000000002e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  33.63 
 
 		 662 aa  307  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  34.47 
 
 		 662 aa  307  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2152  ferrous iron transport protein B  35.82 
 
 		 782 aa  306  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.264076  hitchhiker  0.0000442692 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2524  ferrous iron transport protein B  35.82 
 
 		 766 aa  306  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  34.09 
 
 		 697 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1729  ferrous iron transport protein B  34.47 
 
 		 717 aa  305  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0580785 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  33.09 
 
 		 662 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  36.17 
 
 		 712 aa  304  4.0000000000000003e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0169  ferrous iron transport protein B  34.12 
 
 		 778 aa  303  6.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  34.24 
 
 		 715 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  33.33 
 
 		 662 aa  301  3e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  34.67 
 
 		 766 aa  300  6e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  34.05 
 
 		 721 aa  298  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  32.18 
 
 		 631 aa  297  5e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  36.2 
 
 		 649 aa  295  2e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  33.82 
 
 		 665 aa  295  3e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16120  ferrous iron transporter FeoB  34.12 
 
 		 785 aa  295  3e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000453744 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0286  Fe2+ transport system protein B  34.16 
 
 		 704 aa  295  3e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  34.49 
 
 		 766 aa  294  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1973  ferrous iron transport protein B  26.87 
 
 		 718 aa  294  6e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  32.84 
 
 		 669 aa  293  8e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1959  ferrous iron transport protein B  32.87 
 
 		 816 aa  292  2e-77  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  31.47 
 
 		 631 aa  291  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  32.48 
 
 		 667 aa  291  3e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0321  ferrous iron transport protein B  30.46 
 
 		 751 aa  291  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.397467  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0871  ferrous iron transport protein B  35.79 
 
 		 716 aa  291  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  32.07 
 
 		 662 aa  290  6e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  31.81 
 
 		 664 aa  289  1e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0239  ferrous iron transport protein B  32.93 
 
 		 816 aa  289  1e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  34.18 
 
 		 848 aa  287  5.999999999999999e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  34.85 
 
 		 664 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>