More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2063 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2063  ferrous iron transport protein B  100 
 
 
944 aa  1917    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000695789  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1553  small GTP-binding protein  34.35 
 
 
822 aa  538  1e-151  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00130117  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0646  small GTP-binding protein  36.48 
 
 
826 aa  383  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1585  ferrous iron transport protein B  34.23 
 
 
723 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0104102  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  37.26 
 
 
680 aa  375  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  33.7 
 
 
743 aa  345  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  32.45 
 
 
741 aa  333  7.000000000000001e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  32.6 
 
 
738 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  34.3 
 
 
669 aa  320  6e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  32.35 
 
 
728 aa  317  6e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  31.64 
 
 
713 aa  313  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  34.78 
 
 
665 aa  308  4.0000000000000004e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20050  ferrous iron transporter FeoB  33.12 
 
 
749 aa  302  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.558981  normal  0.661098 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  30.96 
 
 
778 aa  290  8e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  31.82 
 
 
662 aa  287  7e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  31.82 
 
 
662 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  31.98 
 
 
662 aa  285  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  31.06 
 
 
662 aa  282  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  31.49 
 
 
662 aa  278  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  31.51 
 
 
776 aa  277  8e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  31.33 
 
 
662 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  31.33 
 
 
662 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  31.49 
 
 
662 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  31.33 
 
 
662 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  30.73 
 
 
848 aa  275  3e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  31.17 
 
 
662 aa  275  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  29.48 
 
 
784 aa  272  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  30.23 
 
 
666 aa  267  7e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  31.4 
 
 
770 aa  261  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  29.25 
 
 
662 aa  261  6e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1015  ferrous iron transport protein B  42.41 
 
 
759 aa  257  9e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.913336 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2669  ferrous iron transport protein B  42.11 
 
 
725 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0675  ferrous iron transport protein B  42.4 
 
 
732 aa  251  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.183925  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0316  ferrous iron transport protein B  41.49 
 
 
725 aa  244  7e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000873753  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  29.97 
 
 
786 aa  242  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0894  ferrous iron transport protein B  28.35 
 
 
741 aa  241  4e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.828262 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1404  GTP-binding protein, HSR1-related  26.77 
 
 
716 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000264351  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  30.26 
 
 
774 aa  235  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  30.16 
 
 
770 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0735  ferrous iron transport protein B  29.64 
 
 
648 aa  235  4.0000000000000004e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.56734  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0012  ferrous iron transport protein B  39.45 
 
 
717 aa  234  5e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00299021  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  30.48 
 
 
783 aa  232  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  40.14 
 
 
720 aa  229  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1622  ferrous iron transport protein B  40.56 
 
 
722 aa  225  4e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.782227  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  28.35 
 
 
664 aa  211  7e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  28.35 
 
 
664 aa  211  7e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2258  ferrous iron transport protein FeoB  26.46 
 
 
758 aa  210  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.694686  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  40.83 
 
 
688 aa  210  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3985  ferrous iron transport protein B  27.73 
 
 
771 aa  209  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3746  ferrous iron transport protein B  27.94 
 
 
771 aa  209  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0168  ferrous iron transport protein B  27.73 
 
 
771 aa  209  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.426324  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3822  ferrous iron transport protein B  27.56 
 
 
772 aa  209  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.848053  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0761  GTP-binding protein HSR1-related  28.08 
 
 
720 aa  206  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0972395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  34.11 
 
 
747 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2467  ferrous iron transport protein B  27.5 
 
 
657 aa  203  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000331593  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2444  ferrous iron transport protein B  27.38 
 
 
663 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158903  normal  0.791554 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2493  ferrous iron transport protein B  36.9 
 
 
743 aa  202  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9646  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0286  Fe2+ transport system protein B  43.22 
 
 
704 aa  202  3e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  36.45 
 
 
741 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  41.64 
 
 
665 aa  199  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0571  ferrous iron transport protein B  36.07 
 
 
845 aa  196  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237546  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  34.93 
 
 
680 aa  196  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3779  ferrous iron transport protein B  27.32 
 
 
772 aa  195  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3813  ferrous iron transport protein B  27.32 
 
 
772 aa  195  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3707  ferrous iron transport protein B  27.32 
 
 
772 aa  195  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3704  ferrous iron transport protein B  27.32 
 
 
772 aa  194  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  40.14 
 
 
669 aa  193  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3875  ferrous iron transport protein B  27.39 
 
 
772 aa  191  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551384  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  40.74 
 
 
666 aa  191  5e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  37.54 
 
 
740 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  36.91 
 
 
740 aa  187  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  36.08 
 
 
669 aa  185  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  39.57 
 
 
715 aa  185  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0260  ferrous iron transport protein B  35 
 
 
647 aa  183  1e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  43.64 
 
 
711 aa  183  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  33.82 
 
 
697 aa  183  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  40.87 
 
 
676 aa  183  2e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3546  Ferrous iron transport protein B domain protein  34.69 
 
 
574 aa  182  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0975  ferrous iron transport protein B  34.64 
 
 
647 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  42.97 
 
 
716 aa  182  4e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  33.65 
 
 
676 aa  181  4.999999999999999e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0555  ferrous iron transport B domain-containing protein  34.66 
 
 
577 aa  179  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  36.82 
 
 
753 aa  179  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  37.46 
 
 
714 aa  179  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  35.61 
 
 
691 aa  179  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0976  ferrous iron transport protein B  45.45 
 
 
676 aa  179  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00114707  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  44.72 
 
 
631 aa  178  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  41.63 
 
 
724 aa  178  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  33.93 
 
 
647 aa  177  6e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  35.92 
 
 
712 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  42.27 
 
 
631 aa  177  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  41.89 
 
 
721 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  36.77 
 
 
712 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  34.63 
 
 
646 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  34.91 
 
 
712 aa  174  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  33.58 
 
 
844 aa  174  7.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2698  ferrous iron transport protein B  34.84 
 
 
780 aa  173  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.619661  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  41.7 
 
 
712 aa  173  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  34.83 
 
 
668 aa  172  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1583  ferrous iron transport protein B  34.62 
 
 
698 aa  172  3e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.983768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>