More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1404 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1009  ferrous iron transport protein B  56.28 
 
 		 707 aa  786    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0206507  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1404  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 716 aa  1463    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000264351  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0761  GTP-binding protein HSR1-related  47.85 
 
 		 720 aa  622  1e-176  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0972395  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1043  ferrous iron transport protein B  47.4 
 
 		 725 aa  614  9.999999999999999e-175  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262992 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02700  Ferrous iron transport protein FeoB  63.88 
 
 		 469 aa  580  1e-164  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2720  ferrous iron transport B domain-containing protein  62.44 
 
 		 463 aa  567  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3839  Ferrous iron transport B domain protein  59.82 
 
 		 462 aa  549  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1539  nucleoside recognition proteinn  61.1 
 
 		 464 aa  538  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3771  Ferrous iron transport B domain protein  59.45 
 
 		 465 aa  535  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1405  nucleoside recognition  58.06 
 
 		 463 aa  532  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1973  Ferrous iron transport B domain protein  55.13 
 
 		 464 aa  527  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.279314  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2274  Ferrous iron transport B domain protein  51.72 
 
 		 464 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0600  ferrous iron transport B domain-containing protein  52.6 
 
 		 466 aa  486  1e-136  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0628  ferrous iron transport B domain-containing protein  51.69 
 
 		 466 aa  485  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0678  ferrous iron transport protein B  52.13 
 
 		 466 aa  485  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0877109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0622  ferrous iron transport protein B, C-terminal region  52.13 
 
 		 466 aa  485  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000193657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4590  ferrous iron transport protein B  51.69 
 
 		 466 aa  485  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0622  ferrous iron transport protein B, C-terminal region  52.36 
 
 		 466 aa  485  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00607756  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0767  ferrous iron transport protein B  52.13 
 
 		 466 aa  485  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000322668 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1266  GTP-binding protein, HSR1-related  38.85 
 
 		 689 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4510  ferrous iron transport B domain-containing protein  51.54 
 
 		 464 aa  449  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.448654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  33.71 
 
 		 680 aa  362  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  31.15 
 
 		 680 aa  352  1e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  31.32 
 
 		 676 aa  346  8e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  32.16 
 
 		 688 aa  340  5e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  32.1 
 
 		 669 aa  332  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  31.59 
 
 		 666 aa  329  8e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  31.81 
 
 		 669 aa  329  9e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  32.42 
 
 		 666 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  33.38 
 
 		 664 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  32.67 
 
 		 665 aa  327  5e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  30.68 
 
 		 665 aa  327  6e-88  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  30.96 
 
 		 668 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  29.87 
 
 		 664 aa  314  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  29.87 
 
 		 664 aa  314  2.9999999999999996e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  31.6 
 
 		 676 aa  310  4e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  31.62 
 
 		 665 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  31.03 
 
 		 662 aa  308  3e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1585  ferrous iron transport protein B  30.63 
 
 		 723 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0104102  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0675  ferrous iron transport protein B  30.03 
 
 		 732 aa  306  7e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.183925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  31.05 
 
 		 662 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1739  ferrous iron transport protein B  29.29 
 
 		 646 aa  301  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00069018  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  30.58 
 
 		 662 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  30.12 
 
 		 669 aa  301  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1569  ferrous iron transport protein B  31.27 
 
 		 659 aa  300  5e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000694144  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  30.87 
 
 		 662 aa  300  6e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  29.83 
 
 		 667 aa  300  6e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  31.1 
 
 		 720 aa  300  7e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  29.29 
 
 		 697 aa  299  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  31.59 
 
 		 631 aa  299  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  30.44 
 
 		 662 aa  299  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3838  small GTP-binding protein  60.66 
 
 		 262 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0012  ferrous iron transport protein B  29.99 
 
 		 717 aa  298  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00299021  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  30.73 
 
 		 662 aa  298  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  30.63 
 
 		 662 aa  298  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0543  ferrous iron transport protein B  30.16 
 
 		 669 aa  298  3e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00422143  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2669  ferrous iron transport protein B  28.4 
 
 		 725 aa  298  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  30.63 
 
 		 662 aa  297  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  30.63 
 
 		 662 aa  297  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  30.44 
 
 		 662 aa  296  6e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  30.4 
 
 		 662 aa  296  7e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0260  ferrous iron transport protein B  30.27 
 
 		 647 aa  296  9e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  28.11 
 
 		 844 aa  296  1e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2719  GTP-binding protein, HSR1-related  58.44 
 
 		 261 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0076047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  30.48 
 
 		 662 aa  295  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  30.69 
 
 		 716 aa  294  5e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0975  ferrous iron transport protein B  30.22 
 
 		 647 aa  293  8e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  30.06 
 
 		 715 aa  293  9e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  29.93 
 
 		 647 aa  292  2e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  28.28 
 
 		 713 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  31 
 
 		 664 aa  291  3e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  28.32 
 
 		 743 aa  291  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  28.67 
 
 		 741 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3772  GTP-binding protein HSR1-related  58.26 
 
 		 271 aa  289  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  32.97 
 
 		 783 aa  289  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  32.08 
 
 		 778 aa  288  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  29.25 
 
 		 741 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0976  ferrous iron transport protein B  32.29 
 
 		 676 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00114707  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  28.67 
 
 		 712 aa  288  4e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  30.54 
 
 		 649 aa  287  5e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0259  ferrous iron transport protein B  30.45 
 
 		 628 aa  286  9e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00038951  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  28.42 
 
 		 738 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  27.73 
 
 		 747 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  30.73 
 
 		 691 aa  285  2.0000000000000002e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  28.82 
 
 		 740 aa  284  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0735  ferrous iron transport protein B  29.87 
 
 		 648 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.56734  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  31.57 
 
 		 646 aa  284  5.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  32.25 
 
 		 724 aa  281  3e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  28.42 
 
 		 740 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0198  ferrous iron transport protein B  29.77 
 
 		 645 aa  276  8e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  29.62 
 
 		 721 aa  276  8e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1622  ferrous iron transport protein B  29.89 
 
 		 722 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.782227  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1713  ferrous iron transport protein B  29.33 
 
 		 645 aa  274  3e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.340113  normal  0.969498 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  28.51 
 
 		 712 aa  274  5.000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  29.42 
 
 		 631 aa  273  9e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0169  ferrous iron transport protein B  32.97 
 
 		 778 aa  272  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1761  ferrous iron transport protein B  27.78 
 
 		 711 aa  272  2e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0316  ferrous iron transport protein B  32.97 
 
 		 725 aa  271  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000873753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  33.08 
 
 		 786 aa  271  4e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  28.51 
 
 		 712 aa  270  5e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>